| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP043523 | 1317022 = | 456 (0.860) | coding (113/684 nt) | FTN78_chr1339 | O‑methyltransferase family protein | |||||
Only 100 of 968 total aligned reads displayed.
GCCATTATGAGAGCCGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTC > CP043523/1316875‑1317169 | ctcaattaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCa < 1:3450914‑M2/3‑1 (MQ=255) ctcaattaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCa > 2:4287442‑M2/146‑148 (MQ=255) ctcaattaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCa < 1:1596171‑M2/3‑1 (MQ=255) aTTATGAGAGCCGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCaa < 2:4467127/148‑1 (MQ=255) tATGAGAGCCGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGt < 2:1348594/148‑1 (MQ=255) attaaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGtt > 1:3013805‑M2/142‑148 (MQ=255) taaggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTtct > 2:655564‑M2/140‑148 (MQ=255) aggagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTcc > 2:2185971‑M2/138‑148 (MQ=255) gagacaatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCgg < 1:4572443‑M2/13‑1 (MQ=255) gCCGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCgg < 1:1994536/148‑1 (MQ=255) ccGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTTTCTTCATCAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGt > 2:2869487/1‑148 (MQ=255) ccGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGTCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGt > 2:3054608/1‑148 (MQ=255) cGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGtt < 2:4353860/148‑1 (MQ=255) caatacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTAt > 2:2130137‑M2/132‑148 (MQ=255) tacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTtg < 2:3380528‑M2/20‑1 (MQ=255) tacctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTtg < 2:1116098‑M2/20‑1 (MQ=255) ctgtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTgtgt > 1:4321968‑M2/126‑148 (MQ=255) gtcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGttt > 2:517949‑M2/124‑148 (MQ=255) tcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTg < 1:3960455‑M2/26‑1 (MQ=255) tcactcaaaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTg < 1:1059868‑M2/26‑1 (MQ=255) gCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGAc < 1:4672068/148‑1 (MQ=255) tCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGaa > 1:2419898/1‑148 (MQ=255) aaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGaa < 1:319360‑M2/33‑1 (MQ=255) aaatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGaa < 1:3866318‑M2/33‑1 (MQ=255) aatttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAAc > 1:802705‑M2/115‑148 (MQ=255) atttctcaactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACg > 2:2361061‑M2/114‑148 (MQ=255) ttCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATc < 2:1275336/148‑1 (MQ=255) gagaATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCAt > 2:4235631/1‑148 (MQ=255) aactcttcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCAt < 2:4651867‑M2/42‑1 (MQ=255) gaATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTc > 2:3561648/1‑148 (MQ=255) aaTTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTct > 1:128072/1‑148 (MQ=255) aTTCTTTTTTGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTcta < 2:1428796/148‑1 (MQ=255) tcaatgctaaccgaggtatctatggtgctcctaagattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacggaagctaatcaaGCAAGTTCTGCGCATATTTGTGTTTGACTTGTACGCACCCATTctact > 2:1018690‑M2/101‑148 (MQ=255) tcaatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTctact > 1:608632‑M2/101‑148 (MQ=255) tttttGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTaa > 1:2335484/1‑148 (MQ=255) aatgctaaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTaa < 2:163234‑M2/50‑1 (MQ=255) aaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTctacta < 1:1457325‑M2/49‑1 (MQ=255) aaccgaggaatctatggtgctcctaaaattcatcatcttctacttaaacaaggggaaaaagtcgggttaaaactggtacagaagctaatgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGc > 2:361794‑M2/93‑148 (MQ=255) 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tCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATg > 2:1876072/1‑148 (MQ=255) tttAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGa < 2:1213376/148‑1 (MQ=255) aGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCGTTTTTAAAGATGGACTc > 1:4498960/1‑148 (MQ=255) gCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTcc < 1:4153621/148‑1 (MQ=255) aaTTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCttt < 2:4181611/148‑1 (MQ=255) 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cTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAAt < 1:3534062/148‑1 (MQ=255) tgaaGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAAtt < 2:2462970‑M2/144‑1 (MQ=255) | GCCATTATGAGAGCCGAAAAACCAATTGCTGTTCCGATTTCGAGAATTCTTTTTGGCTGCAACAAACTCAACAACATTTGAAAATAAATAACTGTCTCATGTGGGATAACTGGAATATTATTTTCTTTAGCAAATTTCAGTACTTCTGCAAGTTCTCCGGTTATTTGTGTTTGACTTGAACGCATCCATTCTACTAACTCTGCTTTGACAACTGGTCGATTCATCATGGGGTTACTTGTACGTTTATATGTTTCAACCATTTTTAAAGATGGACTCCTTTTTCAACTAATTTTTC > CP043523/1316875‑1317169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |