| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP043523 | 1706850 = | 631 (1.190) | 677 (1.270) | 247/294 | 0.0 | 51.8% | coding (764/2244 nt) | FTN78_chr1739 | Ribonucleotide reductase of class III (anaerobic), large subunit |
| ? | CP043523 | = 1771382 | NA (NA) | coding (809/825 nt) | FTN78_chr1808 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 578 total aligned reads displayed.
AGGTGTTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAGTTAATTGTTGGTCACTTTCTAAGTAACTTTTTAACCATATTTTTACATTTGCTTGACTTGCTTTTAACACTTCTTTTGGAAGTAACGTTTGATGCTTTTCCAAAAGATAAA > CP043523/1771239‑1771529 | aGGTGTTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑Gttt > 1:4640351/1‑148 (MQ=11)aGGTGTTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑Gttt < 2:1059633/148‑1 (MQ=11) gtgtTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATCCTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCATGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTAt > 1:2635464/1‑148 (MQ=17) gtgtTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTAt > 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tttGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCtt > 1:2463913/1‑148 (MQ=39) gCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTaa < 1:3197462/148‑1 (MQ=255) ctctGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAAt < 1:532518/148‑1 (MQ=255) ctctGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAAt < 2:2395482/148‑1 (MQ=255) tctGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAAtt > 1:2539045/1‑148 (MQ=255) tctGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAAtt < 1:1802386/148‑1 (MQ=255) ctGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTTAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAAttt > 1:3547475/1‑148 (MQ=255) gCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTa > 1:4371248/1‑148 (MQ=255) gCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTa > 1:1459456/1‑148 (MQ=255) cTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTaa > 2:4680543/1‑148 (MQ=255) 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aTAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAg > 1:3440257/1‑148 (MQ=255) aGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAGtt > 2:264271/1‑148 (MQ=255) cTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGATTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAGTTAAt > 2:3444790/1‑148 (MQ=255) cTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAGTTAAt > 1:3664311/1‑148 (MQ=255) cTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAGTTAAt > 2:2113553/1‑148 (MQ=255) 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g‑gTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAGTTAATTGTTGGTCACTTTCTAAGTAACTTTTTAACCATATTTTTACATTTGCTTGACTTGCTTTTAACACTTCTTTTGGAAGTAACGTTTGATGCTTTTCCAAAAGATaaa < 2:1711889/148‑1 (MQ=255) | AGGTGTTTCCCTTTGCTCTGGCTTGTGATAGAATAGTCTTGCATCTGAATTTCCTTTTTATACTATTTGGTCGAACTTCTAGTATAAGAGATTCAGATGTTTTTTGCTTGACTCAAGGTGGCTAACTTCATTTTACAATTTGCG‑GTTTATCTTTTTCTTTAATTTTTAAAATATTTTCAGTTAATTGTTGGTCACTTTCTAAGTAACTTTTTAACCATATTTTTACATTTGCTTGACTTGCTTTTAACACTTCTTTTGGAAGTAACGTTTGATGCTTTTCCAAAAGATAAA > CP043523/1771239‑1771529 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |