Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | CP043523 | 1848606 | 1848778 | 173 | 344 [338] | [342] 346 | FTN78_chr1898/FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
GTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAA > CP043523/1848458‑1848686 | gTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTcc < 1:2933419/148‑1 (MQ=255) gTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTcc > 1:4172901/1‑148 (MQ=255) ggACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑a < 1:455875/148‑1 (MQ=255) ggACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑a > 1:4074544/1‑148 (MQ=255) gACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑At < 1:1790399/148‑1 (MQ=255) gACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑At < 1:2398439/148‑1 (MQ=255) aCCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑Att > 1:1203810/1‑147 (MQ=255) aCCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑Att < 2:428425/148‑2 (MQ=255) ccTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑Attc < 1:1654363/148‑3 (MQ=255) cTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑Attca > 1:267997/1‑145 (MQ=255) cTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑Attca > 2:2420339/1‑145 (MQ=255) tCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCAt < 1:1904463/148‑1 (MQ=255) aaGCAGTCAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATaa < 2:1770438/148‑1 (MQ=255) aGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATaaa < 1:3903335/148‑1 (MQ=255) gCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAAt < 1:4019664/148‑1 (MQ=255) gCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAAt > 1:3038062/1‑148 (MQ=255) gTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAg < 1:1984663/148‑1 (MQ=255) gTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAg < 1:3554169/148‑1 (MQ=255) gTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGCTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAg < 2:3915442/148‑1 (MQ=255) ttAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAgg < 1:4249285/148‑1 (MQ=255) tatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAggggca > 1:3617317/1‑145 (MQ=255) tatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAggggca > 1:344400/1‑145 (MQ=37) tatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCa > 1:1576309/1‑148 (MQ=255) atCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAGATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAc > 2:4599614/1‑148 (MQ=37) tCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAct > 1:3747469/1‑148 (MQ=37) tCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAct < 2:2326119/148‑1 (MQ=255) cacaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCActt < 1:3056536/148‑2 (MQ=38) cacaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATAAGGGGCagtt > 1:3171466/1‑145 (MQ=37) acaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCActtt > 2:1595811/1‑146 (MQ=37) caAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGACAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAAGTAGGGGCACTTTa > 2:3438940/1‑148 (MQ=25) aaaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTaa < 2:1990093/148‑1 (MQ=37) aaaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTaa > 2:2181188/1‑148 (MQ=38) aaaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTaa < 1:2072323/148‑1 (MQ=38) aaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAata > 2:2289175/1‑148 (MQ=38) gCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAtata > 2:2846813/1‑148 (MQ=38) gCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAtata < 2:337502/148‑1 (MQ=38) cATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGTTATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACACACACTTCCCTTTGCGTAAATTAGGGCCActcttttata < 1:1085131/148‑7 (MQ=17) aTAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATaga < 1:5647/148‑1 (MQ=38) aTAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATaga < 2:2369934/148‑1 (MQ=38) aTAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATaga > 1:1424148/1‑148 (MQ=38) aTAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATaga < 1:2599245/148‑1 (MQ=38) tAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATagag < 1:3367607/148‑1 (MQ=38) aTTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTg < 1:3835312/148‑1 (MQ=38) ttGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTgg > 1:1342409/1‑148 (MQ=38) ttGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTgg < 2:3549852/148‑1 (MQ=38) tATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttt > 1:3502589/1‑148 (MQ=38) tATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttt < 1:2440524/148‑1 (MQ=38) aTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtttt > 1:3525030/1‑148 (MQ=38) aTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGCTTTTTTATATTCAGTTGCAATTAGGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGAGGCCCTTTAATATAGAGCGGtttc > 1:4619461/1‑147 (MQ=37) tCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttttt < 1:1018993/148‑1 (MQ=38) tCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttttt < 2:3694450/148‑1 (MQ=38) tCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttttt < 2:1041777/148‑1 (MQ=38) aaaaTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTaa < 1:2837957/148‑1 (MQ=38) aaaaTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTaa < 2:184379/148‑1 (MQ=38) aaaTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAAt > 2:755883/1‑148 (MQ=38) aaaTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAAt > 2:687607/1‑148 (MQ=38) aaTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATg < 1:4423595/148‑1 (MQ=38) aTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGt < 2:1357898/148‑1 (MQ=37) aTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGt < 2:3280420/148‑1 (MQ=38) tCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATTTTCATTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGTGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGtt > 2:252089/1‑148 (MQ=37) tCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGtt < 1:4007286/148‑1 (MQ=38) tCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGtt < 2:3835667/148‑1 (MQ=38) tCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGtt < 2:1700352/148‑1 (MQ=38) cGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGttt < 1:2514677/148‑1 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTtta < 2:57433/148‑1 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTtta > 2:3757855/1‑148 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTtta < 1:902585/148‑1 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTtta < 2:2879696/148‑1 (MQ=37) tGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGGTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGtttgg < 2:3575853/148‑3 (MQ=38) gCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATGCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatt < 2:3344408/148‑1 (MQ=37) cAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatta < 2:4388048/148‑1 (MQ=38) cAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatta < 2:244133/148‑1 (MQ=38) aaaaACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaa < 1:82244/148‑1 (MQ=38) aaaacTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaat < 1:676837/144‑1 (MQ=38) aaacTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaatt < 2:2583068/145‑1 (MQ=37) aaacTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaatt < 2:1897857/145‑1 (MQ=38) aacTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaatta < 1:632730/146‑1 (MQ=38) acTGGAGTCATTATTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGTCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAttaattaa < 2:1399807/147‑1 (MQ=37) acTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAttaattaa > 2:264573/2‑148 (MQ=38) ggAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaat < 1:1981248/148‑1 (MQ=38) ggAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaat > 1:513524/1‑148 (MQ=38) gAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaatt > 2:3149834/1‑148 (MQ=38) gTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaattaa < 2:4544966/148‑1 (MQ=38) gTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaattaa < 2:1507871/148‑1 (MQ=38) tCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAat > 1:528227/1‑148 (MQ=38) cATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATTAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGTGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAata < 2:326665/148‑1 (MQ=37) cATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAata < 2:3052413/148‑1 (MQ=38) aTGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAatat < 1:2255344/148‑1 (MQ=38) aTGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAatat < 2:1259649/148‑1 (MQ=38) tGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATAtt < 2:4689988/148‑1 (MQ=38) aCTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTa < 1:2953898/148‑1 (MQ=255) aCTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTa > 1:3759186/1‑148 (MQ=38) ttCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaa > 1:4408585/1‑148 (MQ=38) cAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaag < 1:2221599/148‑2 (MQ=38) cAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaag > 1:1710680/1‑147 (MQ=38) cAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaag > 2:2767459/1‑147 (MQ=38) tttttATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaagattta > 1:1602963/1‑142 (MQ=38) tttttATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaagattta > 1:4241964/1‑142 (MQ=38) ttttATATTCAGATGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAAAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAGAtttat < 1:1282754/148‑5 (MQ=255) tttATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAGAtttata > 2:4072591/1‑143 (MQ=38) | GTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAA > CP043523/1848458‑1848686 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |