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                                                        ttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGtatgaatata     <  2:2691681/148‑8 (MQ=11)
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                                                          gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaagtt   <  1:2353928/148‑7 (MQ=1)
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                                                           tCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAATCAACTAGCAATTCGGGTAGAAtcaagttt  <  1:4083294/148‑8 (MQ=1)
                                                           tCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaaactat  <  1:882036/148‑8 (MQ=11)
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                                                           tCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTACCAATTCGGGTATAAtaaactat  >  2:1869725/1‑141 (MQ=11)
                                                           tCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTATAAtaaaagcg  >  2:3409334/1‑141 (MQ=255)
                                                                                                                                                   |                                                           
GTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCAAGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTATAATGTAGAAT  >  CP043523/1862075‑1862281

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: