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tAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCa < 2:1139856/148‑1 (MQ=255) aGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCaa < 2:1820493/148‑1 (MQ=255) aaaCGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATGATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAg < 1:581706/148‑1 (MQ=255) aCGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGgc > 1:1084251/1‑148 (MQ=255) cGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAGAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGgcg < 1:4249772/148‑1 (MQ=255) ggggAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGgcgc < 2:458962/148‑1 (MQ=255) gggAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCa > 2:4282715/1‑148 (MQ=255) gaggaTATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAAt > 2:284810/1‑148 (MQ=255) ggaTATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATaa < 2:2579760/148‑1 (MQ=255) gaTATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATaaa > 2:69881/1‑148 (MQ=255) aGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGa < 2:4163163/148‑1 (MQ=255) gACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGaa < 1:3664557/148‑1 (MQ=255) | CAGTAATTTCATTTCTATTCTTAGCCATGAAGCTCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGAA > CP043523/1318915‑1319209 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |