Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP043523 | 1,884,357 | C→G | S13S (TCC→TCG) | FTN78_chr1930 → | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP043523 | 1,884,357 | 0 | C | G | 99.8% | 1522.5 / ‑5.3 | 421 | S13S (TCC→TCG) | FTN78_chr1930 | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (220/199); minor base A (1/0); total (222/199) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 |
Only 100 of 421 total aligned reads displayed.
CATTTTATCAGTTTTAATGTTT‑TTTTTATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACAATGGAACAATTAAAATTAAATCAATACTTTGACTATTCCCTTGAGCCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTT > CP043523/1884226‑1884498 | caagttATCAGTTTTGGTGTTTATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCAcgtcgt < 2:4558256/144‑1 (MQ=255) aagttATCAGTTTTGGTGTTTATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTg < 1:1116751/145‑1 (MQ=255) aagttATCAGTTTTGGTGTTTATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTg < 2:2347095/145‑1 (MQ=255) aagttATCAGTTTTGGTGTTTATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTg < 2:1481403/145‑1 (MQ=255) agttATCAGTTTTGGTGTTTATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGc > 1:3127504/3‑148 (MQ=255) gttATCAGTTTTGGTGTTTATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGcc > 2:132505/2‑148 (MQ=255) ttATCAGTTTTGGTGTTTATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCa > 2:4444084/1‑148 (MQ=255) tATCAGTTTTGGTGTTTATTTCGATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCAt > 1:537937/1‑148 (MQ=255) tatttcgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTc > 2:3512833/8‑148 (MQ=255) tttcgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCaa < 1:1403637/143‑1 (MQ=255) tttcgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCaa > 1:3672458/6‑148 (MQ=255) tcgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGt < 2:890107/145‑1 (MQ=255) tcgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGt > 1:860378/4‑148 (MQ=255) tcgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGt < 1:3055796/145‑1 (MQ=255) cgaTTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTc < 1:1934259/146‑1 (MQ=255) ttGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTaa < 2:2884685/148‑1 (MQ=255) ttttCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCCAGATGTCCAGTCTCATTAt > 2:3562017/1‑148 (MQ=255) ttCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGc > 1:807250/1‑148 (MQ=255) ttCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGc > 1:2365144/1‑148 (MQ=255) ttCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGc < 1:2740559/148‑1 (MQ=255) tCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCt < 2:4035964/148‑1 (MQ=255) cACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCtt < 2:1090772/148‑1 (MQ=255) tctAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCaa > 1:3567629/1‑148 (MQ=255) ctAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAAt > 2:1627263/1‑148 (MQ=255) ctAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAAt > 2:1210301/1‑148 (MQ=255) ctAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAAt > 1:2998994/1‑148 (MQ=255) tAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAAtt < 2:2720058/148‑1 (MQ=255) tAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAAtt > 2:835774/1‑148 (MQ=255) aaGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGACTGc > 2:1940634/1‑148 (MQ=255) aaGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGc > 1:1172722/1‑148 (MQ=255) gATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGt > 2:3958063/1‑148 (MQ=255) gATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGt > 1:385347/1‑148 (MQ=255) gATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGt > 1:2295443/1‑148 (MQ=255) gATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGt < 2:4701465/148‑1 (MQ=255) tataATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTc > 1:4150825/1‑148 (MQ=255) ataataTCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCa > 1:3216522/1‑148 (MQ=255) ataataTCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCa > 2:1845541/1‑148 (MQ=255) taataTCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAg > 2:2073388/1‑148 (MQ=255) taataTCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAg < 1:3785590/148‑1 (MQ=255) atatCAGTAAAACTGATATTGTTGAGTTAGGAGGCACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTGGCTTGAACCACGCCGTGCCATCCTCTTTCACGATGTCAAGTCTAATTATGCTCCAATTGAATGCGATCAGCg > 1:1761717/1‑148 (MQ=255) tatCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGa > 1:2814758/1‑148 (MQ=255) tCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGaaa > 1:216630/1‑148 (MQ=255) tCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGaaa < 1:1923204/148‑1 (MQ=255) cAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAAt > 1:438080/1‑148 (MQ=255) aGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAAtt > 2:3207220/1‑148 (MQ=255) gTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAAttt > 2:3317890/1‑148 (MQ=255) gTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAAttt > 1:162882/1‑148 (MQ=255) tAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTa < 1:4649799/148‑1 (MQ=255) tAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTa > 2:2559104/1‑148 (MQ=255) aaaaCTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTaa > 1:2262525/1‑148 (MQ=255) aaaaCTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTaa < 2:26650/148‑1 (MQ=255) aaaCTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTaaa > 1:4341972/1‑148 (MQ=255) aaCTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAAt > 1:2633326/1‑148 (MQ=255) cTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATcc < 2:4240895/148‑1 (MQ=255) cTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATcc < 2:1784699/148‑1 (MQ=255) cTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATcc < 2:1700022/148‑1 (MQ=255) gATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCctc < 1:1038820/148‑1 (MQ=255) gATATTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCctc < 1:4251097/148‑1 (MQ=255) tatTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTg < 1:1833852/148‑1 (MQ=255) tatTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTg > 2:3128264/1‑148 (MQ=255) atTTTTGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGa < 1:1885975/148‑1 (MQ=255) ttttGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGAcc < 1:1287428/148‑1 (MQ=255) ttttGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGAcc > 1:4116851/1‑148 (MQ=255) tttGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCa < 1:1539087/148‑1 (MQ=255) ttGATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCAc < 1:4523570/148‑1 (MQ=255) gATTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACtt > 2:4383541/1‑148 (MQ=255) aTTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtc < 2:4601931/148‑1 (MQ=255) aTTTAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtc > 2:4116799/1‑148 (MQ=255) ttAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtctc < 2:1558547/148‑1 (MQ=255) ttAGGAGGAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTtctc > 1:349913/1‑148 (MQ=255) aggaggAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCtt < 1:2015405/148‑1 (MQ=255) aggaggAACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCtt < 2:2735802/148‑1 (MQ=255) aggaACTATGGAACAATTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTtgt > 2:3390660/1‑148 (MQ=255) aactatggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTc > 2:1539011/5‑148 (MQ=255) actatggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCa < 1:1488802/145‑1 (MQ=255) ctatggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCAt > 1:2558292/3‑148 (MQ=255) tatggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATg < 1:66276/147‑1 (MQ=255) tggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAg < 2:3742751/148‑1 (MQ=255) tggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAg < 1:611182/148‑1 (MQ=255) ggaacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGt < 2:654668/148‑1 (MQ=255) aacaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCg > 2:2414289/1‑148 (MQ=255) acaatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGa > 2:4497910/1‑148 (MQ=255) caatTAAAATTAAATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAg > 1:2933510/1‑148 (MQ=255) aattaaaattaaATAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGc > 2:730668/1‑148 (MQ=255) attaaaattaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCa > 2:1744493/1‑148 (MQ=255) ttaaaattaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAg > 1:391257/1‑148 (MQ=255) taaaattaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGa > 2:1012272/1‑148 (MQ=255) aaaattaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGAt > 1:2433274/1‑148 (MQ=255) attaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCAt > 1:634016/1‑148 (MQ=255) attaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCAt < 1:132581/148‑1 (MQ=255) attaaaTAAATACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCAt > 2:2635859/1‑148 (MQ=255) taaataaaTACTTTGACTACTCGCTNGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTc > 2:2186625/1‑148 (MQ=255) aataaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTa > 2:522775/5‑148 (MQ=255) ataaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTaa > 1:3398320/4‑148 (MQ=255) ataaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTaa < 1:342712/145‑1 (MQ=255) taaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTaaa < 1:3324787/146‑1 (MQ=255) taaaTACTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTaaa < 1:3739568/146‑1 (MQ=255) cTTTGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTa < 1:4446165/148‑1 (MQ=255) tttGACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTaa > 1:480251/1‑148 (MQ=255) gACTACTCGCTTGAACCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGc > 2:553342/1‑148 (MQ=255) | CATTTTATCAGTTTTAATGTTT‑TTTTTATTGTTTTTCACTCTAAAAAAAGATATAATATCAGTAAAACTGATATTTTTGATTTAGGAGGAACAATGGAACAATTAAAATTAAATCAATACTTTGACTATTCCCTTGAGCCACGTCGTGCCATCCTCTTTCAAGATGTCAAGTCTAATTATGCTTCAATTGAATGCGTTCAGCGAAATTTAAATCCTCTGACCACTTCTCTTTGTGTCATGAGTCGAGCAGATCATTCTAAAGGGTTAACGCTT > CP043523/1884226‑1884498 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |