| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 2,310,414 | T→G | F68L (TTT→TTG) | FTN78_chr2391 → | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 2,310,414 | 0 | T | G | 97.4% | 1604.0 / NA | 463 | F68L (TTT→TTG) | FTN78_chr2391 | UDP‑N‑acetylmuramate‑‑L‑alanine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base G (217/233); minor base A (0/12); total (218/245) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.32e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 466 total aligned reads displayed.
ATTTTACCGGTATTAAAGGTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTTGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTCATGGAAGAT > CP043523/2310269‑2310558 | gTATTAAAGGTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGaaaaaaa > 2:3002402/1‑148 (MQ=255) gTATTAAAGGTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGaaaaaaa > 2:506114/1‑148 (MQ=255) aTTAAAGGTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAata < 1:1906097/148‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTATAAAAAAAAAAAata < 2:1823175/148‑1 (MQ=255) ttAAAGGTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAatat > 2:2376382/1‑148 (MQ=255) tAAAGGTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAACGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATAtt < 1:4291266/148‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGc < 1:321709/148‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGc > 2:3448390/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGAATCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAAATATTAAGccc < 2:1166441/148‑1 (MQ=255) ttCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATAAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTAAACAAGCTGACGTACCACTTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAATATTAAGccc < 2:4086088/148‑1 (MQ=255) aGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGaa > 1:3478496/1‑148 (MQ=255) aGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGaa > 2:1217776/1‑148 (MQ=255) cATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAAttt < 1:1768843/148‑1 (MQ=255) cATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAAttt > 1:3995246/1‑148 (MQ=255) gAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGaa > 1:4699075/1‑148 (MQ=255) cACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAattgat < 2:3610417/148‑1 (MQ=255) ttGCGATAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGc < 2:1263410/148‑1 (MQ=255) tGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCt < 1:4176943/148‑1 (MQ=255) gcTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGa > 1:4642443/1‑148 (MQ=255) cTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGaa < 1:2679775/148‑1 (MQ=255) cTAATGTTAAAACAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGaa < 1:4493821/148‑1 (MQ=255) tAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGaaa > 1:1001992/1‑148 (MQ=255) tAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGaaa < 1:3810907/148‑1 (MQ=255) tGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGc > 2:3575400/1‑148 (MQ=255) tACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCttt < 2:820425/148‑1 (MQ=255) aCATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCtttt < 2:4513986/148‑1 (MQ=255) aCATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCtttt < 2:1902678/148‑1 (MQ=255) aCATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCtttt < 1:522164/148‑1 (MQ=255) aTCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTcg < 1:4400296/148‑1 (MQ=255) aTCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTcg < 1:3352521/148‑1 (MQ=255) tCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTcgc > 2:3332007/1‑148 (MQ=255) aaaTGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCga < 1:814369/148‑1 (MQ=255) aTGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCgatg > 1:2236400/1‑148 (MQ=255) gggAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCgatgat > 2:4171782/1‑148 (MQ=255) gggAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCgatgat > 1:1396858/1‑148 (MQ=255) agaaagTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACaa < 2:1358763/148‑1 (MQ=255) gaaagTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAAt > 1:2374603/1‑148 (MQ=255) aaagTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATg < 1:664918/148‑1 (MQ=255) aaagTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATg < 1:1064957/148‑1 (MQ=255) aaagTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATg < 2:290750/148‑1 (MQ=255) aaagTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATg < 1:1196321/148‑1 (MQ=255) aagTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGt < 1:1963713/148‑1 (MQ=255) agTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGATCAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAGGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGtt < 2:1638609/148‑1 (MQ=255) gTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTg > 1:3766451/1‑148 (MQ=255) ttCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGa > 1:3563964/1‑148 (MQ=255) ttCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGa < 2:4287983/148‑1 (MQ=255) tCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGaa < 1:837188/148‑1 (MQ=255) cAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGaaa > 2:1773738/1‑148 (MQ=255) cAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGaaa > 2:2342893/1‑148 (MQ=255) cAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGaaa < 1:3304467/148‑1 (MQ=255) aaGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAAt < 2:2135888/148‑1 (MQ=255) aaGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAAt < 2:946887/148‑1 (MQ=255) ggTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTg > 1:737289/1‑148 (MQ=255) tCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCAt < 2:745620/148‑1 (MQ=255) cGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCAtt > 2:4249/1‑148 (MQ=255) gACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTg < 2:635277/148‑1 (MQ=255) cTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGcc > 2:2616760/1‑148 (MQ=255) cTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGcc > 2:1554490/1‑148 (MQ=255) aaCAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCAt < 1:2462560/148‑1 (MQ=255) aCAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATa < 1:2135950/148‑1 (MQ=255) aGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATaaa < 2:2227053/148‑1 (MQ=255) ttACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAAt < 2:4037772/148‑1 (MQ=255) tttttCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGAt > 1:1526458/1‑148 (MQ=255) ttttCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGAtt > 1:3902919/1‑148 (MQ=255) ttttCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGAtt < 2:916668/148‑1 (MQ=255) tttCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGAttt > 1:3067981/1‑148 (MQ=255) ttCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTc < 1:3580838/148‑1 (MQ=255) ttCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTc < 2:3114192/148‑1 (MQ=255) cacaACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCAtt < 2:2673549/148‑1 (MQ=255) aaCGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCaa < 1:3428776/148‑1 (MQ=255) aCGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCaaa > 2:1113976/1‑148 (MQ=255) cGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAAc < 2:2492569/148‑1 (MQ=255) tGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGt < 1:2588302/148‑1 (MQ=255) gTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTa > 1:2415623/1‑148 (MQ=255) tCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTAt < 1:1764002/148‑1 (MQ=255) tCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTAt > 2:2037437/1‑148 (MQ=255) tCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTAt < 1:1589931/148‑1 (MQ=255) gAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATg > 2:1409917/1‑148 (MQ=255) aCAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGaa > 1:1652599/1‑148 (MQ=255) aCAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGaa < 1:907464/148‑1 (MQ=255) aCAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGaa > 1:2498600/1‑148 (MQ=255) aGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAAttt < 1:3863062/148‑1 (MQ=255) tGACGTACCACGTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTg < 2:2829614/148‑1 (MQ=255) gACGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTgg < 1:2990328/148‑1 (MQ=255) aCGTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTggg > 2:3871367/1‑148 (MQ=255) gTACCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGAc < 1:1841706/148‑1 (MQ=255) aCCACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACAt > 2:1009026/1‑148 (MQ=255) ccACTTTTTTCTTTTGTTGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACAtt > 2:3904933/1‑148 (MQ=255) ccACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACAtt < 1:2001451/148‑1 (MQ=255) ccACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACAtt > 1:1114570/1‑148 (MQ=255) cACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACAttt > 2:3674354/1‑148 (MQ=255) cACTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACAttt > 2:4431584/1‑148 (MQ=255) aCTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTc > 1:3144232/1‑148 (MQ=255) aCTTTTGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTc < 1:2095297/148‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTCATgg > 1:4059287/1‑148 (MQ=255) tGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTCATGGa < 2:3819931/148‑1 (MQ=255) tGCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTCATGGa < 2:1490602/148‑1 (MQ=255) gCCTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTCATGGaa > 1:2858755/1‑148 (MQ=255) ccTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTCATGGAAg < 1:3691788/148‑1 (MQ=255) cTTTGGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTCATGGAAGa > 1:4444262/1‑148 (MQ=255) | ATTTTACCGGTATTAAAGGTTCAGGCATGAGTGCACTTGCGCTAATGTTACATCAAATGGGAAAGAAAGTTCAAGGTTCGGACTCAACAGATTACTTTTTCACACAACGTGGTCTTGAACAAGCTGACGTACCACTTTTGCCTTTTGACGAAAAAAATATTAAGCCCGAATTTGAATTGATTGCTGGAAATGCTTTTCGCGATGATAACAATGTTGAAATTGCATTTGCCCATAAAAATGGATTTCCATTCAAACGTTATCATGAATTTTTGGGACATTTCATGGAAGAT > CP043523/2310269‑2310558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |