| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,848,557 | G→T | intergenic (+65/+679) | FTN78_chr1898 → / ← FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,848,557 | 0 | G | T | 100.0% | 1718.1 / NA | 508 | intergenic (+65/+679) | FTN78_chr1898/FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (228/280); total (228/280) | |||||||||||
Only 100 of 518 total aligned reads displayed.
TTGATGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACAT > CP043523/1848413‑1848681 | tgacgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAAttatga < 1:3028419/148‑1 (MQ=255) tgacgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAAttatga > 1:905417/5‑148 (MQ=255) tgacgaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAAttatga < 1:1305001/144‑1 (MQ=255) gaAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATgagaga > 2:2953898/1‑148 (MQ=255) ggTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTa < 2:683878/148‑1 (MQ=255) ggTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTa > 2:625566/1‑148 (MQ=255) cAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGa < 2:2114253/148‑1 (MQ=255) cAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGa < 1:1764426/148‑1 (MQ=255) ttGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACtt < 1:252187/148‑1 (MQ=255) gAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAg > 1:437781/1‑148 (MQ=255) gAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAg < 1:3078092/148‑1 (MQ=255) tttGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCa > 1:1507871/1‑148 (MQ=255) gATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCa < 2:4223722/148‑1 (MQ=255) aTGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCaa < 1:126847/148‑1 (MQ=255) tGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAag > 2:1316398/1‑148 (MQ=255) tGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAag > 1:244457/1‑148 (MQ=255) ttGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAagag > 1:2422336/1‑148 (MQ=255) gaagaaGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGa > 1:679774/1‑148 (MQ=255) agGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTc < 1:3952162/148‑1 (MQ=255) agGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTc > 1:694307/1‑148 (MQ=255) agGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTc > 1:2783510/1‑148 (MQ=255) gTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATGTACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTcac < 2:4618291/148‑1 (MQ=255) tCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTcaca < 1:423712/148‑1 (MQ=255) cAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCacac < 2:3914454/148‑1 (MQ=255) aaCGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACt > 2:4449904/1‑148 (MQ=255) cGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTc > 2:3644970/1‑148 (MQ=255) gTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTcc < 1:2933419/148‑1 (MQ=255) gTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTcc > 1:4173076/1‑148 (MQ=255) gTGGACCGCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTcc > 2:1266952/1‑148 (MQ=255) tGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTccc > 1:3372530/1‑148 (MQ=255) gACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑At > 2:819594/1‑148 (MQ=255) aCCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑Att < 2:4684653/148‑2 (MQ=255) ccTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑Attc < 1:1654363/148‑3 (MQ=255) cTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑Attca > 1:267997/1‑145 (MQ=255) aaGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATaa > 1:1948590/1‑148 (MQ=255) aaGCAGTCAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATaa < 2:1770438/148‑1 (MQ=255) cAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAAtt < 2:1016397/148‑1 (MQ=255) gTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAg < 1:3554169/148‑1 (MQ=255) ttAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAgg < 1:4322509/148‑1 (MQ=255) ttAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCAAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAgg > 1:136221/1‑148 (MQ=255) tAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAggg < 1:2140125/148‑1 (MQ=255) aaTATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAgggg < 2:2422336/148‑2 (MQ=255) atatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAggggc < 1:441632/148‑3 (MQ=255) tatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGTTATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACACACACTTCCCTTTGCGTAAATTAGGGcc > 2:3561916/1‑148 (MQ=18) tatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAggggca > 1:3617317/1‑145 (MQ=255) tatCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCa > 2:4044635/1‑148 (MQ=255) tCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAct > 1:3747469/1‑148 (MQ=37) tCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAct > 1:11678/1‑148 (MQ=37) tCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAct < 2:2326119/148‑1 (MQ=255) tCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAct < 2:3274745/148‑1 (MQ=255) cacaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATAAGGGGCagtt > 1:3171466/1‑145 (MQ=37) acaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCActtt > 1:2841134/1‑146 (MQ=38) acaAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCActtt > 2:1595811/1‑146 (MQ=37) caAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTa < 1:1585732/148‑1 (MQ=37) aaaaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTaa < 2:1990093/148‑1 (MQ=37) aaGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAata > 2:2286813/1‑148 (MQ=37) gCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAtata < 1:3480563/148‑1 (MQ=37) gCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAtata < 2:337502/148‑1 (MQ=38) gCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTCAAtata > 2:4378267/1‑148 (MQ=37) cATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTGAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATag < 1:3840882/148‑1 (MQ=37) cATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGTTATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACACACACTTCCCTTTGCGTAAATTAGGGCCActcttttata < 1:1085131/148‑7 (MQ=17) aTAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATaga > 1:1423128/1‑148 (MQ=38) aTAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATaga < 1:5647/148‑1 (MQ=38) aTAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATaga < 2:2369934/148‑1 (MQ=38) ttGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTgg < 2:2768057/148‑1 (MQ=38) tATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttt < 2:3313094/148‑1 (MQ=37) aTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtttt > 1:3525030/1‑148 (MQ=38) aTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGCTTTTTTATATTCAGTTGCAATTAGGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGAGGCCCTTTAATATAGAGCGGtttc > 1:4619461/1‑147 (MQ=37) tCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttttt < 1:1018993/148‑1 (MQ=38) tCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttttt < 2:3694450/148‑1 (MQ=38) cTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAACTTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGtttttt > 2:3175432/1‑148 (MQ=37) tGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttttttt > 1:4548370/1‑148 (MQ=37) tGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGttttttt < 1:2617790/148‑1 (MQ=38) aaaaTCGTACAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTaa < 2:185462/148‑1 (MQ=37) aaaTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAAt < 1:526044/148‑1 (MQ=38) aaaTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAAt < 2:3476109/148‑1 (MQ=38) aTCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGt < 1:4103173/148‑1 (MQ=38) gagCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTtta > 2:3762493/3‑148 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTtta < 2:2879609/148‑1 (MQ=38) gTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTtta < 2:3053482/148‑1 (MQ=38) gCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatt < 1:4017452/148‑1 (MQ=38) gCAAAAACTGGAGTAATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatt < 2:1088158/148‑1 (MQ=37) cAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTGTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTttatta < 2:2565386/148‑1 (MQ=37) aaaaACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaa > 1:3323946/1‑148 (MQ=38) aaaaACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaa < 1:82244/148‑1 (MQ=38) aaacTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaatt < 1:4278196/145‑1 (MQ=38) aacTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGTAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaatta > 1:2029155/3‑148 (MQ=255) aacTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTattaatta < 1:632730/146‑1 (MQ=38) acTGGAGTCATTATTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGTCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAttaattaa < 2:1399807/147‑1 (MQ=37) acTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAttaattaa > 2:264573/2‑148 (MQ=38) ggAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaat < 1:1981707/148‑1 (MQ=38) aGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaatta > 2:4505043/1‑148 (MQ=38) gTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTaattaaaattaa < 2:1507871/148‑1 (MQ=38) tCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAat > 2:2473101/1‑148 (MQ=255) cATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAata > 1:296256/1‑148 (MQ=38) cATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAata < 2:1705219/148‑1 (MQ=38) aTGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAatat < 1:2255344/148‑1 (MQ=38) gACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATAttt > 1:38144/1‑148 (MQ=38) tCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaa > 1:1823573/1‑148 (MQ=255) cAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTaaaag > 1:1710680/1‑147 (MQ=38) | TTGATGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACAT > CP043523/1848413‑1848681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |