| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,848,844 | T→C | intergenic (+352/+392) | FTN78_chr1898 → / ← FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,848,844 | 0 | T | C | 100.0% | 1952.8 / NA | 534 | intergenic (+352/+392) | FTN78_chr1898/FTN78_chr1899 | Cold shock protein of CSP family/Type I restriction‑modification system, restriction subunit R |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (275/259); total (275/259) | |||||||||||
Only 100 of 534 total aligned reads displayed.
GTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGG‑‑TAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCCCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTTGTGTTCCACTTTCTATCAATGTTTTAAGAAGCTTAACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAATAAATGCAAATGATTTTAATAATCTTAATAAGAAAAGAAGAG > CP043523/1848715‑1848988 | atcgggtATCAAGTCATGGCTAAATAGTCGACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCGATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAACAAGCTTTACGt < 2:4129420/142‑1 (MQ=25)atcgggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGt < 2:75049/142‑1 (MQ=25) tcgggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTc > 2:706334/6‑148 (MQ=25) cgggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCt > 1:1478739/5‑148 (MQ=37) cgggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCt < 2:2524203/144‑1 (MQ=37) gggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCGATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCtt > 2:3094193/4‑148 (MQ=25) gggtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCtt < 2:2343081/145‑1 (MQ=37) gtATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTa > 2:3848314/2‑148 (MQ=37) tATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTAt < 1:3257710/148‑1 (MQ=37) aTCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTAtt > 1:3354252/1‑148 (MQ=37) tCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtc > 1:1923946/1‑148 (MQ=37) cAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcc > 2:546355/1‑148 (MQ=38) aaGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcct > 2:300694/1‑148 (MQ=38) aGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcctc > 1:279972/1‑148 (MQ=38) gTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATtcctcc < 2:4572112/148‑1 (MQ=38) tCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCa < 1:510996/148‑1 (MQ=38) tCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCa > 2:1806186/1‑148 (MQ=38) cATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAt > 1:945035/1‑148 (MQ=255) cATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAt < 2:2689838/148‑1 (MQ=38) aTGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGTTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAtt > 2:3885964/1‑148 (MQ=255) aTGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCAtt < 2:2824988/148‑1 (MQ=255) tGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTg < 1:3565304/148‑1 (MQ=255) tGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTg > 1:2183859/1‑148 (MQ=255) tGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTg < 1:831537/148‑1 (MQ=255) tGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTg > 1:1011682/1‑148 (MQ=255) cTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATa > 2:396499/1‑148 (MQ=255) cTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATa > 1:299128/1‑148 (MQ=255) cTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATa < 1:4472875/148‑1 (MQ=255) cTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATa < 2:2635247/148‑1 (MQ=255) cTAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGCTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATa > 1:1073336/1‑148 (MQ=255) tAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATAc > 2:1355292/1‑148 (MQ=255) tAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATAc > 1:1196696/1‑148 (MQ=255) tAAATAATCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATAc < 1:4336220/148‑1 (MQ=255) aataatCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTa < 1:1277519/148‑1 (MQ=255) aataatCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTa > 1:749589/1‑148 (MQ=255) aaattaaCTAGCAATTCGGG‑‑TATAATAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTAtt > 1:4617358/6‑148 (MQ=255) tCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTa < 2:4233449/148‑1 (MQ=255) tCAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTa < 2:453443/148‑1 (MQ=255) cAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTAc > 2:3437773/1‑148 (MQ=255) cAACTAGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTAc < 2:816936/148‑1 (MQ=255) aGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATaa < 2:2435842/148‑1 (MQ=255) aGCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATaa > 2:493912/1‑148 (MQ=255) gCAATTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAAc < 2:3707830/148‑1 (MQ=255) aaTTCGGGTTTAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACtt < 2:3545539/148‑1 (MQ=255) tcgggtttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGaa > 2:3331310/8‑148 (MQ=255) tcgggtttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGaa < 2:1660340/141‑1 (MQ=255) gggtttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAg > 2:2028473/6‑148 (MQ=255) gggtttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAg > 2:1947620/6‑148 (MQ=255) ggtttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGc < 2:4318105/144‑1 (MQ=255) ggtttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGc > 2:2929178/5‑148 (MQ=255) gtttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCa > 1:4127000/4‑148 (MQ=255) tttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCAc > 1:304480/3‑148 (MQ=255) ttAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACt < 2:4477824/147‑1 (MQ=255) tAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACtt < 1:272122/148‑1 (MQ=255) t‑‑tAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTtat > 2:1065058/1‑148 (MQ=255) t‑‑tAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTtat < 1:244818/148‑1 (MQ=255) atatatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTtatata < 1:3501050/148‑1 (MQ=255) atatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATaaa < 1:1557025/148‑1 (MQ=255) atatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATaaa > 1:3997876/1‑148 (MQ=255) atatCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATaaa < 1:4710901/148‑1 (MQ=255) tataAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAAc < 2:4046455/148‑1 (MQ=255) tataAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAAc < 2:2223876/148‑1 (MQ=255) taAATTGTTGTTCTAGAATCTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACAt < 1:4572371/148‑1 (MQ=255) taAATTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACAt > 1:2142822/1‑148 (MQ=255) aaaTTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATa > 2:95447/1‑148 (MQ=255) aaaTTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATa < 2:1250549/148‑1 (MQ=255) aTTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGa > 1:548935/1‑148 (MQ=255) aTTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGa > 1:3621770/1‑148 (MQ=255) aTTGTTGTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGa < 2:3583489/148‑1 (MQ=255) ttgttgTTCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGaa < 1:645607/148‑1 (MQ=255) ttgttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATaa > 2:2169563/1‑148 (MQ=255) ttgttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATaa < 1:3436512/148‑1 (MQ=255) tgttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATaaa < 2:4644318/148‑1 (MQ=255) ttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAACTGAACATAGAATAAAtt < 1:872818/148‑1 (MQ=255) ttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAAtt > 1:1757487/1‑148 (MQ=255) ttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAAtt < 1:1672610/148‑1 (MQ=255) ttCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAAtt > 1:1239015/1‑148 (MQ=255) tCTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTa > 1:3156451/1‑148 (MQ=255) cTAGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTAc < 1:3663276/148‑1 (MQ=255) aGAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACgg > 1:2661661/1‑148 (MQ=255) gAAACTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACggg < 2:1579784/148‑1 (MQ=255) aaCTCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGtt > 1:424955/1‑148 (MQ=255) ctcctcAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTaa > 1:2272298/1‑148 (MQ=255) tCCTCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAAt > 2:1842097/1‑148 (MQ=255) ctcAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGa < 1:2926460/146‑1 (MQ=255) tcAAGAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGaa > 1:1432924/2‑148 (MQ=255) gAATCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACaag > 1:1689097/1‑147 (MQ=255) aaTCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACaaga < 1:4380628/148‑3 (MQ=255) tCCGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGaaa < 2:1514426/148‑1 (MQ=255) ccGCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAAt < 2:3167509/148‑1 (MQ=255) gCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATgt > 2:3276055/1‑147 (MQ=255) gCAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATgt < 2:1736731/148‑2 (MQ=255) cAATCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATgta < 1:3876545/148‑3 (MQ=255) aaTCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATGTaa < 1:2570091/148‑1 (MQ=255) aaTCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATGTaa < 2:1482168/148‑1 (MQ=255) aTCGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATGTaaa < 2:3367962/148‑1 (MQ=255) cGATTTAATTGGTGTTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATGTAAATg < 2:3466799/148‑1 (MQ=255) ttggtgtTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATGTAAATGAtcttgag > 2:1169695/4‑145 (MQ=255) tggtgtTCCACTTTCTACCAATGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATGTAAATGAtcttgaga > 1:2314230/3‑144 (MQ=255) aTGTCTTAAGAAGCTTTACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAAGAAATGTAAATGATCTTGAGAGTTTTTATAACAAAagaaga < 1:1806186/148‑1 (MQ=255) | GTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGG‑‑TAT‑‑TAATATATCTATAAATTGTTGTTCTAGAAACTCCCCAAGAATCCGCAATCGATTTAATTTGTGTTCCACTTTCTATCAATGTTTTAAGAAGCTTAACGTCTTTATTCCTCCATTGATACTATTGTACCATAACTTGAAAGCACTTATATAAATGAACATAGAATAAATTACGGGTTAATGAACAATAAATGCAAATGATTTTAATAATCTTAATAAGAAAAGAAGAG > CP043523/1848715‑1848988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |