| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,847,814 | T→C | intergenic (‑268/‑1) | FTN78_chr1896 ← / → FTN78_chr1897 | Mobile element protein/Cold shock protein of CSP family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,847,814 | 0 | T | C | 99.8% | 2018.4 / ‑5.4 | 551 | intergenic (‑268/‑1) | FTN78_chr1896/FTN78_chr1897 | Mobile element protein/Cold shock protein of CSP family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (263/287); total (263/288) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 561 total aligned reads displayed.
AATCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATAGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTATATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTAC > CP043523/1847669‑1847957 | aaTCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTacat < 1:1365598/148‑1 (MQ=255) tCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGa > 2:2132189/1‑148 (MQ=255) tCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGa > 1:2995803/1‑148 (MQ=255) cAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGaa < 1:4539305/148‑1 (MQ=255) aaTAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAAt < 1:2435967/148‑1 (MQ=255) tAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATaa > 1:1730236/1‑148 (MQ=255) aaGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATaaa < 1:4497445/148‑1 (MQ=255) aaGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATaaa < 2:2488684/148‑1 (MQ=255) aGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAg < 2:2232207/148‑1 (MQ=255) ttttAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGa > 2:939941/1‑148 (MQ=255) ttttAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGa < 2:25512/148‑1 (MQ=255) tttAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTTTTTTGTTTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGaa > 2:1628497/1‑148 (MQ=255) tttAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGaa < 2:237116/148‑1 (MQ=255) tAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACa < 1:2533638/148‑1 (MQ=255) tAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATaa > 2:3542939/1‑148 (MQ=255) gACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAAt < 1:3758492/148‑1 (MQ=255) gACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAAt > 2:2856357/1‑148 (MQ=255) aCCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAAtt > 1:1327060/1‑148 (MQ=255) ccAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTg < 2:3645198/148‑1 (MQ=255) cAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTgg > 1:716096/1‑148 (MQ=255) cAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTgg > 1:632081/1‑148 (MQ=255) aaTTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGt < 2:527809/148‑1 (MQ=255) tttGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGttt < 2:2331225/148‑1 (MQ=255) ttGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTa < 2:3046192/148‑1 (MQ=255) gACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAAc > 2:818375/1‑148 (MQ=255) aCTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACg < 1:2039225/148‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGc > 2:3706007/1‑148 (MQ=255) gTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACa > 2:1831583/1‑148 (MQ=255) aaGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACaaa < 1:2629523/148‑1 (MQ=255) aGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAg < 1:3147690/148‑1 (MQ=255) aGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGGTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAAGAAATTGGTTTAACGCTGACAAAg > 2:3214860/1‑148 (MQ=255) gAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAgg < 2:16898/148‑1 (MQ=255) gAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAgg > 2:3201293/1‑148 (MQ=255) gAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAgg > 1:4242594/1‑148 (MQ=255) aTAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCt < 1:311642/148‑1 (MQ=255) tAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGTGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTa > 2:4659805/1‑148 (MQ=255) tAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTa > 2:64804/1‑148 (MQ=255) ggTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATg < 2:3422433/148‑1 (MQ=255) tgtTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGt < 2:1510357/148‑1 (MQ=255) tACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCTAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGtttt > 2:3478447/1‑148 (MQ=255) aCTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGTGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTtta > 2:1203927/1‑148 (MQ=255) aTTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTttatta > 1:3658767/1‑148 (MQ=255) aTTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTttatta < 2:180393/148‑1 (MQ=255) aTTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTttatta < 1:3924822/148‑1 (MQ=255) tAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATg > 2:2989921/1‑148 (MQ=255) tAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATg < 1:279730/148‑1 (MQ=255) agagGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGc > 2:1955297/1‑148 (MQ=255) aggtaggtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAg < 1:3256723/148‑1 (MQ=255) aggtaggtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAg < 2:1343898/148‑1 (MQ=255) gtaggtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAgat < 1:502017/148‑1 (MQ=255) gtaggtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAgat > 1:2895548/1‑148 (MQ=255) aggtTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAgatga < 1:3476312/148‑1 (MQ=255) ttttGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGatat > 2:4261134/1‑148 (MQ=255) tttGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATg > 1:1014808/1‑148 (MQ=255) tcGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGAt > 2:600982/1‑148 (MQ=255) cGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGAtg > 1:142962/1‑148 (MQ=255) gAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGAtgt < 2:695361/148‑1 (MQ=255) gTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATgtgt < 1:3190735/148‑1 (MQ=255) gTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATgtgt > 1:3391532/1‑148 (MQ=255) tttAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGtt < 2:1417979/148‑1 (MQ=255) ttAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGttt < 1:1624685/148‑1 (MQ=255) aaaTGTTTTAGGAATGCACTTTTTCTCTATATTGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGc > 2:3245498/1‑148 (MQ=255) aaaTGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGc < 1:3073683/148‑1 (MQ=255) aTGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGctt < 1:2463865/148‑1 (MQ=255) tGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGctta < 1:930377/148‑1 (MQ=255) gTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttat > 1:4618918/1‑148 (MQ=255) gTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttat > 2:4328661/1‑148 (MQ=255) tttAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatct < 1:4180476/148‑1 (MQ=255) tttAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatct > 1:2715352/1‑148 (MQ=255) ttAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctc < 2:1103712/148‑1 (MQ=255) tAGGAATGCAATTTTTCGAAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctct < 2:100860/148‑1 (MQ=255) aGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctctt > 1:23462/1‑148 (MQ=255) aGGAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTATGcttatctctt < 2:4177659/148‑1 (MQ=255) ggAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGNTGATATGCAANATNTGTTTGcttatctctta < 2:4557852/148‑1 (MQ=255) gAATGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGcttatctcttat < 2:3151914/148‑1 (MQ=255) tGCACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTa < 1:2169930/148‑1 (MQ=255) cACTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTAtt < 1:1189851/148‑1 (MQ=255) aCTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTc < 2:1989509/148‑1 (MQ=255) cTTTTTCGCAAAATGGGTTTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCa < 1:4081314/148‑1 (MQ=255) cTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCa < 1:228177/148‑1 (MQ=255) cTTTTTCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCa > 2:2587422/1‑148 (MQ=255) tCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGaa < 1:4422170/148‑1 (MQ=255) tCGCAAAATGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGaa > 1:794619/1‑148 (MQ=255) aaaTGGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAt < 1:1054115/148‑1 (MQ=255) atgggATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAttt < 1:1135351/145‑1 (MQ=255) tgggATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAtttt > 2:3858417/3‑148 (MQ=255) tgggATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGAtttt < 2:4099281/146‑1 (MQ=255) aTTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTaaaa > 2:3579671/1‑148 (MQ=255) aTTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTaaaa < 2:3324341/148‑1 (MQ=255) aTTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTaaaa < 2:2771402/148‑1 (MQ=255) gaCAGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAAt < 1:2568088/147‑1 (MQ=255) aGATGATGCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACg < 1:60080/148‑1 (MQ=255) tgatgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATg > 2:4306754/1‑148 (MQ=255) tgCGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAg < 1:4364511/148‑1 (MQ=255) cGAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGt < 1:1604560/148‑1 (MQ=255) gAAAGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTc < 2:1572174/148‑1 (MQ=255) aaGGATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCaa > 2:1304313/1‑148 (MQ=255) ggATGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCaaaa > 2:3998497/1‑148 (MQ=255) aTGTATTACATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAgg < 1:1822779/148‑1 (MQ=255) attacATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTAc < 2:741943/148‑1 (MQ=255) | AATCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATAGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTATATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCTGACAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTATCTCTTATCTATTCAGGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTAC > CP043523/1847669‑1847957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |