| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP043523 | 1,882,570 | T→C | intergenic (+281/‑274) | FTN78_chr1926 → / → FTN78_chr1927 | hypothetical protein/3‑ketoacyl‑CoA thiolase, Acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP043523 | 1,882,570 | 0 | T | C | 100.0% | 1135.3 / NA | 495 | intergenic (+281/‑274) | FTN78_chr1926/FTN78_chr1927 | hypothetical protein/3‑ketoacyl‑CoA thiolase, Acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (323/172); total (323/172) | |||||||||||
Only 100 of 496 total aligned reads displayed.
CTTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATGCCTCGAATAGTCTCCATGCCCTTTATCGTGGTTGAGGCAGTACGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCTATTAGATTGTTAAGGTATTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAATTCATTACTCTGTAATTTTCTAAAGGCAGAGCCAATAGACGGAGCTTTATCCGTGACAATTACTCTAGGTTCAACAAACTGCTTATGTAGTCGTTTCAAGA > CP043523/1882426‑1882703 | cgttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTc > 1:2253893/3‑148 (MQ=17) gttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCa > 1:4305729/2‑148 (MQ=11) ttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCAc > 2:3382768/1‑148 (MQ=17) ccATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAcag < 2:4603744/148‑3 (MQ=11) cATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAcagt > 1:2677795/1‑145 (MQ=11) aTTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGtt > 1:1625356/1‑148 (MQ=255) cttcGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGAt > 1:2642274/1‑148 (MQ=255) ttcGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATg < 2:2627421/148‑1 (MQ=255) cGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGct > 2:1380607/1‑148 (MQ=255) ggTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCACAGTTCGGTGctc > 1:4690308/1‑148 (MQ=11) gTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCACAGTTCGGTGctct < 2:3966835/148‑1 (MQ=14) gTTCTTTTTATATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGTTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGctct > 2:1153722/1‑148 (MQ=17) tCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGt > 1:4610994/1‑148 (MQ=255) cTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTc > 1:908696/1‑148 (MQ=255) cTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTc > 2:3688826/1‑148 (MQ=255) tttttGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCt > 1:3380572/1‑148 (MQ=18) tttttGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCt < 2:563294/148‑1 (MQ=255) tttttGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCt > 2:2717008/1‑148 (MQ=18) ttttGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCtt > 1:1108841/1‑148 (MQ=255) tttGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTa < 1:2333615/148‑1 (MQ=255) tttGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTa > 1:4255798/1‑148 (MQ=255) tGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGt > 1:1234280/1‑148 (MQ=18) gTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGta > 2:430150/1‑148 (MQ=255) tataTTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGtat > 2:167114/1‑148 (MQ=255) atatTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGtata > 1:1017293/1‑148 (MQ=255) tCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATaaaccg > 2:2857310/1‑144 (MQ=18) gAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATaaaccgtt < 1:1737198/148‑7 (MQ=17) tcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTa > 1:3253804/1‑148 (MQ=18) tcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTa > 1:757155/1‑148 (MQ=17) ccATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTaa > 2:3447076/1‑148 (MQ=18) cATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTaac < 2:3185990/148‑2 (MQ=18) cATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTaac > 2:3638710/1‑147 (MQ=18) tGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAActt < 2:3876689/148‑1 (MQ=17) gCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAActtt < 2:1970833/148‑1 (MQ=17) ccTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCt > 1:1358243/1‑148 (MQ=17) ccTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCt > 1:1461154/1‑148 (MQ=17) ttaaTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCttt < 2:1807745/145‑3 (MQ=17) ttaaTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaa > 1:1895785/4‑148 (MQ=17) ttaaTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaa < 1:1263234/145‑1 (MQ=17) taaTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaaa < 1:2580771/146‑1 (MQ=18) taaTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaaa > 2:7836/3‑148 (MQ=17) taaTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaaa > 2:3247322/3‑148 (MQ=18) aaTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGCCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaaat < 2:4712827/147‑2 (MQ=255) aTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaaatg < 2:81445/148‑3 (MQ=18) cGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCa > 2:4483070/1‑148 (MQ=17) cGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaaatgta > 2:1845645/1‑144 (MQ=17) ttGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCagaacc > 2:4355802/1‑145 (MQ=12) ttGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAAcc > 2:4381869/1‑148 (MQ=17) cAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGa > 2:3086646/1‑148 (MQ=12) cAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGa > 2:4246898/1‑148 (MQ=12) cAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGa < 2:677248/148‑1 (MQ=12) cAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGa > 1:2211737/1‑148 (MQ=17) tcGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGagggc > 1:2404473/2‑144 (MQ=12) cGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGagggcg < 2:1566382/148‑6 (MQ=12) aGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAGCCAAGAGAAGGCGCtt > 1:713736/1‑148 (MQ=9) aGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAgggcgatt > 1:2834448/1‑143 (MQ=12) gACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCttt > 1:1550464/1‑148 (MQ=12) ttCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATc > 1:1010650/1‑148 (MQ=12) tgATAAAATTTATTTCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCg > 2:3927091/2‑148 (MQ=9) aTAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTg < 2:2923055/148‑1 (MQ=12) tAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGa > 2:1256290/1‑148 (MQ=12) aaaTTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACa < 2:4036223/148‑1 (MQ=12) aaTTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACaa > 1:85760/1‑148 (MQ=12) aTTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAAt > 1:4156255/1‑148 (MQ=12) tttATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAAtt < 2:2478371/148‑1 (MQ=12) ttATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTa > 2:2324453/1‑148 (MQ=12) ttATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTa > 2:4533504/1‑148 (MQ=12) tATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTAc > 2:1515985/1‑148 (MQ=16) tATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTAc > 1:2522900/1‑148 (MQ=12) ttGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTActc > 2:1207733/1‑148 (MQ=12) tGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTActct < 2:2401814/148‑1 (MQ=17) tGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTActct < 2:421913/148‑1 (MQ=12) cgtcgtTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTActcttg > 1:4463521/1‑146 (MQ=12) gtcgtTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTActcttgg > 2:4149929/1‑145 (MQ=12) cgtTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGtt > 2:8889/1‑148 (MQ=16) cgtTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGtt > 1:2137955/1‑148 (MQ=16) tttGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttga > 2:3575568/1‑146 (MQ=12) tttGATTGGTCGATGGTATTGCTCAATGAGTTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTATATGCATAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttga < 2:236388/148‑3 (MQ=12) tGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttgacc > 1:2917408/1‑144 (MQ=12) gATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttgacca > 1:3053937/1‑143 (MQ=12) gATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttgacca < 2:3163868/148‑6 (MQ=12) aTTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttgaccaa > 1:3846023/1‑142 (MQ=12) ttGTTCGATGGTCTTAATCAATGATGTTATTGAGATACTTCGTGTTTCCACGCTCTGTCTTAATATATAAACCATTACTCTGTATCTTTCTATCTGCACTACTAATTGAGTGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTAACCaaa < 2:1046103/148‑1 (MQ=255) ttGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttgaccaaa > 2:2808489/1‑141 (MQ=12) ttGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttgaccaaa < 2:2139727/148‑8 (MQ=12) ttGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGttgaccaaa < 2:2592367/148‑8 (MQ=12) tGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAAc > 1:1662049/1‑148 (MQ=12) ggTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACt > 1:607223/1‑148 (MQ=12) tCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTgt > 1:405882/1‑147 (MQ=12) tCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTgt < 2:1606305/148‑2 (MQ=12) gATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGttt < 2:1467948/148‑1 (MQ=12) aTGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTa < 2:2212581/148‑1 (MQ=9) aTGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTa > 2:535563/1‑148 (MQ=9) tGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTAt < 1:2048768/148‑1 (MQ=9) ggTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTATg < 1:3575568/148‑1 (MQ=9) ggTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTATg > 2:2992666/1‑148 (MQ=9) gTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTATgg < 2:2247205/148‑2 (MQ=9) gTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTATgg > 2:3735746/1‑147 (MQ=9) ttGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGCAGAACCAATAGAGGGCGATTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTATGGAGt > 2:2440678/1‑148 (MQ=2) aaaTTGTTAAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAGAGGGCGCTTTATCCGTGACAATTACTCTTGGTTGACCAAACTGTTTATGTAGTCGTTTCAAGa < 1:3755925/146‑1 (MQ=9) | CTTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATGCCTCGAATAGTCTCCATGCCCTTTATCGTGGTTGAGGCAGTACGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCTATTAGATTGTTAAGGTATTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAATTCATTACTCTGTAATTTTCTAAAGGCAGAGCCAATAGACGGAGCTTTATCCGTGACAATTACTCTAGGTTCAACAAACTGCTTATGTAGTCGTTTCAAGA > CP043523/1882426‑1882703 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |