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2:470774/1‑162 (MQ=255) tACGTAAACTTAAGGGAATGTTGGAGATCATCCAGTACCGGATACGAAACAGCGTGAGCAAAAATAGTCCAACTGCGCCCCAGAATATTGCGCCCATCCCGGTCTGCCAGGAGATGCCCATCGCCCCCACGACCACGAAGGCAAAGAAGGCGTTCAGCCCCATTGCCGGAGCCAGCGcc < 2:540526/179‑1 (MQ=255) tACGTAAACTTAAGGGAATGTTGGAGATCATCCAGTACCGGATACGAAACAGCGTGAGCAAAAATAGTCCAACTGCGCCCCAGAATATTGCGCCCATCCCGGTCTGCCAGGAGATGCCCATCGCCCCCACGACCACGAAGGCAAAGAAGGCGTTCAGCCCCATTGCCGGAGCCAGCGcc > 1:540526/1‑179 (MQ=255) tACGTAAACTTAAGGGAATGTTGGAGATCATCCAGTACCGGATACGAAACAGCGTGAGCAAAAATAGTCCAACTGCGCCCCAGAATAGTGCGCCCATCCCGGTCTGCCAGGAGATGCCCATCGCCCCCACGACCACGAAGGCAAAGAAGGCGTTCAGCCCCa < 1:470774/162‑1 (MQ=255) tACGTAAACTCAAGGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattat < 1:650869‑M2/288‑274 (MQ=255) 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1:74061/288‑1 (MQ=255) | AGGCGGAATGGAATAGACGCCGCTAAAATGAACATCACCGAAAAATAATCCACAGCAAGACGTCACCACAATAGAAACCAGCACCGCGGCATGAAAATGACGTGATGACAACACGGTTATAATAAAAAACCCTAAAATACCTAACAACACGCCGTGAGAACTTAAATCGCCAATCATCACCAGCGTGTCTTTATTGGCGACAATAACGCCAGTATTTTTTAATCCCATTAAGGCGATAAATAATCCAATT‑CCGCTGGTGATACCAATACGTAAACTTAAGGGAATGTTGGAGATCATCCAGTACCGGATACGAAACAGCGTGAGCAAAAATAGTCCAACTGCGCCCCAGAATATTGCGCCCATCCCGGTCTGCCAGGAGATGCCCATCGCCCCCACGACCACGAAGGCAAAGAAGGCGTTCAGCCCCATTGCCGGAGCCAGCGCCACGGGTAAGTTAGCAAATATCCCCATCGCAATACTGCCGATACCGGCAATCAAACAGGTGGTAACAAACACCACTTTCGGGTCCATTTGTGCCGCGCCGAGGATTTGCGGGTTCACAAAAA > NC_000913/3843085‑3843650 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |