New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 17 (0.750) | 12/382 | 0.8 | 32.1% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3853475 | 36 (1.590) | intergenic (‑218/‑78) | istR/tisB | small RNA IstR‑2/membrane‑depolarizing toxin TisB |
AAGTATACGTGTTCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTGGTGTCGGATGCGATGCTGACG > NC_000913/3853198‑3853730 | aaGTATACGTGTTCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtg > 1:346229‑M2/1‑278 (MQ=255) ttCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATTCTGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCGCTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTTAGCACACTGTGTTATGTCAAAAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCacaaca > 1:329475/1‑281 (MQ=255) ttCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAg > 1:371938/1‑282 (MQ=255) gcgcAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTgg < 1:318939/282‑1 (MQ=255) aGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACATTGTGTTATGTCAACAAGAACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGAGGAAAGGAACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGACCcac > 1:298186/1‑282 (MQ=255) gAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTc < 1:209227/269‑1 (MQ=255) tCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca > 1:300493‑M2/1‑207 (MQ=255) aTCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCATGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGAagc > 1:340158/1‑279 (MQ=255) tCACAGTTTTCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTa < 1:184911/281‑1 (MQ=255) agaggggTCAAAATTTTTCTCTTTATTTATACAGTAAACGTCTATAATATCCCTGTACGCAATGGGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACAGTGTTATGTCAACAAGAACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGAcg < 2:308209/261‑1 (MQ=255) tAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaag < 1:229363‑M2/282‑124 (MQ=255) tataATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGc > 1:145986/1‑206 (MQ=255) tACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGgaga < 2:57570/210‑1 (MQ=255) tACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGgaga > 1:57570/1‑210 (MQ=255) cGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCgg > 2:65518/1‑168 (MQ=255) cGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCgg < 1:65518/168‑1 (MQ=255) cGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAACGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCt > 1:158894/1‑282 (MQ=255) cAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTgcag < 1:141739/260‑1 (MQ=255) ggggCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCGTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCAt < 1:382963/238‑1 (MQ=255) tACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAGCGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACCGTGTCATGTCAGCAAGCACAACCGTTCTCCTCGCG‑ATACCGCGTGCACGAAAGCTGACAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCGCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATAGCCATTCTTATCCTCAAACTCAgtgt > 1:105925/1‑228 (MQ=255) tGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTAAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTGGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGGAATGCAGATTCAAGTCGCACCAAAgggca > 1:209020/1‑280 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACcgcg < 1:64769/92‑1 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACcgcg > 2:64769/1‑92 (MQ=255) cAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGCG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTGGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCtttt > 1:278849/1‑281 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctccctgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccgggaagccccaaaaacaacacaataat < 2:167058‑M2/282‑233 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgcc > 2:116529‑M2/1‑50 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgcc < 2:277001‑M2/62‑13 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgcc < 1:116529‑M2/62‑13 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgcc > 1:277001‑M2/1‑50 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAcc > 2:80469/1‑52 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAcc < 1:80469/52‑1 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAAc < 1:275351/113‑1 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAAc > 2:275351/1‑113 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTa < 1:171528/128‑1 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTa > 2:171528/1‑128 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGa > 1:320397/1‑141 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGa < 2:320397/141‑1 (MQ=255) acTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcag > 2:240677‑M2/1‑41 (MQ=255) acTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcag < 1:240677‑M2/222‑182 (MQ=255) gtataaacaaaaaGCCCAACCTTTCCCCCTGGGTGTACCCCCTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCCCAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTGGTGTCGgatgc < 2:371938/275‑1 (MQ=255) gTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgagttagtgtatgatgttgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaaccattgatatggccatgaatggcgttggat < 1:67053‑M2/282‑252 (MQ=255) tCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCaa < 1:306951/164‑1 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTGTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAAGGGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTTCTCCTGAACCACAGGAGACGCGGATGTACCTGGTGGAGACCGCCATTTTTAATCTCCAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTg > 2:306951/1‑164 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcag < 2:136225‑M2/208‑182 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcag > 1:136225‑M2/1‑27 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgattta > 1:275593‑M2/1‑27 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgattta < 2:275593‑M2/53‑27 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCg < 2:360449/209‑1 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCg > 1:360449/1‑209 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTGGTGTCGGATGCGATGCTGACg > 1:300966/1‑282 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTGGTGTCGGATGCGATGCTGACg > 1:319505/1‑282 (MQ=255) tGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg < 2:272740‑M2/44‑38 (MQ=255) tGAG‑ATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 1:272740‑M2/1‑7 (MQ=255) | AAGTATACGTGTTCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAG‑ATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTGGTGTCGGATGCGATGCTGACG > NC_000913/3853198‑3853730 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |