Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,411,503 | 0 | C | T | 64.4% | 43.1 / 41.8 | 45 | A78V (GCG→GTG) | fis | DNA‑binding transcriptional dual regulator Fis |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/7); new base T (16/13); total (25/20) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.71e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
AATTTTGCGTAAACAGAAATAAAGAGCTGACAGAACTATGTTCGAACAACGCGTAAATTCTGACGTACTGACCGTTTCTACCGTTAACTCTCAGGATCAGGTAACCCAAAAACCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCA > NC_000913/3411234‑3411775 | aaTTTTGCGTAAACAGAAATAAAGAGCTGACAGAACTATGTTCGAACAACGCGTAAATTCTGACGTACTGACCGTTTCTAACGTTAACTCTCAGGATCAGGTAACCCAAAAACCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGCTGTGAATGACCTCTAGGAGCTGGTACTGGCAGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGGGATGAAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCaa < 1:455045/288‑1 (MQ=255) tGTTCGAACAACGCGTAAATTCTGACGTACTGACCGTTTCTACCGTTAACTCTCAGGATCAGGTAACCCAAAAACCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCa > 1:190538/1‑288 (MQ=255) aaCTCTCAGGATCAGGTAAACAAAAAACCCCTGAGTGACTAGGTTAAGCAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATTAAATACACCCGTGGTAAGCAGACCCGTGCTGCGCGGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACt < 1:344543/287‑1 (MQ=255) aaCCCAAAAACCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTTAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGcc < 1:88452/287‑1 (MQ=255) aCCCAAAAACCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCtt < 1:581919/288‑1 (MQ=255) aCCCAAAAACCCCTGCGTGAATCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCtt < 1:202768/288‑1 (MQ=255) aaaCCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGACTTTTTtat > 1:606631/1‑288 (MQ=255) aaaCCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCa < 2:145199/217‑1 (MQ=255) aaaCCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCa > 1:145199/1‑217 (MQ=255) cACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCa < 1:132799/189‑1 (MQ=255) cACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCa > 2:132799/1‑189 (MQ=255) agaaCTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCAGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAAc < 1:149623/188‑1 (MQ=255) ttttGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCACCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAAc > 1:265545/1‑288 (MQ=255) tGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGa < 1:311452/288‑1 (MQ=255) tGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCACTACTCGGCATGGGGTAGCGCCTTTTTTATAGgtgt < 1:14900/242‑1 (MQ=255) tgTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCGGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCAT‑GGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAAt < 1:552155/287‑1 (MQ=255) aGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAGCAGCCCCTGTTGGACATGGTGACGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGCTGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATAGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATggg > 1:401754/1‑211 (MQ=255) gAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCaa < 1:306028/111‑1 (MQ=255) gAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCaa > 2:306028/1‑111 (MQ=255) aCCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCatt > 1:690643/1‑288 (MQ=255) aCCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTCCTCGGCATGGGGAAgc > 2:402719/1‑204 (MQ=255) aCCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAgc < 1:402719/204‑1 (MQ=255) ctATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGACCAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACACGTGCTGCGCtgatgacg > 1:208583/1‑92 (MQ=255) cTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACt < 2:215636/179‑1 (MQ=255) cTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACt > 1:215636/1‑179 (MQ=255) tACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAGAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATg > 1:208529/1‑286 (MQ=255) ggCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGACGGGCATCAACCGCGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATCCGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATggg > 1:455948/1‑180 (MQ=255) aaGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGgt > 1:689188/1‑195 (MQ=255) aaGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGgt < 2:689188/195‑1 (MQ=255) aaCAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTaaa > 1:158645/1‑288 (MQ=255) aaCAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACg > 1:217568/1‑265 (MQ=255) ccccTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGAGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGATTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTGTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGa > 1:460518/1‑200 (MQ=255) gTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAg > 1:628026/1‑242 (MQ=255) tGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTaa < 1:73429/239‑1 (MQ=255) ggTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTg < 2:370906/185‑1 (MQ=255) ggTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTg > 1:370906/1‑185 (MQ=255) ggTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATgc > 1:383047/1‑253 (MQ=255) ggTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGGACTTAAAAAGATCCCAGCCGAAAgt > 1:380588/1‑287 (MQ=255) ggTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAgt > 1:609418/1‑287 (MQ=255) tGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGgcg < 2:696196/131‑1 (MQ=255) tGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGgcg > 1:696196/1‑131 (MQ=255) tGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTg > 1:324130/1‑180 (MQ=255) tACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGcc < 1:412950/148‑1 (MQ=255) tACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGcc > 2:412950/1‑148 (MQ=255) aCCAGACCCGTGCTGTGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAACAAATACGGCATGAGCTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGTCCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACcca < 1:251857/288‑1 (MQ=255) tgctgtgctgATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCa < 1:580871/62‑1 (MQ=255) tgctgtgctgATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCa > 2:580871/1‑62 (MQ=255) tgctgtgctgATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGaa < 1:127253/66‑1 (MQ=255) tgctgtgctgATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGaa > 2:127253/1‑66 (MQ=255) | AATTTTGCGTAAACAGAAATAAAGAGCTGACAGAACTATGTTCGAACAACGCGTAAATTCTGACGTACTGACCGTTTCTACCGTTAACTCTCAGGATCAGGTAACCCAAAAACCCCTGCGTGACTCGGTTAAACAGGCACTGAAGAACTATTTTGCTCAACTGAATGGTCAGGATGTGAATGACCTCTATGAGCTGGTACTGGCTGAAGTAGAACAGCCCCTGTTGGACATGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCCCGCCGAAAGTGTCGATCTGATCTTTGCCGACCCA > NC_000913/3411234‑3411775 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |