New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 65 (1.910) | 43/414 | 0.0 | 67.7% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3853475 | 31 (0.910) | intergenic (‑218/‑78) | istR/tisB | small RNA IstR‑2/membrane‑depolarizing toxin TisB |
ACACTGAAAGTATACGTGTTCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTGGTGTCGGATGCGATGCTGACGCATCTTATCCGC > NC_000913/3853191‑3853742 | acacTGAAAGTATACGTGTTCCGCGCAGACCGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTCTTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGATTTGTCCTAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCTCTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATATCAACAAGCACAACGTTTCTCATTGAGATa > 1:491431/1‑285 (MQ=255) acacTGAAAGTATACGTGTTCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGATTTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACACACTGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATa > 1:563325/1‑285 (MQ=255) ttCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGCACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaactta > 1:318447‑M2/1‑267 (MQ=255) aGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgattta > 1:508680‑M2/1‑259 (MQ=255) cATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc < 1:123441‑M2/270‑52 (MQ=255) tAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct > 1:320072‑M2/1‑217 (MQ=255) gnganntccgatcacagTTTGCGTTTTNTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAAGATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 2:123441‑M2/9‑214 (MQ=255) tGAGTATCGATCACAGTTTTCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTAATACAGTAAACTTCTATAATATCACGGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGgaga < 1:286123/285‑1 (MQ=255) aGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgcccacttactgatttagtgtatgatggtgttttttaggtgttcctgggggcgtcg < 2:429600‑M2/276‑66 (MQ=255) aGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGCCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagttgttccagtggctcctgtttctatca < 1:68478‑M2/285‑75 (MQ=255) cGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGCCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTTAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 1:438637‑M2/238‑33 (MQ=255) aTCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAACCTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGTATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGCTTCTCCTTGAGCTAggtgatgctgccaacttactgatt < 1:481570‑M2/228‑25 (MQ=255) aTCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcctgcctct < 1:561988‑M2/285‑82 (MQ=255) aTCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt < 1:61903‑M2/283‑80 (MQ=255) aTCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatt > 1:78983‑M2/1‑204 (MQ=255) aTCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatt < 2:78983‑M2/228‑25 (MQ=255) aGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatt < 2:406106‑M2/223‑25 (MQ=255) aGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatt > 1:406106‑M2/1‑199 (MQ=255) ttGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTTAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtcttatggtgtttttgagttgctcgagtggct < 2:441858‑M2/250‑62 (MQ=255) ttatACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 2:130034‑M2/1‑167 (MQ=255) ttatACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:130034‑M2/210‑44 (MQ=255) tataATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGc > 1:478529/1‑283 (MQ=255) taataTCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACt > 1:513027/1‑285 (MQ=255) tatCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTAACCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCt < 1:183658/285‑1 (MQ=255) tCGCTGTACGCAATGTGTTATGAGGGGGACGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGGAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggttgtgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctacagtggcttctgtttctatcagctgttcctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcg > 1:384799‑M2/1‑144 (MQ=255) tCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgcc > 1:464035‑M2/1‑144 (MQ=255) tCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgcc < 2:464035‑M2/156‑13 (MQ=255) cACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgc > 1:146434‑M2/1‑143 (MQ=255) tACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTg < 1:13020/285‑1 (MQ=255) aCGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtt > 1:19132‑M2/1‑137 (MQ=255) gtTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAGGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagacccgccggacatcagcgc < 1:326495‑M2/270‑143 (MQ=255) ctcttgcggGTGCCGCATCGTTACCCGGGGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgc > 2:61903‑M2/5‑128 (MQ=255) gggCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc > 2:448389‑M2/1‑119 (MQ=255) gggCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc < 1:448389‑M2/204‑86 (MQ=255) gCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct < 2:109585‑M2/187‑71 (MQ=255) gCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct > 1:109585‑M2/1‑117 (MQ=255) cGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcag > 1:441858‑M2/1‑103 (MQ=255) aGTCCTGGCTGACACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTAGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCCGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATAAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTAACCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAggg < 1:96742/285‑1 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTTGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaactta > 2:343732‑M2/1‑87 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatc > 1:236600‑M2/1‑87 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc > 2:499931‑M2/1‑87 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc < 1:499931‑M2/172‑86 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt > 1:555242‑M2/1‑87 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt < 2:555242‑M2/166‑80 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtg > 1:473633‑M2/1‑87 (MQ=255) ggCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtg < 2:473633‑M2/91‑5 (MQ=255) aaCGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCTCACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgattta < 2:146764‑M2/107‑27 (MQ=255) aaCGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAGCAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgattta > 1:146764‑M2/1‑81 (MQ=255) aaCGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggg > 1:367401‑M2/1‑81 (MQ=255) aaCGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggg < 2:367401‑M2/185‑105 (MQ=255) aaCGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGCTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGTTACGTCAGCTGGCAGTGCTACTGAACCACAGGAGAAGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACATCAACTGCTTGATGTTGTTCTGAAATACCTGAAGAAATTCAGATTCAAGTAGAACCAAAGGGGAGCGGGAAAca > 1:317964/1‑284 (MQ=255) aaCGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGCGAGCACACTGTGTGATGTCCACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccatcttactgttt < 1:343732‑M2/105‑25 (MQ=255) tgCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacat > 2:424685‑M2/1‑72 (MQ=255) tgCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacat < 1:424685‑M2/208‑137 (MQ=255) aGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTCCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACCGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTAAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCAcc > 1:252631/1‑251 (MQ=255) cgcCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcccttacaccgcttctcaacccgttacgcaccagaaaat < 1:148833‑M2/285‑223 (MQ=255) cgcCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggg < 1:276401‑M2/167‑105 (MQ=255) cgcCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggg > 2:276401‑M2/1‑63 (MQ=255) cTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgc > 1:260523‑M2/1‑60 (MQ=255) cTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgc < 2:260523‑M2/202‑143 (MQ=255) aCCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccg > 1:293378‑M2/1‑56 (MQ=255) aCCCCGCGGGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCaa < 1:93411/190‑1 (MQ=255) ccccGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgata > 1:429600‑M2/1‑55 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCCACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGACAGCGGAAAGGTACGTCAGCTTGCAGTGCTCCTGAACCGCAGGAGACGCGTATGCACCTGGTGGATCTCGCCATTCTTATCCTCCAACTCATTGTTTCAGCACTGCACCTGCtt > 2:93411/1‑190 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGGGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCaa < 2:107110/184‑1 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatct < 2:291441‑M2/197‑148 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatct > 1:291441‑M2/1‑50 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatc > 1:396228‑M2/1‑50 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatc < 2:396228‑M2/196‑147 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtt > 1:489593‑M2/1‑50 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtt < 2:489593‑M2/139‑90 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGGAAGGTACGCCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATTAACCTGGTGGATATCGCCCTTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTc > 1:427692/1‑200 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACg < 1:316274/91‑1 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACg > 2:316274/1‑91 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGAc < 2:569983/123‑1 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGAc > 1:569983/1‑123 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAAGTCATTGTTGCAGCACTGCaa < 2:139073/184‑1 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCaa > 1:139073/1‑184 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCaa > 1:107110/1‑184 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTgg > 1:499312/1‑285 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCCGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTc > 2:392442/1‑258 (MQ=255) cgTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCCGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTc < 1:392442/258‑1 (MQ=255) acTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacat < 2:404286‑M2/177‑137 (MQ=255) acTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacat > 1:404286‑M2/1‑41 (MQ=255) tgtgTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgt < 1:358774‑M2/285‑247 (MQ=255) ttATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCt > 2:366891/1‑174 (MQ=255) ttATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCt < 1:366891/174‑1 (MQ=255) caacaaGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAg < 1:44355/81‑1 (MQ=255) caacaaGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAg > 2:44355/1‑81 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCaa < 2:490178/139‑1 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCaa > 1:490178/1‑139 (MQ=255) acaaGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTGGTGTCGGATGCGATGCTGACGCAt > 1:87511/1‑285 (MQ=255) ctcCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgattcagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggg > 2:115270‑M2/1‑12 (MQ=255) ctcCTTGAGATAggtgatgctgccaacttactgattcagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggg < 1:115270‑M2/116‑105 (MQ=255) ctcCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAAc < 1:73891/75‑1 (MQ=255) ctcCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAAc > 2:73891/1‑75 (MQ=255) agaTAtgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggtgtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaaca > 1:318556‑M2/1‑5 (MQ=255) aggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccg > 1:538920‑M2/1‑1 (MQ=255) | ACACTGAAAGTATACGTGTTCCGCGCAGAACGCGCAATTTCGGCACGAATTTTGACGTATTTAGTGCATAGTTGAGTATCGATCACAGTTTGCGTTTTGTCCAAATATTACTGTTTATTTATACAGTAAACTTCTATAATATCACTGTACGCAATGTGTTATGCGGGGGCCGCATCGTTACCCGGCGCACTAAGTCCTGGCTGAAACGGGTGGTGCCGTCAGCGCCTTAACCCCGCGTGAGCACACTGTGTTATGTCAACAAGCACAACGTTTCTCCTTGAGATACCGCGTGCACAACAGCTGGCAACAGGCAGCGGAAAGGTACGTCAGCTGGCAGTGCTCCTGAACCACAGGAGACGCGTATGAACCTGGTGGATATCGCCATTCTTATCCTCAAACTCATTGTTGCAGCACTGCAACTGCTTGATGCTGTTCTGAAATACCTGAAGTAATTCAGATTCAAGTCGCACCAAAGGGGAGCGGGAAACCGCTCCCCTTTTATATTTAGCGTGCGGGTTGGTGTCGGATGCGATGCTGACGCATCTTATCCGC > NC_000913/3853191‑3853742 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |