New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1276748 = | 568 (0.980) | 6 (0.010) | 5/174 | 43.4 | 1.1% | coding (94/1797 nt) | narX | NarX |
? | NC_000913 | 1425561 = | 563 (1.070) | coding (80/156 nt) | b1369 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1276850‑1276748 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gatggcggGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCCA > NC_000913/1425561‑1425655 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG > 2:949857/1‑96 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG < 2:1870042/96‑1 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG < 1:7468960/96‑1 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG < 2:2375540/96‑1 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG > 2:13541224/1‑96 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG > 1:8118700/1‑96 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG > 2:8985940/1‑96 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG < 2:5867927/96‑1 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG < 1:13671989/96‑1 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG > 2:9239113/1‑96 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGG < 2:9416117/96‑1 AGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGA < 2:8076084/96‑1 AGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGA < 1:8314889/96‑1 AGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGA > 2:3389465/1‑96 AGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGA > 1:6599842/1‑96 AGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGA < 2:5544750/96‑1 gtTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGgt > 1:7531747/3‑94 GGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGtt > 2:6753652/1‑94 GGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGAT > 1:2398614/1‑96 GGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGAT < 1:4634941/96‑1 GTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATG < 2:9249054/96‑1 GTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATG < 1:3679732/96‑1 GTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATG < 2:2745001/96‑1 GTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATG < 1:12823903/96‑1 GTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATG > 1:1488680/1‑96 GTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCCCTCCGGTCCCCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATG < 2:10552668/96‑1 TTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGG < 1:6623624/96‑1 TTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCCTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGG > 1:361121/1‑96 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCCCCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC < 2:2905397/96‑1 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC < 1:7296667/96‑1 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC > 2:3678948/1‑96 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC > 2:11467200/1‑96 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC < 2:2476413/96‑1 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC < 2:2576677/96‑1 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC > 1:7689789/1‑96 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC > 2:13353248/1‑96 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC > 2:12462990/1‑96 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC < 1:14250933/96‑1 TTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGC < 2:9285866/96‑1 TACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCG > 2:29390/1‑96 TACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCG < 1:2796012/96‑1 TACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCG < 2:3136994/96‑1 TACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGCCAGGGATGGCG < 2:8697283/96‑1 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGGTTGCGG > 2:1484062/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATTGCGG > 2:3794291/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG < 2:13294300/96‑1 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG > 2:3385865/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG > 1:7944249/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG > 2:10521821/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG > 2:5822787/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG > 1:11720950/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG > 2:6704765/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG > 1:3062700/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG > 1:4073979/1‑96 ACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGACGGCGG > 1:5449374/1‑96 CATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGGTGGgcgt > 2:3136753/1‑92 ATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGGGT > 1:1155651/1‑96 GCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGGTGGCGGGTtc > 1:9746157/1‑94 GCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGGattc > 1:6838366/1‑92 CTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGGGTtct > 2:12832996/1‑93 CTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAG > 1:7013254/1‑96 ACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGG < 2:7013254/96‑1 GATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTT < 2:14207498/96‑1 GATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTT > 2:2558052/1‑96 GATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTT > 1:8068137/1‑96 ATGGCGGGTCTGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGCGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTC < 2:145927/96‑1 ATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGCCTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTC < 2:4457596/96‑1 ATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTC < 2:1259604/96‑1 ATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTC < 2:855668/96‑1 ATGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTC < 2:12200550/96‑1 tcGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGCAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCT < 1:1605937/94‑1 TGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGTCTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCT < 2:6668811/96‑1 TGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCTGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCT < 2:12214604/96‑1 TGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCT < 2:6573065/96‑1 TGGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCT > 2:10274044/1‑96 GGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTT < 2:1833310/96‑1 GGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTT < 1:13134674/96‑1 GGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTT < 2:8405145/96‑1 GGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTT > 1:10847475/1‑96 GGCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTT < 1:10231103/96‑1 GCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGTATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTC > 1:12642376/1‑96 GCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTC > 2:9485650/1‑96 GCGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTC < 2:4756504/96‑1 CGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTtc > 2:10065167/1‑94 CGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTac < 1:7534311/96‑3 CGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCC < 2:3759138/96‑1 CGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCC < 1:9996761/96‑1 CGGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCC < 1:2393670/96‑1 GGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCC > 2:119955/1‑96 GGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCC > 2:4314358/1‑96 GGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCC > 1:7235613/1‑96 GGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCC < 2:209273/96‑1 GGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCC < 1:5530149/96‑1 GGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCC < 2:9156243/96‑1 GGGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCC < 1:13001147/96‑1 GGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCCA < 1:107318/96‑1 GGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCCA > 2:6689276/1‑96 GGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCCA < 2:10209437/96‑1 GGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGGGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCCA > 2:3586373/1‑96 GGTATGGATTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTTACTGGCAACAAGGGAATTTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCCA < 1:7507905/96‑1 GAGGTTTACATGCTTAAACGTTGTCTCTCTCCGCTCACCCTGGTTAATCAGGTTGCGCTTATTGTGTTGCTTTCTACTGCTATTGGACTGGCAGGGATGGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1276850‑1276748 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gatggcggGTATGGCTTACAGCCGTGTGTCGACTTTCTCCGGGGATTATCTCCGCGTAACTGACAACAAGGGAAGGTGCGAATAAGCAGGTCATTTCTTCCCA > NC_000913/1425561‑1425655 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |