Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,027,751 | (C)6→7 | coding (191/921 nt) | yedA → | putative transmembrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,027,745 | 1 | . | C | 85.2% | 603.8 / 92.7 | 209 | coding (185/921 nt) | yedA | putative transmembrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (14/17); new base C (91/87); total (105/104) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAA > NC_000913/2027654‑2027836 | gAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑c < 2:6549628/93‑1 (MQ=255) gAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑c > 2:7251551/1‑93 (MQ=255) aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc > 2:6500589/1‑93 (MQ=255) aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc < 1:3648827/93‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc > 1:7203876/1‑93 (MQ=255) cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑cccccc < 1:3948886/93‑1 (MQ=255) tGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccccccc > 2:1666807/1‑92 (MQ=255) tGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccccccc > 2:5999356/1‑92 (MQ=255) tCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTAc < 1:4458794/93‑1 (MQ=255) tCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGCATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTAc > 2:5481429/1‑93 (MQ=255) ccGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTCTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACg > 1:6096033/1‑93 (MQ=255) cGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTc < 2:2768020/93‑1 (MQ=255) gTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTc > 2:2403028/1‑93 (MQ=255) ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTcc > 1:3898190/1‑93 (MQ=255) aaTGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCgc > 2:5054741/1‑93 (MQ=255) atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCgct > 1:6032930/1‑93 (MQ=255) tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCgctg > 2:1985513/1‑93 (MQ=255) gcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCaa < 1:5297597/93‑1 (MQ=255) gcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCaa < 2:3539493/93‑1 (MQ=255) gcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAAt < 1:5751621/93‑1 (MQ=255) cgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAAt < 1:5382563/93‑1 (MQ=255) cgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcg > 1:1610567/1‑93 (MQ=255) gTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc > 2:5582210/1‑93 (MQ=255) ttCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgcg > 1:7266924/1‑93 (MQ=255) tCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCgcgc < 1:4707975/93‑1 (MQ=255) gATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTg > 2:1154811/1‑93 (MQ=255) aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGa > 2:4701561/1‑93 (MQ=255) aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGa < 2:5948485/93‑1 (MQ=255) aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGa < 1:1477296/93‑1 (MQ=255) aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 1:405283/1‑93 (MQ=255) ttCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 1:266284/1‑93 (MQ=255) ttCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAtt > 2:7470725/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAtt > 1:4575673/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAtt > 1:4329420/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCCCTGCTCAATGCCGCGCTGAtt > 1:2686325/1‑93 (MQ=255) ccTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg < 2:4639388/93‑1 (MQ=255) cTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg > 2:3795681/1‑93 (MQ=255) tGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc < 1:6384344/93‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt < 1:2878017/93‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt < 1:3383808/93‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt < 1:6151337/93‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg > 2:3985070/1‑93 (MQ=255) cAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt < 2:1845263/93‑1 (MQ=255) aGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGtt < 2:1454423/93‑1 (MQ=255) gCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGtt > 2:2450899/1‑93 (MQ=255) gCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGtt > 1:2783352/1‑93 (MQ=255) ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTa < 2:1939761/93‑1 (MQ=255) cGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAt > 1:7456379/1‑93 (MQ=255) gTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg > 1:1995324/1‑93 (MQ=255) tATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgc < 2:737995/93‑1 (MQ=255) tATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgc > 1:6956624/1‑93 (MQ=255) tATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgc > 2:3240085/1‑93 (MQ=255) tATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgc > 2:4251714/1‑93 (MQ=255) aTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg > 1:1872947/1‑93 (MQ=255) ttttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg > 1:6553454/1‑93 (MQ=255) ttttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg < 1:6650229/93‑1 (MQ=255) tttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 2:5881625/93‑1 (MQ=255) tttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 2:3578153/93‑1 (MQ=255) ttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggc > 1:1004814/1‑93 (MQ=255) ttATTGCTGGCATTTTTGCT‑CTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCTTGTTATTgctggct > 2:1224925/1‑93 (MQ=255) tATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct > 1:794153/1‑93 (MQ=255) tATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct > 2:5169179/1‑93 (MQ=255) aTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggctg > 1:327396/1‑93 (MQ=255) ttGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt > 2:5379397/1‑93 (MQ=255) tGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCGGTTATTGCTGGCTGTc < 2:4970076/93‑1 (MQ=255) gCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCg < 2:4149022/93‑1 (MQ=255) gCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCg > 1:1792910/1‑93 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCgg < 1:4226325/93‑1 (MQ=255) gCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa > 1:6777757/1‑93 (MQ=255) gCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa < 2:6948384/93‑1 (MQ=255) cATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAAt < 2:1051387/93‑1 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCGATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg > 1:7302463/1‑93 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg < 2:3059729/93‑1 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg > 2:3146487/1‑93 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg > 1:2472983/1‑93 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc > 1:3457156/1‑93 (MQ=255) ttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 1:4879128/93‑1 (MQ=255) ttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCa < 2:260465/93‑1 (MQ=255) tttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 1:65807/93‑1 (MQ=255) tttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCAt > 1:2318453/1‑93 (MQ=255) gCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:2161928/1‑93 (MQ=255) cTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATggg > 1:7511336/1‑92 (MQ=255) cTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGt < 2:2526102/93‑1 (MQ=255) tACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTg > 2:1658921/1‑93 (MQ=255) aCTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGa < 2:571184/93‑1 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGAc < 1:1039098/93‑1 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGAc > 1:6616163/1‑93 (MQ=255) tGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACg > 1:5856612/1‑93 (MQ=255) tGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACg < 1:4826877/93‑1 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACgg > 1:7335230/1‑93 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACgg > 2:7062786/1‑93 (MQ=255) cgcgGACACAAACGC‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGt < 2:4313065/93‑1 (MQ=255) gcgGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt < 1:3588205/93‑1 (MQ=255) cgGACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTg > 2:1242442/1‑93 (MQ=255) ggACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGc < 2:636290/93‑1 (MQ=255) ggACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGc < 1:5476342/93‑1 (MQ=255) gACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGcc < 2:336797/93‑1 (MQ=255) gACACAAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGcc > 2:397123/1‑93 (MQ=255) ccaAAC‑TC‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGaa < 1:1374163/92‑1 (MQ=255) c‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCaa > 1:4130620/1‑93 (MQ=255) | GAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAA > NC_000913/2027654‑2027836 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |