Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,295,134 | (C)7→8 | coding (525/618 nt) | ccmA ← | ATP binding protein of heme exporter A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,295,127 | 1 | . | C | 81.1% | 605.4 / 140.4 | 217 | coding (532/618 nt) | ccmA | ATP binding protein of heme exporter A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (15/26); new base C (95/81); total (110/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.62e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
AGAACATCATGCGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑T‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCTCGTCGAGGATCC > NC_000913/2295035‑2295216 | aGAACATCATGCGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑t > 1:7017571/1‑93 (MQ=255) aGAACATCATGCGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑t < 2:6202006/93‑1 (MQ=255) aCATCATGCGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑T‑‑ccc < 1:3215678/93‑1 (MQ=255) tcatGCGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑T‑‑cccccc < 1:1331476/93‑1 (MQ=255) tcatGCGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑T‑‑cccccc > 2:6977008/1‑93 (MQ=255) atGCGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑T‑‑cccccccc < 2:2745307/93‑2 (MQ=255) cGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑T‑‑cccccccctgc > 2:4640033/1‑89 (MQ=255) gCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTc < 2:1601341/93‑1 (MQ=255) gCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTc > 2:661441/1‑93 (MQ=255) gCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTcc > 2:5721842/1‑93 (MQ=255) cTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGt > 1:6417096/1‑93 (MQ=255) cTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTa < 2:1953407/93‑1 (MQ=255) tCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTa > 1:2121444/1‑93 (MQ=255) gTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTAtg < 2:3399685/93‑1 (MQ=255) gTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTAtg > 1:5365088/1‑93 (MQ=255) tttGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTAtgc > 1:5649901/1‑93 (MQ=255) tttGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTAtgc < 1:2818014/93‑1 (MQ=255) tttGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTAtgc > 1:3061926/1‑93 (MQ=255) tttGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTAtgc > 1:2467056/1‑93 (MQ=255) tttGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTAtgc > 1:272552/1‑93 (MQ=255) tttGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTAtgct > 2:5899335/1‑93 (MQ=255) gCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTAtgctgc < 1:1146451/93‑1 (MQ=255) tCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGcc > 1:1887293/1‑93 (MQ=255) tCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGcc > 2:2604693/1‑93 (MQ=255) tCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCa < 2:3570770/93‑1 (MQ=255) cAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCAt < 2:5117355/93‑1 (MQ=255) gTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑‑‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACg > 1:2623815/1‑93 (MQ=255) gAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACg > 1:3801282/1‑93 (MQ=255) aaaTGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGc > 1:4346372/1‑93 (MQ=255) aaaTGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGc > 1:7403697/1‑93 (MQ=255) aaaGGCGGCGAATTTTCCTTTCAGCACCGTGGGGCGGCTGGTGGGTAGTCGGAACCACAACC‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGc < 2:2913545/93‑1 (MQ=255) aTGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTg < 1:6133974/93‑1 (MQ=255) tGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTgg < 1:585593/93‑1 (MQ=255) tGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTgg < 2:4220813/93‑1 (MQ=255) tGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTgg > 1:865962/1‑93 (MQ=255) ggcgAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCa > 1:1367133/1‑93 (MQ=255) gcgAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCa > 2:4131943/1‑93 (MQ=255) gcgAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCa > 2:3002866/1‑93 (MQ=255) gAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGa < 1:6498157/93‑1 (MQ=255) aaTTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGAc > 1:6797312/1‑93 (MQ=255) aaTTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGAc < 1:2414999/93‑1 (MQ=255) aaTTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGAc > 2:6673040/1‑93 (MQ=255) aTTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACg > 1:6395650/1‑93 (MQ=255) aTTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGa < 1:5314580/93‑1 (MQ=255) ttttACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TCCCCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACg > 1:3115684/1‑93 (MQ=255) ttttACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGa > 2:4805228/1‑93 (MQ=255) ttttACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGa < 1:2295755/93‑1 (MQ=255) ttttACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGa > 2:6014478/1‑93 (MQ=255) tttACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGAt < 2:4529859/93‑1 (MQ=255) tttACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGAt > 2:2436962/1‑93 (MQ=255) tttACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGAt < 1:4769537/93‑1 (MQ=255) tttACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGAt > 2:436989/1‑93 (MQ=255) cTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGac > 2:63712/1‑93 (MQ=255) cTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGac > 1:4536669/1‑93 (MQ=255) cTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGaca > 2:3748810/1‑93 (MQ=255) tttCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCCCCATACGCTGGGTCAGACGATCGacac < 2:6420062/93‑1 (MQ=255) ttCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGacac > 1:7129796/1‑93 (MQ=255) cAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCTGACGATCGACACCg < 2:5181640/93‑1 (MQ=255) cAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGt < 1:517483/93‑1 (MQ=255) gCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGtt > 2:5622110/1‑93 (MQ=255) aCGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAAc > 2:2650446/1‑93 (MQ=255) aCGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAAc < 1:3431056/93‑1 (MQ=255) gTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGt > 1:5971268/1‑93 (MQ=255) gTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGt > 1:4967023/1‑93 (MQ=255) gTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTc > 1:1074229/1‑93 (MQ=255) tGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCa < 2:2876256/93‑1 (MQ=255) gAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCaa < 2:1155396/93‑1 (MQ=255) aGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAAt > 1:3589612/1‑93 (MQ=255) gCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATc > 2:7186958/1‑93 (MQ=255) gCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATAACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATc > 1:6574413/1‑93 (MQ=255) cGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAACC‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATCCGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATcg < 1:6259701/93‑1 (MQ=255) ggCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATcgcg < 1:1776091/93‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATcgcg < 2:826216/93‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATcgcg > 2:2099686/1‑93 (MQ=255) gCTGGGGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAAAGTCAATcgcg > 1:1485636/1‑93 (MQ=255) cTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCgg < 2:3048012/93‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCgg < 1:1661455/93‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGt < 2:3342298/93‑1 (MQ=255) tggtggGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGt > 1:5225675/1‑93 (MQ=255) ggtggGTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCCGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCCACACCGTTAACGTCAATCGCGGTa > 2:6841726/1‑93 (MQ=255) gggTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTaaaa < 2:2202880/93‑1 (MQ=255) gggTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTaaaa > 1:4170258/1‑93 (MQ=255) gggTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGAGCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTaaaa < 1:6195754/93‑1 (MQ=255) gTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAgg < 2:2322234/93‑1 (MQ=255) gTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAgg > 1:970597/1‑93 (MQ=255) gTAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAgg < 2:1404325/93‑1 (MQ=255) tAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGc < 1:5910118/93‑1 (MQ=255) tAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGc < 2:4007189/93‑1 (MQ=255) tAGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGc < 1:3891082/93‑1 (MQ=255) aGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCt < 1:7265102/93‑1 (MQ=255) aGTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCt < 1:7197450/93‑1 (MQ=255) gTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCtc < 1:4363966/93‑1 (MQ=255) gTCAGAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCtc > 1:3578682/1‑93 (MQ=255) tCAGAATCACAA‑C‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCtcgt > 1:7506869/1‑93 (MQ=255) gAATCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCtcgtcg > 2:5037299/1‑93 (MQ=255) aaTCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCTCCATACGCTGGGTCAGACGATCTACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGCCTCGTCGa < 1:1024694/93‑1 (MQ=255) aTCACAA‑TCCCCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCTCGTCGa > 2:7233371/1‑93 (MQ=255) tCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCTCGTCGAgg < 2:109533/93‑1 (MQ=255) tCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCTCGTCGAgg < 1:505436/93‑1 (MQ=255) tCACAA‑TC‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCTCGTCGAgg > 1:5446931/1‑93 (MQ=255) | AGAACATCATGCGGCCCTCGTTTGCGTCAGTGAAATGCGGCGAATTTTACTTTCAGCAACGTTGAGCGGCTGGTGGGTAGTCAGAATCACAA‑T‑‑CCCCCCCTGCTCCGTATGCTGCGCCATACGCTGGGTCAGACGATCGACACCGTTAACGTCAATCGCGGTAAAAGGCTCGTCGAGGATCC > NC_000913/2295035‑2295216 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |