| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,896,819 | +C | coding (622/657 nt) | ygcU ← | putative oxidoreductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,896,818 | 1 | . | C | 99.6% | 945.6 / ‑4.5 | 279 | coding (623/657 nt) | ygcU | putative oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (160/118); total (161/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896727‑2896905 | ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑c > 2:303125/1‑93 (MQ=255)ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑c < 1:449995/93‑1 (MQ=255)ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑c > 2:6902594/1‑93 (MQ=255) cAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑cc > 1:5811824/1‑92 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑ccga < 2:4309324/93‑4 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑ccgat > 1:6573645/1‑89 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑ccgat > 2:4916890/1‑89 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑ccgat < 1:838917/93‑5 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCgatga > 1:7346168/1‑93 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCgatga < 1:5219561/93‑1 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCgatga < 1:2670357/93‑1 (MQ=255) taGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCgatgatg > 2:6483648/1‑93 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCgatgatga < 1:4966247/93‑1 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCgatgatga < 1:2110575/93‑1 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCgatgatga > 1:1823249/1‑93 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGAtgt > 2:5946477/1‑93 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGAtgt < 1:4780900/93‑1 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGAtgt > 1:3464194/1‑93 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGa < 1:5711127/93‑1 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGa < 1:1366022/93‑1 (MQ=255) gaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACg > 2:5076177/1‑93 (MQ=255) gaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACg > 1:6707689/1‑93 (MQ=255) gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAAt > 2:1388565/1‑93 (MQ=255) gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAAt > 2:6941463/1‑93 (MQ=255) gttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTc < 2:5385172/93‑1 (MQ=255) ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTcc > 2:4157356/1‑93 (MQ=255) gttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCgg < 1:2273725/93‑1 (MQ=255) gttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCgg > 1:5887035/1‑93 (MQ=255) gttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCgg < 2:6022065/93‑1 (MQ=255) ttttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCggg > 1:5049005/1‑93 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc < 1:1147975/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc > 1:4262885/1‑93 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc > 2:568933/1‑93 (MQ=255) ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc > 1:870491/1‑93 (MQ=255) ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc < 1:788628/93‑1 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg > 2:7223752/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg < 1:1501942/93‑1 (MQ=255) gTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcg < 1:2972720/93‑1 (MQ=255) gTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcg > 2:6139199/1‑93 (MQ=255) gAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcgcg > 1:7134613/1‑93 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc < 2:3518864/93‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc < 2:5228204/93‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 2:2345255/93‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 2:512197/93‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 2:1507529/93‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt > 1:1314784/1‑93 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 1:3276094/93‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt < 1:2574994/93‑1 (MQ=255) aaaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTgg > 1:4011128/1‑93 (MQ=255) aaaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTgg < 1:1746728/93‑1 (MQ=255) aaaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTgg > 2:6642923/1‑93 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 2:4571569/1‑93 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc < 2:2037767/93‑1 (MQ=255) gATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCAc > 2:4132189/1‑93 (MQ=255) gATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCAc > 1:6002813/1‑93 (MQ=255) gATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCAc < 2:6351284/93‑1 (MQ=255) ttttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGt > 2:744776/1‑93 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTAC‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 2:5816835/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa < 2:5592576/93‑1 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa > 2:7102373/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 1:5499595/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 2:2818699/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 1:3667767/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 1:5086039/1‑93 (MQ=255) gTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATg > 2:6836560/1‑93 (MQ=255) cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg < 1:1906025/93‑1 (MQ=255) ttCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtgt > 1:7094160/1‑93 (MQ=255) ttCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtgt < 2:438309/93‑1 (MQ=255) ttCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtgt > 2:3601467/1‑93 (MQ=255) cAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa > 1:4414717/1‑93 (MQ=255) cAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa < 2:7330098/93‑1 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg < 2:2838199/93‑1 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg < 2:7295833/93‑1 (MQ=255) atatAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTg > 2:3296201/1‑93 (MQ=255) atatAGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTg < 2:465792/93‑1 (MQ=255) tataGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGc > 1:4636247/1‑93 (MQ=255) aGCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAt < 2:7157918/93‑1 (MQ=255) gCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc > 2:379038/1‑93 (MQ=255) gCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc < 1:2881053/93‑1 (MQ=255) gCACAATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc > 1:6412536/1‑93 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg < 1:3099844/93‑1 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg < 1:6358403/93‑1 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg > 1:6138423/1‑93 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg > 2:6757376/1‑93 (MQ=255) aaTGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGcc > 1:2780304/1‑93 (MQ=255) aaTGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGcc < 2:1345040/93‑1 (MQ=255) aTGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCa > 2:2515506/1‑93 (MQ=255) aTGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCa > 2:1037299/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa < 2:3683985/93‑1 (MQ=255) gCACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAAt > 2:119676/1‑93 (MQ=255) cACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa < 1:6924547/93‑1 (MQ=255) cACCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa > 2:4064968/1‑93 (MQ=255) cctttCGTT‑GCCGATGATGATGTGAGAAATGCCGGGCCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc < 1:5151855/90‑1 (MQ=255) aCCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc > 1:2309843/1‑93 (MQ=255) aCCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc < 2:176039/93‑1 (MQ=255) aCCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc < 1:6827605/93‑1 (MQ=255) aCCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc < 1:1627704/93‑1 (MQ=255) aCCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc < 1:3801403/93‑1 (MQ=255) aCCTTCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc > 2:3100337/1‑93 (MQ=255) ttCGTT‑GCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc < 1:3550872/93‑1 (MQ=255) | CCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTT‑G‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896727‑2896905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |