| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,242 | +C | intergenic (+55/‑342) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,240 | 1 | . | C | 99.4% | 571.3 / ‑4.2 | 175 | intergenic (+53/‑344) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (133/41); total (133/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCT‑CCTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAA > NC_000913/3237148‑3237326 | tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑c < 2:789611/93‑1 (MQ=255) tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑c > 2:4340066/1‑93 (MQ=255) nnggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑c < 2:1453301/91‑1 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑cc < 1:5701240/93‑1 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑cc > 1:3856850/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑cc > 2:5426484/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑cc < 1:6743005/93‑1 (MQ=255) ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑ccc < 1:2445876/93‑2 (MQ=255) gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑ccct < 2:224921/93‑3 (MQ=255) gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑ccct < 1:6540648/93‑3 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑tct‑ccctc > 2:3320847/1‑90 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑Tctccctct‑ccc < 2:7109414/93‑2 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑Tctccctct‑cccttc < 1:858043/93‑5 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑Tctccctct‑cccttc < 1:3627186/93‑5 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑Tctccctct‑cccttc < 1:879868/93‑5 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCa < 2:518318/93‑1 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCa < 1:1317171/93‑1 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCa > 2:2409597/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAg > 1:2773654/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAg > 2:5535164/1‑93 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAgg > 1:3342992/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGga > 1:2260637/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGga > 1:2080082/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGga < 2:1535497/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGga > 1:1644179/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGga > 1:4189686/1‑93 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGgag < 2:5998046/93‑1 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGgag > 2:7148821/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGgaga < 1:6091968/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGgaga < 1:7527732/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGgaga < 1:4294926/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGgaga < 2:532742/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGagag > 2:2625977/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:2170639/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:172081/93‑1 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTACCAGGGAGAggg < 2:4020563/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAgggg > 1:3710858/1‑92 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt > 1:4598408/1‑93 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt > 1:3492140/1‑93 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:5886316/93‑1 (MQ=255) cagcGGGGTGGATTATTATTTAATCTGCCTAAGCCGTGTGCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:891109/93‑1 (MQ=255) cagcGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTc < 1:4547741/93‑1 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCg > 2:4849813/1‑93 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCg < 1:1065140/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg < 2:227987/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg < 2:1203330/93‑1 (MQ=255) ggggTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg < 1:7185669/93‑1 (MQ=255) gggTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt > 2:6841388/1‑93 (MQ=255) tGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg > 1:6938928/1‑93 (MQ=39) ggATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 1:7388248/1‑93 (MQ=39) gATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAggg > 1:190992/1‑93 (MQ=38) gATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAggg > 1:5570662/1‑93 (MQ=38) gATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAggg > 2:3801709/1‑93 (MQ=38) tAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTa > 1:7340932/1‑93 (MQ=38) aTT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAt > 1:5883334/1‑93 (MQ=38) tttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtttt > 1:205864/1‑93 (MQ=38) tttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtttt > 2:7217685/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttttt > 2:2761663/1‑93 (MQ=38) aTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGc > 2:3377244/1‑93 (MQ=38) aTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGc > 1:5202654/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 2:3466670/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 1:1758538/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 1:1423006/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 1:2831320/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 1:6771139/1‑93 (MQ=38) ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGa > 2:608739/1‑93 (MQ=38) cTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt > 2:4074614/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 1:4402664/1‑93 (MQ=38) ccGTGTCCCCTGTCTTTAACATGGCCCCCTTTTCCCCC‑CCCCC‑CCTCCCGGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTgg < 1:1141904/93‑1 (MQ=255) cGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGc > 2:2820134/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 2:7039445/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:644008/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 2:5748873/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 1:6064565/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 2:214884/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt > 1:5801520/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt > 1:2019404/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt > 2:1786484/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt > 1:6830096/1‑93 (MQ=37) cccTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTc > 1:942279/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTtccc > 1:237401/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccc > 2:3697794/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccc > 2:4938308/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTGcccc > 2:2694363/1‑93 (MQ=37) tCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccccc > 2:1570404/1‑91 (MQ=25) cATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCa > 2:6044287/1‑93 (MQ=25) cATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCa > 1:7040322/1‑93 (MQ=25) aTTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAc > 2:6161452/1‑93 (MQ=25) aTTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAc > 2:3450810/1‑93 (MQ=25) aaCATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccccccccccc > 1:4007070/1‑92 (MQ=25) aaCATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCt > 2:631127/1‑93 (MQ=21) aaCATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCCCAcccc > 2:5112886/1‑92 (MQ=25) aCATGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCcccccccccc > 1:2555610/1‑91 (MQ=21) aTGAGCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAAc > 1:1002071/1‑93 (MQ=21) gCACCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCaccctcaccctc > 2:307114/1‑93 (MQ=18) aCCGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCtctc > 1:1099331/1‑93 (MQ=18) ccGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTcc > 2:3241151/1‑93 (MQ=18) ccGTTT‑‑TCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCCAACCCTCTcc > 2:1915564/1‑93 (MQ=18) ttt‑‑tCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCCCCCCCAccccccccccc > 1:5192601/1‑92 (MQ=18) ttt‑‑tCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCa > 2:4760769/1‑93 (MQ=18) | CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATT‑TTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTT‑‑TCT‑CCTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAA > NC_000913/3237148‑3237326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |