| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,847,419 | (C)5→6 | coding (345/1503 nt) | b3668 ← | sensor histidine protein kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,847,414 | 1 | . | C | 84.4% | 835.5 / 151.3 | 295 | coding (350/1503 nt) | b3668 | sensor histidine protein kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (28/18); new base C (124/124); total (153/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.57e-02 | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
CGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATC > NC_000913/3847322‑3847506 | gccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg‑‑c > 2:2791348/1‑93 (MQ=255) gccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg‑‑c > 1:7092600/1‑93 (MQ=255) gccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg‑‑c < 2:1002209/93‑1 (MQ=255) ccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCGACAACGCCGCCGCCGTTAACgccg‑‑cc > 1:4267961/1‑93 (MQ=255) cAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑ccc < 1:5162289/93‑1 (MQ=255) aGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑cccc > 2:4399020/1‑93 (MQ=255) aaaGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑cccccctg < 2:5714826/93‑4 (MQ=255) aGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTaa < 1:1326161/93‑1 (MQ=255) gTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTaa > 2:3921574/1‑93 (MQ=255) gTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTaa > 1:4435018/1‑93 (MQ=255) gTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTaa > 1:3480080/1‑93 (MQ=255) gTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTaa > 1:1539681/1‑93 (MQ=255) tCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACa > 2:4983473/1‑93 (MQ=255) aGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAg > 1:3309444/1‑93 (MQ=255) 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aGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTg > 1:4080828/1‑93 (MQ=255) gcgcATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTg > 2:1177596/1‑93 (MQ=255) gcATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTgcg < 2:2440181/93‑1 (MQ=255) cATTCCACGCCTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACACCGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTgcgc < 2:872261/93‑1 (MQ=255) cATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTgcgc > 1:6101915/1‑93 (MQ=255) aTTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGcc > 2:4063212/1‑93 (MQ=255) aTTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGcc < 2:6356314/93‑1 (MQ=255) aTTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGcc < 2:2142369/93‑1 (MQ=255) aTTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGcc > 2:2555410/1‑93 (MQ=255) ttCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCa > 2:6974082/1‑93 (MQ=255) ttCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCa < 1:2768052/93‑1 (MQ=255) cACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTc > 2:3358411/1‑93 (MQ=255) cACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTc > 1:5064346/1‑93 (MQ=255) cGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCAc < 1:1038766/93‑1 (MQ=255) cGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCAc > 2:384540/1‑93 (MQ=255) cctctTTGCCGTCCAAAAGCAGGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGc < 1:6616613/92‑1 (MQ=255) aCTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGc > 1:460113/1‑93 (MQ=255) ctctTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTg > 2:3594674/1‑93 (MQ=255) tctTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTg > 1:2466062/1‑93 (MQ=255) tctTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTg < 2:5562166/93‑1 (MQ=255) ctTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGAt < 2:7530614/93‑1 (MQ=255) tttGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGAt > 2:5272828/1‑93 (MQ=255) ttGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATg > 2:4534732/1‑93 (MQ=255) ttGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATgg > 2:2919831/1‑93 (MQ=255) tGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATgg < 2:2219081/93‑1 (MQ=255) tGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATgg < 2:7149050/93‑1 (MQ=255) tGCCGTCCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATgg < 1:4556970/93‑1 (MQ=255) gTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGAt > 2:5302328/1‑93 (MQ=255) gTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGAt > 2:4097489/1‑93 (MQ=255) gTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGAt < 1:6847910/93‑1 (MQ=255) gCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAgc > 2:1951242/1‑93 (MQ=255) ccAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGTCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAgc < 2:6215455/93‑1 (MQ=255) ccAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAgc < 2:1422227/93‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAgcgc > 1:1672077/1‑93 (MQ=255) ccAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCgaga < 2:3171367/93‑1 (MQ=255) cAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGAt > 1:5773160/1‑93 (MQ=255) cAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGAt < 1:5273400/93‑1 (MQ=255) aGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATc > 1:2351725/1‑93 (MQ=255) gggCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCa > 1:3899838/1‑93 (MQ=255) ggCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCa > 2:7475135/1‑93 (MQ=255) ggCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAg < 2:3515915/93‑1 (MQ=255) gCAGCGACTGCAACAGCGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAgc < 1:7184578/93‑1 (MQ=255) cAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAgcg > 1:2620198/1‑93 (MQ=255) cGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTAc < 1:2228874/93‑1 (MQ=255) gACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTAc < 2:831797/93‑1 (MQ=255) gACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACg > 2:5924174/1‑93 (MQ=255) aCTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACg < 2:2859454/93‑1 (MQ=255) cTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACgg > 2:1737001/1‑93 (MQ=255) cTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACgg < 2:3279692/93‑1 (MQ=255) cTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACgg > 1:3031216/1‑93 (MQ=255) tGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAATGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACggg > 1:780756/1‑93 (MQ=255) tGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACggg > 2:6413084/1‑93 (MQ=255) caacaaCGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCa < 2:6481614/93‑1 (MQ=255) aacaacGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAg > 2:5845114/1‑93 (MQ=255) aacaacGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAg > 2:340850/1‑93 (MQ=255) acaacGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGt > 1:5210781/1‑93 (MQ=255) aacGCCCCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTaa < 1:1227446/93‑1 (MQ=255) acGCCGCCGCCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAAc > 1:195007/1‑93 (MQ=255) acGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACg > 1:1108340/1‑93 (MQ=255) acGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACg > 1:5516927/1‑93 (MQ=255) acGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACg > 2:5021042/1‑93 (MQ=255) cgccgccgcCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACg > 2:735208/1‑93 (MQ=255) cgccgccgcCGTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACg > 2:7257468/1‑93 (MQ=255) ccgccgccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTc < 2:5341170/93‑1 (MQ=255) ccgccgccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTc < 1:2688687/93‑1 (MQ=255) cgccgccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCa > 2:6151919/1‑93 (MQ=255) cgccgccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCa < 1:4750159/93‑1 (MQ=255) gccgccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAg < 1:1823729/93‑1 (MQ=255) ccgccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGt < 1:2318712/93‑1 (MQ=255) ccgccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGt > 1:3526296/1‑93 (MQ=255) cgccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTa < 1:3798990/93‑1 (MQ=255) ccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTaaa > 1:1991543/1‑93 (MQ=255) ccgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTaaa < 1:6434572/93‑1 (MQ=255) cgTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTaagc < 2:6661616/93‑3 (MQ=255) gTTAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACt > 1:41217/1‑93 (MQ=255) tAACGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTAc < 2:2102357/93‑1 (MQ=255) aCGCCGC‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCg < 1:2151611/93‑1 (MQ=255) g‑‑ccCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGatcatc < 2:1335092/93‑1 (MQ=255) | CGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑‑CCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATC > NC_000913/3847322‑3847506 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |