| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,951,166 | +C | coding (35/1818 nt) | ilvD → | dihydroxyacid dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,951,166 | 1 | . | C | 88.3% | 990.3 / 87.1 | 352 | coding (35/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (39/2); new base C (81/229); total (121/231) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.56e-18 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC > NC_000913/3951074‑3951248 | gagaCAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCCCCACCCCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑gg < 1:4851723/93‑1 (MQ=255) agacagacACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑gg‑g > 2:7051257/1‑93 (MQ=255) acagacaCTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑ggcgc < 1:412369/93‑4 (MQ=255) ggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGaa < 1:1569347/93‑1 (MQ=255) gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 1:927478/93‑1 (MQ=255) gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 2:4825269/93‑1 (MQ=255) gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 2:5406808/93‑1 (MQ=255) taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAc < 1:103815/93‑1 (MQ=255) aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAcc < 1:741572/93‑1 (MQ=255) aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAcc < 1:353788/93‑1 (MQ=255) ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGa < 1:845191/93‑1 (MQ=255) ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGa < 1:3196846/93‑1 (MQ=255) ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGa < 1:6065333/93‑1 (MQ=255) taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGAc < 2:5333102/93‑1 (MQ=255) aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGc < 2:957574/93‑1 (MQ=255) aGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGcc < 2:2663605/93‑1 (MQ=255) aGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGCGTGCTCCTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGGATGACCGACGcc > 1:5906495/1‑93 (MQ=255) tATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCgc > 2:3662612/1‑92 (MQ=255) aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAt < 2:1412959/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 2:5986847/93‑1 (MQ=255) ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 1:6983791/93‑1 (MQ=255) ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 1:986790/93‑1 (MQ=255) tAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCgg < 1:2046976/93‑1 (MQ=255) aaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGTGCGCCGGGG‑GG‑GG‑GCCCCGGGAAGACCGACGCAGACTTCGGt > 1:7516668/1‑93 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTa < 1:3000627/93‑1 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCCGAATGACCGACGCCGCTTTCggga > 2:1658526/1‑91 (MQ=255) tACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 1:5229961/93‑1 (MQ=255) aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGc < 1:6343984/93‑1 (MQ=255) aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGTGGG‑GCGCCACCGGGATGACCGACGCCGATTTTGGTAAGc > 2:2992113/1‑93 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGcc < 2:3222798/93‑1 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGGGGGC‑‑TGTGGG‑GCGCCCCCGGGATGACCGACCCCGACTTCGGTAAGcc > 2:126234/1‑93 (MQ=255) cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCg < 1:7289263/93‑1 (MQ=255) cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGGGC‑‑CGT‑GGCGCGCCACCCGAAAGACCGACGCCCATTTCGGTAAGCCg > 2:6868591/1‑93 (MQ=255) gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGa < 1:368293/93‑1 (MQ=255) gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGa < 1:2628252/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 2:4374603/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 1:5304233/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCCCCGGAATGACCGACGCCGATTTTGGTAAGACGAt > 2:6375495/1‑93 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGGATGACCGACGCCGCTTTCGGTAAGCCGAt > 2:2059183/1‑93 (MQ=255) tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAtt < 1:1120083/93‑1 (MQ=255) cGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAt < 2:2032299/93‑1 (MQ=255) gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:4886070/93‑1 (MQ=255) gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:5446489/93‑1 (MQ=255) gCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGTGGG‑GCGCCCCCCGGATGAACGACCCCGGTTTTGGGAAGCCGATTTTc > 2:5154059/1‑93 (MQ=255) ccaccaccaCTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCCGGATGACCGACCCCCCCTTCCGTTAACCCATTATcc > 1:5481670/1‑92 (MQ=255) caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 1:3866044/93‑1 (MQ=255) 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ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TCT‑GGCGCGCCACCGGCAAGACCGACCCCGCATTTGGGAAGCCGGTTATCCCGGAtg > 2:2270777/1‑93 (MQ=255) ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGCGGGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAAAGACCCAAGCCGATTTTCGTAAGCCGAATATCGCGGTtg > 2:4027117/1‑93 (MQ=255) cacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtgt < 2:7275722/93‑1 (MQ=255) cTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGa < 1:18116/93‑1 (MQ=255) cTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCCGGATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGGTGTGa > 2:6668332/1‑93 (MQ=255) aTGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACt < 1:1931831/93‑1 (MQ=255) tGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTc < 2:6217645/93‑1 (MQ=255) tGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCCCCGGAATGACCGACCCCGACTTTGGTAAGCCGATTATTGCGGTTGTGGACTc > 1:5815698/1‑93 (MQ=255) ggTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCg < 2:2124657/93‑1 (MQ=255) gTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGt < 2:5820597/93‑1 (MQ=255) gTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGt < 1:6453782/93‑1 (MQ=255) gTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCCC‑‑CGT‑GGCGCGCCACCCGGATGACCGACCCCCATTTCTGGAAGCCGAATATCGCGGGTGTGAACTCGt > 2:1835021/1‑93 (MQ=255) tCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGtt < 2:4020692/93‑1 (MQ=255) tCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGtt < 2:7165877/93‑1 (MQ=255) cGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 1:2415418/93‑1 (MQ=255) tAATATGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGGATGAACGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGGTGTGAACTCGTTCAc > 2:7379058/1‑93 (MQ=255) aaTATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAcc < 1:229251/93‑1 (MQ=255) atatGGCGGGGGCTCGTGCGC‑‑TGTGGG‑GCGCCCCCGGAATGACCGACGCCGATTTCTGGAAGCCGATTATTGCGGGTGTGAACTCGTTTAccc > 2:3819537/1‑93 (MQ=255) atGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 2:1102658/93‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAtt > 1:3451728/1‑93 (MQ=255) gCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt < 2:4552445/93‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt < 2:4965476/93‑1 (MQ=255) cGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTg < 2:2505553/93‑1 (MQ=255) cGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTg < 2:5625899/93‑1 (MQ=255) ggTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa > 1:1304150/1‑93 (MQ=255) gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:3586425/93‑1 (MQ=255) gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:6603125/93‑1 (MQ=255) gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:6512653/93‑1 (MQ=255) gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:2733269/93‑1 (MQ=255) gTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 1:213888/93‑1 (MQ=255) tGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 1:3128340/93‑1 (MQ=255) tGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 1:1467639/93‑1 (MQ=255) tGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 2:6279802/93‑1 (MQ=255) gCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg < 2:3161799/93‑1 (MQ=255) gCTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg > 1:444801/1‑93 (MQ=255) cTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 1:4013517/93‑1 (MQ=255) cTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg > 2:1899041/1‑93 (MQ=255) cTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg < 2:1331193/93‑1 (MQ=255) cTCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATATCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg > 2:2932866/1‑93 (MQ=255) tCGTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg < 2:3290640/93‑1 (MQ=255) gTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc < 2:1206985/93‑1 (MQ=255) gTGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc > 1:6735586/1‑93 (MQ=255) tGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCa > 2:4733837/1‑93 (MQ=255) tGCGC‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCa > 2:1065487/1‑93 (MQ=255) gcgc‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc > 2:6808347/1‑93 (MQ=255) gcgc‑‑TGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc > 2:1587199/1‑93 (MQ=255) | GAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGC‑‑TGT‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC > NC_000913/3951074‑3951248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |