| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,951,168 | +G | coding (37/1818 nt) | ilvD → | dihydroxyacid dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,951,168 | 1 | . | G | 96.9% | 969.7 / 13.2 | 351 | coding (37/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (10/1); new base G (110/230); total (120/231) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
CAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC > NC_000913/3951078‑3951248 | gAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAAt < 1:3635248/93‑1 (MQ=255) gAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAAt < 2:4162899/93‑1 (MQ=255) gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 1:927478/93‑1 (MQ=255) gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 2:4825269/93‑1 (MQ=255) gTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCCGT‑‑GGCGCGCCACCCGAATGa > 2:3705404/1‑93 (MQ=255) taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGAc < 1:103815/93‑1 (MQ=255) taaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGAc < 2:6672631/93‑1 (MQ=255) ataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGa < 2:5445671/93‑1 (MQ=255) taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGAc < 2:154099/93‑1 (MQ=255) aaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCCGAAAGAacgacg > 2:1403606/1‑93 (MQ=255) aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGc < 2:5944449/93‑1 (MQ=255) aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGc < 2:957574/93‑1 (MQ=255) aGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGcc < 2:2663605/93‑1 (MQ=255) gTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGGTCGTCGGCTGT‑‑GGCGCGCCACCCGGATGAACGACCCCg > 2:2151171/1‑93 (MQ=255) gTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCg < 2:255265/93‑1 (MQ=255) gTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCCGGATGACCGacgacg > 2:6301056/1‑93 (MQ=255) tATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACCCCGa > 2:1924704/1‑93 (MQ=255) aTGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAt < 2:706215/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 2:2110608/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 1:2062297/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 2:2423523/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 1:2489241/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 2:658216/93‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGGAAGACCGCCGCCGAtt > 2:3463560/1‑93 (MQ=255) ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 2:1329496/93‑1 (MQ=255) ccTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTc < 1:986790/93‑1 (MQ=255) tAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCgg < 1:7186411/93‑1 (MQ=255) tAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCgg < 1:3507159/93‑1 (MQ=255) aaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGt < 2:6184108/93‑1 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTa < 1:3000627/93‑1 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGTGCGCTGTGGGG‑GG‑CCCCCGGGATGAACGGCGCCGATTTTGGTa > 1:4749795/1‑93 (MQ=255) aGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCCGGATGAACGACGCCGATTTCGGTa > 2:5675192/1‑93 (MQ=255) gTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 2:5355499/93‑1 (MQ=255) tACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 1:5229961/93‑1 (MQ=255) aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTG‑GG‑GCGCCACCGGGATGACCGACGCCGATTTTGGTAAGc > 2:2992113/1‑93 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGcc < 1:3890224/93‑1 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCCGAATGAACGACGCCCAGTTCGGTCAGcc > 2:1708169/1‑93 (MQ=255) cGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGGGCCGT‑‑GGCGCGCCACCCGAAAGACCGACGCCCATTTCGGTAAGCCg > 2:6868591/1‑93 (MQ=255) gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGa < 1:2628252/93‑1 (MQ=255) gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCCGT‑‑GGCGCGCCCCCCGGATGAACGACGCCCATTTCTGTAAGCCGa > 2:4354547/1‑93 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 1:4074832/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 2:7199156/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCCTGCGCTGTGGGG‑GG‑CCCCCCGGATGACCCACGCCCATTTTGGTAAGCCCAt > 1:791277/1‑93 (MQ=255) tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAtt < 1:1120083/93‑1 (MQ=255) tCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAtt < 2:450027/93‑1 (MQ=255) ccGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTa < 1:181518/93‑1 (MQ=255) ccGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTa < 1:4339013/93‑1 (MQ=255) cGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAt < 2:4724450/93‑1 (MQ=255) ccaccaccaCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcg < 1:2172971/93‑1 (MQ=255) ccaccaccaCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcg < 1:6866444/93‑1 (MQ=255) caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 1:4587403/93‑1 (MQ=255) caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATtgc > 2:1757004/1‑93 (MQ=255) accaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgcg < 2:2753667/93‑1 (MQ=255) accaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgcg < 1:2753093/93‑1 (MQ=255) 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ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtg < 1:7369673/93‑1 (MQ=255) ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGCGGGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAAAGACCCAAGCCGATTTTCGTAAGCCGAATATCGCGGTtg > 2:4027117/1‑93 (MQ=255) cacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtgt < 1:3276925/93‑1 (MQ=255) cacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtgt < 2:7275722/93‑1 (MQ=255) cacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtgt < 2:1619560/93‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCCCCGGGATGACCGACGCCGCTTTTGGTAAGCCCATTATCTCGGTTGTGaa > 1:5599875/1‑93 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTG‑GG‑GCGCCCCCGGGATGACCGACGCCGATTTTGGTTAGCCGATTATTGCGGTtgtgga > 2:5122674/1‑91 (MQ=255) aTGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACt < 1:6281971/93‑1 (MQ=255) tGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTc < 2:552287/93‑1 (MQ=255) tGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGTGCGCCGTG‑GG‑GCGCCCCCGGGATGACCGACACCGACTTCGGTAAGGCGGTTATCCCGGGTGTGGACTc > 2:2268671/1‑93 (MQ=255) tGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGTGCGCTGTG‑GG‑GCGCCACCGGAATGAACGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAATc > 2:1234548/1‑93 (MQ=255) gTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGt < 2:3215287/93‑1 (MQ=255) cGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 1:1938012/93‑1 (MQ=255) gTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCa < 1:6361901/93‑1 (MQ=255) gTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCa < 1:5854609/93‑1 (MQ=255) aaTATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAcc < 1:229251/93‑1 (MQ=255) atGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 2:1102658/93‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAtt < 2:6223088/93‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAAttt < 2:4965476/93‑1 (MQ=255) gggTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGt > 1:3716170/1‑93 (MQ=255) ggTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa < 2:362732/93‑1 (MQ=255) ggTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa > 1:1304150/1‑93 (MQ=255) gTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 1:5412772/93‑1 (MQ=255) gTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 1:5964703/93‑1 (MQ=255) gTGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAc < 2:6603125/93‑1 (MQ=255) tGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 1:3128340/93‑1 (MQ=255) tGCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 1:1467639/93‑1 (MQ=255) gCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg < 2:3161799/93‑1 (MQ=255) gCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg > 2:3543785/1‑93 (MQ=255) gCTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTCCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCg < 2:1857391/93‑1 (MQ=255) cTCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATATCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCgg > 2:2932866/1‑93 (MQ=255) tCGTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCggg < 2:3290640/93‑1 (MQ=255) gTGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTc < 2:1206985/93‑1 (MQ=255) tGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTCCCGGGTCa < 2:4862204/93‑1 (MQ=255) tGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCa < 2:6433769/93‑1 (MQ=255) tGCGCTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCa > 2:1065487/1‑93 (MQ=255) gcgcTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc > 2:6808347/1‑93 (MQ=255) gcgcTGT‑‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc < 2:400643/93‑1 (MQ=255) | CAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAC > NC_000913/3951078‑3951248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |