| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,957,124 | +G | intergenic (+58/+26) | ilvC → / ← ppiC | ketol‑acid reductoisomerase/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,957,123 | 1 | . | G | 97.9% | 1138.1 / 5.9 | 382 | intergenic (+57/+27) | ilvC/ppiC | ketol‑acid reductoisomerase/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/0); new base G (106/267); total (115/267) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.38e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 413 total aligned reads displayed.
GACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGA‑‑CTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AA‑GCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTC > NC_000913/3957033‑3957210 | gACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑aa < 2:6203091/93‑1 (MQ=21)gACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑aa < 1:4340448/93‑1 (MQ=21)gACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑aa < 1:4273713/93‑1 (MQ=21)gACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑aa < 1:3610067/93‑1 (MQ=21) atatGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGATAACACTC‑AA‑ggcct < 2:6454326/93‑5 (MQ=21) atatGAAACGTATTGCTGTTGCGAGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AA‑ggcct < 1:1522566/93‑5 (MQ=18) tatGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCACCCCCCCC‑‑CTCTCCCCCAGGGGGAGG‑GGGGAAACACTCAAA‑GCCtt > 2:718416/1‑93 (MQ=18) atGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTtc < 2:2198483/93‑1 (MQ=18) atGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTtc < 1:4654929/93‑1 (MQ=18) tGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTtct < 2:2343567/93‑1 (MQ=18) tGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTtct < 2:4309308/93‑1 (MQ=18) gAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTtctc < 1:6644371/93‑1 (MQ=18) gAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTtctc < 2:5572490/93‑1 (MQ=18) aCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTg < 1:2532422/93‑1 (MQ=18) aCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTg < 1:7073373/93‑1 (MQ=18) aCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTg < 2:1786916/93‑1 (MQ=18) aCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCCCA‑‑CCCCCACCCCCTCCCCCCGCGAGAGG‑GAGAAAACACCC‑AACGCCTTCTCCTg > 2:1020134/1‑93 (MQ=16) gTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACCGGGGGAGG‑GGGAAAACACTCAAA‑GCCCTCTCCTCga > 2:4839186/1‑93 (MQ=18) gTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGga < 2:3229776/93‑1 (MQ=18) ttGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGaa < 1:7419598/93‑1 (MQ=18) ttGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGaa < 2:4064336/93‑1 (MQ=18) ttGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGaa < 2:1385545/93‑1 (MQ=21) ttGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGaa < 1:1042997/93‑1 (MQ=18) gCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAgg < 2:5822223/93‑1 (MQ=18) cTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCC‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGc < 1:1601308/93‑1 (MQ=18) cTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGc < 1:5983613/93‑1 (MQ=18) cTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGc < 2:2890828/93‑1 (MQ=18) tGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGcc < 2:591435/93‑1 (MQ=18) gTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCCCCCC‑‑CCCCCC‑‑CCCTCCCCCAGGGGGGGG‑GGGAAAAAACTCAAA‑GCCCTCTCCCTGGGAAgggcc > 1:3721389/1‑90 (MQ=9) gTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCt < 1:5504766/93‑1 (MQ=18) gTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCt < 2:4762407/93‑1 (MQ=18) tGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTg < 1:2098444/93‑1 (MQ=18) tGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTg < 1:641766/93‑1 (MQ=18) gCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGc < 1:7229567/93‑1 (MQ=18) gCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGc < 2:5393144/93‑1 (MQ=18) gggTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACCCTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTa < 2:2540807/93‑1 (MQ=18) ggTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTAt < 1:3090853/93‑1 (MQ=18) ttAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTa < 2:2143146/93‑1 (MQ=18) tAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAg < 1:1856043/93‑1 (MQ=18) tAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAg < 1:1985038/93‑1 (MQ=18) aaGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGt < 2:7498528/93‑1 (MQ=18) gTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGATAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTg < 1:5610471/93‑1 (MQ=18) tGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGc < 2:7322482/93‑1 (MQ=21) cgcTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTa < 1:4078766/93‑1 (MQ=21) gcTGATG‑‑CCCTCACCCCCCCC‑‑CTCTCCCCCAGGGGGGGG‑GGGAAAACACCC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTAc > 1:6079129/1‑93 (MQ=16) gcTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTAc < 1:668962/93‑1 (MQ=21) cTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACa < 2:301339/93‑1 (MQ=21) tGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAg < 2:7450691/93‑1 (MQ=25) aTG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCa < 1:1168425/93‑1 (MQ=25) tG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCAc < 2:2769643/93‑1 (MQ=25) g‑‑CCCTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCAcc < 1:5131444/93‑1 (MQ=25) cccTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCt < 2:1860029/93‑1 (MQ=25) cccTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCt < 2:6784023/93‑1 (MQ=25) ccTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCtt < 1:442348/93‑1 (MQ=25) cTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCCCAGGGGGAGG‑GGGAAAAAACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTa > 2:2480432/1‑93 (MQ=255) cTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTa < 1:4889566/93‑1 (MQ=37) cTCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTa > 2:3077036/1‑93 (MQ=37) tCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTaa > 2:1989154/1‑93 (MQ=37) tCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTaa < 2:5250433/93‑1 (MQ=37) tCA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTaa < 1:979458/93‑1 (MQ=37) cA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAat < 1:2281938/93‑1 (MQ=37) cA‑‑CCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAat > 1:1637760/1‑93 (MQ=37) accctctCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGa > 2:1273191/4‑93 (MQ=255) accctctCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGa < 2:7094255/90‑1 (MQ=255) ccctctCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGat > 2:3320665/3‑93 (MQ=255) ccctctCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGat < 2:3776040/91‑1 (MQ=255) cctctCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGata < 1:684264/92‑1 (MQ=255) ctctCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGatat > 2:5077752/1‑93 (MQ=255) cctcCCACAGGGAGAGGCGAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGatat < 1:6172927/92‑1 (MQ=255) ctcCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATcc < 1:1009669/93‑1 (MQ=255) ctcCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATcc > 2:4204355/1‑93 (MQ=255) ctcCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATcc < 2:3451972/93‑1 (MQ=255) tcCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCg > 2:6923014/1‑93 (MQ=255) tcCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCg > 1:5220962/1‑93 (MQ=255) cccACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGa < 1:754230/93‑1 (MQ=255) ccACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGaa > 2:3831131/1‑93 (MQ=255) ccACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGaa < 1:3524667/93‑1 (MQ=255) cacaGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAAc < 1:2351008/93‑1 (MQ=255) cacaGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAAc < 1:5290517/93‑1 (MQ=255) cacaGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAAc < 1:499455/93‑1 (MQ=255) cacaGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAAc > 2:4631926/1‑93 (MQ=255) gggagagg‑gagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTggg > 2:5983903/1‑93 (MQ=255) ggagagg‑gagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgt < 1:6560707/93‑1 (MQ=255) ggagagg‑gagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgt < 1:584520/93‑1 (MQ=255) agagg‑gagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtgt < 2:3679227/93‑1 (MQ=255) agagg‑gagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtgt < 1:5734925/93‑1 (MQ=255) agagg‑gagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGgtgt < 1:3323768/93‑1 (MQ=255) gagg‑gagaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGtgtg < 1:2635583/93‑1 (MQ=255) gaAAACACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCgg < 2:6258644/93‑1 (MQ=255) aaaaCACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCggg < 1:3423524/93‑1 (MQ=255) aaaaCACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCggg > 1:734785/1‑93 (MQ=255) aaaCACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc < 1:1358480/93‑1 (MQ=255) aaaCACTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGc < 1:1303850/93‑1 (MQ=255) acacTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCg < 2:4416793/93‑1 (MQ=255) cacTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCgg < 2:2732323/93‑1 (MQ=255) cacTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCgg < 2:3959475/93‑1 (MQ=255) cacTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCgg < 1:6935897/93‑1 (MQ=255) cacTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCgg < 1:2870514/93‑1 (MQ=255) acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGt > 2:1735684/1‑93 (MQ=255) acTC‑AAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGt < 2:6373364/93‑1 (MQ=255) | GACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATG‑‑CCCTCA‑‑CCCCGA‑‑CTCTCCCACAGGGAGAGG‑GAGAAAACACTC‑AA‑GCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTC > NC_000913/3957033‑3957210 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |