| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,448,541 | +C | intergenic (+46/‑92) | ytfQ → / → ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,448,541 | 1 | . | C | 99.2% | 711.1 / ‑1.9 | 246 | intergenic (+46/‑92) | ytfQ/ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (143/101); total (144/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CG‑G‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCG > NC_000913/4448450‑4448623 | tACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑Cgc > 1:6722404/1‑92 (MQ=255)tACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑Cgc > 1:3245431/1‑92 (MQ=255)tACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑Cgc > 2:5395026/1‑92 (MQ=255) aCCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑Cgcg > 1:4391703/1‑91 (MQ=255) ccGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑Cgcgc < 2:3073286/93‑4 (MQ=255) ccGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑Cgcgc < 2:4089614/93‑4 (MQ=255) cGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑Cgcgcc < 2:332718/93‑5 (MQ=255) aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg > 2:2707693/1‑93 (MQ=37) agaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGc < 2:1318646/93‑1 (MQ=37) agaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGc > 1:4348826/1‑93 (MQ=37) gaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCg > 2:6063031/1‑93 (MQ=37) gaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCg > 2:5019078/1‑93 (MQ=37) aaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGa > 1:5622992/1‑93 (MQ=37) aaTTAGAGAAGAAGAAAAAGATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGa < 2:3423477/93‑1 (MQ=25) aTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGAt > 1:4928048/1‑93 (MQ=37) aTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGAt > 1:5207220/1‑93 (MQ=37) ttAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATg > 2:1515780/1‑93 (MQ=37) tAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATgg > 2:6259482/1‑93 (MQ=37) agaagaagaAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGc < 2:5721487/93‑1 (MQ=37) gaagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCa > 1:2526579/1‑93 (MQ=37) aagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCAc < 1:4012173/93‑1 (MQ=37) agaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACt > 2:2920139/1‑93 (MQ=37) gaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTg > 1:2955843/1‑93 (MQ=37) agaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGaa > 2:4692212/1‑93 (MQ=37) gaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAg > 1:1822832/1‑93 (MQ=37) aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc > 2:1955109/1‑93 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa > 1:5325376/1‑93 (MQ=37) tatGGGGTATTGGGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt < 1:6473544/93‑1 (MQ=25) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 1:4091542/1‑93 (MQ=25) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 2:5913782/1‑93 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt < 2:4385149/93‑1 (MQ=25) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 2:2840495/1‑93 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 1:2612497/1‑93 (MQ=37) atGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAGG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATg < 2:323074/93‑1 (MQ=37) tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 1:4555668/1‑93 (MQ=25) gggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGa < 2:1548424/93‑1 (MQ=25) gggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGa < 1:1139022/93‑1 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 1:5713459/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 1:5996184/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 2:2740288/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 2:4598861/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 1:7317746/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 1:1877079/1‑93 (MQ=25) aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt > 1:2242021/1‑93 (MQ=25) aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt < 1:7496355/93‑1 (MQ=25) tGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTa < 2:2060734/93‑1 (MQ=25) gAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAc > 2:1157098/1‑93 (MQ=25) aGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAcc < 1:7146641/93‑1 (MQ=25) gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCGCTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 2:2392762/1‑93 (MQ=25) gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 2:2314919/1‑93 (MQ=25) ttGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcgg > 1:5847453/1‑92 (MQ=25) tGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTc < 1:3182820/93‑1 (MQ=25) gCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCt > 1:86725/1‑93 (MQ=25) gCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCt < 1:3429580/93‑1 (MQ=25) gCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCt < 1:2932914/93‑1 (MQ=25) gCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCt > 1:5375207/1‑93 (MQ=25) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCTCCCG‑C‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa > 1:5086182/1‑93 (MQ=21) tGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGCCGCCCC‑‑CG‑C‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATc < 1:4059554/93‑1 (MQ=21) tGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATc > 2:580805/1‑93 (MQ=21) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa > 2:4892112/1‑93 (MQ=21) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa > 2:4903233/1‑93 (MQ=21) ccTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAt < 2:4214896/93‑1 (MQ=21) ccTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAt < 1:6564613/93‑1 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg > 1:6443873/1‑93 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg > 1:3604922/1‑93 (MQ=21) tGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGc > 2:6380196/1‑93 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 2:5188721/93‑1 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 1:3926248/93‑1 (MQ=21) aTGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCt > 1:2843619/1‑93 (MQ=21) tGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTa > 2:6825438/1‑93 (MQ=21) tGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTa > 2:4842893/1‑93 (MQ=21) tGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTa > 1:1112484/1‑93 (MQ=21) gCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTAc < 1:1237718/93‑1 (MQ=21) gCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTAc > 2:1124695/1‑93 (MQ=21) cGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTg > 1:5732432/1‑93 (MQ=21) gATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTgg < 1:3513714/93‑1 (MQ=21) aTTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg > 1:2077373/1‑93 (MQ=21) ttCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa > 2:3793551/1‑93 (MQ=18) ttCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa < 1:2736519/93‑1 (MQ=21) tCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAg < 2:7432058/93‑1 (MQ=21) gTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa > 1:380861/1‑93 (MQ=21) gTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa < 2:7149799/93‑1 (MQ=21) tAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCAc > 2:1285063/1‑93 (MQ=21) aGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACg < 1:7230795/93‑1 (MQ=21) ggCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGc < 1:1489832/93‑1 (MQ=21) ggCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGc < 1:5748285/93‑1 (MQ=21) gCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt > 1:4579200/1‑93 (MQ=21) gCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt < 2:6991389/93‑1 (MQ=21) gCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt > 2:2640578/1‑93 (MQ=21) cGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCttt > 2:6339686/1‑93 (MQ=21) ggATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTa < 1:707388/93‑1 (MQ=21) gATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 2:3768332/1‑93 (MQ=21) gATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac < 2:5131447/93‑1 (MQ=25) gATAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 1:4698327/1‑93 (MQ=21) aTAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTaca > 2:5612093/1‑93 (MQ=25) tAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTacac < 2:1715684/93‑1 (MQ=25) tAAG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTacac > 2:5318358/1‑93 (MQ=25) aaG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACAcc < 1:2675542/93‑1 (MQ=25) aaG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACAcc > 2:3664378/1‑93 (MQ=25) aG‑‑GCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCg < 2:6786168/93‑1 (MQ=25) | TACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAG‑‑GCGCT‑‑CG‑G‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCG > NC_000913/4448450‑4448623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |