| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,448,543 | +C | intergenic (+48/‑90) | ytfQ → / → ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,448,542 | 1 | . | C | 99.2% | 719.9 / ‑1.6 | 246 | intergenic (+47/‑91) | ytfQ/ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (143/101); total (144/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
AAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CG‑G‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCG > NC_000913/4448461‑4448623 | aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg > 2:2707693/1‑93 (MQ=37)aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg > 1:5184553/1‑93 (MQ=37)aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg < 1:4296606/93‑1 (MQ=37)aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCgg < 2:2781884/93‑1 (MQ=37) gaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCg > 2:5019078/1‑93 (MQ=37) aaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGa > 1:5952261/1‑93 (MQ=37) aaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGa > 1:5622992/1‑93 (MQ=37) aaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGa < 2:2727869/93‑1 (MQ=37) ttAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATg < 2:370847/93‑1 (MQ=37) ttAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATg > 2:1515780/1‑93 (MQ=37) agaagaagaAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGc < 2:1580558/93‑1 (MQ=37) agaagaagaAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGc < 1:7123884/93‑1 (MQ=37) aagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCAc < 1:4012173/93‑1 (MQ=37) agaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACt > 1:778534/1‑93 (MQ=37) gaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTg > 2:5325257/1‑93 (MQ=37) agaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGaa > 1:2645404/1‑93 (MQ=37) gaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAg > 1:5749213/1‑93 (MQ=37) aaaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGc < 1:4044776/93‑1 (MQ=37) aaaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGc < 1:5722209/93‑1 (MQ=37) aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc > 2:1955109/1‑93 (MQ=37) aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc < 2:6008745/93‑1 (MQ=37) aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc < 1:1989271/93‑1 (MQ=37) aaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCt > 1:6446466/1‑93 (MQ=37) aaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCt < 2:3959610/93‑1 (MQ=37) aaTATGGGGTATTGAGGTTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTGGGCGGGAAAGGGCCCT‑‑CGCGCCCCACCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg < 1:2520544/93‑1 (MQ=255) aaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg > 2:3028803/1‑93 (MQ=37) aaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg < 1:2799070/93‑1 (MQ=37) aaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg > 2:1215862/1‑93 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa < 1:1200016/93‑1 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa < 2:3385002/93‑1 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa > 1:5325376/1‑93 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 2:2885801/1‑93 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt < 2:4289226/93‑1 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 1:4091542/1‑93 (MQ=25) atGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAGGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATg < 2:323074/93‑1 (MQ=37) tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 1:6728920/1‑93 (MQ=25) tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 1:7277802/1‑93 (MQ=25) tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 1:4555668/1‑93 (MQ=25) gggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGa < 1:1139022/93‑1 (MQ=25) gggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCCCC‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGa < 1:2940679/93‑1 (MQ=25) ggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGAc < 1:2881673/93‑1 (MQ=25) gTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACg > 1:6489060/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 2:4598861/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 1:1877079/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 2:2588681/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc > 1:7210117/1‑93 (MQ=25) aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt < 2:5733596/93‑1 (MQ=25) aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt > 1:2242021/1‑93 (MQ=25) tGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTa < 2:2060734/93‑1 (MQ=25) gAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAc < 1:2715246/93‑1 (MQ=25) aGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAcc > 1:1687839/1‑93 (MQ=25) aGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAcc < 1:6565452/93‑1 (MQ=25) gggTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcg > 1:3063412/1‑93 (MQ=25) gggTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcg > 2:5859940/1‑93 (MQ=25) gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCGCTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 2:2392762/1‑93 (MQ=25) gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 1:4391015/1‑93 (MQ=25) gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 2:2314919/1‑93 (MQ=25) gCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCt < 1:3429580/93‑1 (MQ=25) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCTCCCG‑C‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa > 1:5086182/1‑93 (MQ=21) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa > 2:4892112/1‑93 (MQ=21) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa > 2:4903233/1‑93 (MQ=21) ccTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAt < 2:5692630/93‑1 (MQ=25) ccTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAt < 2:4214896/93‑1 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCCCTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg < 1:7447138/93‑1 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg > 1:3604922/1‑93 (MQ=21) tGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGc > 2:1329458/1‑93 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 1:3926248/93‑1 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 2:4737629/93‑1 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 2:5188721/93‑1 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc > 2:4624288/1‑93 (MQ=21) tGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTa > 1:1112484/1‑93 (MQ=21) tGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTa > 1:5373845/1‑93 (MQ=21) gCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTAc > 2:1124695/1‑93 (MQ=21) ccGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCAGCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACt < 2:3492978/93‑1 (MQ=18) cGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTg > 2:6306460/1‑93 (MQ=21) cGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTg < 2:6179814/93‑1 (MQ=21) gATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTgg < 1:3513714/93‑1 (MQ=21) aTTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg > 1:5746738/1‑93 (MQ=21) ttCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa > 2:6837837/1‑93 (MQ=21) ttCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa < 2:1031376/93‑1 (MQ=21) ttCGGAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa < 1:2588004/93‑1 (MQ=18) tCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAg < 2:7432058/93‑1 (MQ=21) gTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa < 2:7244894/93‑1 (MQ=21) gTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa < 1:3192565/93‑1 (MQ=21) gTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa > 1:380861/1‑93 (MQ=21) tAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCAc > 2:1285063/1‑93 (MQ=21) ggCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGc < 1:1489832/93‑1 (MQ=21) ggCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGc > 1:6057435/1‑93 (MQ=21) gCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt < 2:6991389/93‑1 (MQ=21) gCCGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt > 1:4579200/1‑93 (MQ=21) cGGATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCttt > 2:6339686/1‑93 (MQ=21) ggATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTa < 2:6560443/93‑1 (MQ=21) gATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac < 2:5131447/93‑1 (MQ=25) gATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 1:4698327/1‑93 (MQ=21) gATAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 2:3768332/1‑93 (MQ=21) aTAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTaca < 1:485153/93‑1 (MQ=25) tAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTacac < 2:1715684/93‑1 (MQ=25) tAAGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTacac > 2:5318358/1‑93 (MQ=25) aaGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACAcc < 1:5695083/93‑1 (MQ=25) aGGCGCT‑‑CGCGCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCg < 2:6786168/93‑1 (MQ=25) | AAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCGCT‑‑CG‑G‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCG > NC_000913/4448461‑4448623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |