| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3156257 | 3156259 | 3 | 335 [0] | [0] 335 | yqhG | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 0 (0.000) | 311 (1.090) | 132/178 | 0.2 | 100% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 0 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
AAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3156163‑3156256‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > NC_000913/3156260‑3156351 AAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCC < 2:6647466/93‑1 AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA > 1:7048479/1‑93 AACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGG < 2:2143865/93‑1 ACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGC < 2:1660488/93‑1 CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCG > 1:6377388/1‑93 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CCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAA > 2:5237778/1‑93 CGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAC > 2:4498735/1‑93 GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC < 1:5138893/93‑1 AACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCA > 1:856168/1‑93 ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC > 1:240268/1‑93 TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT < 2:4970482/93‑1 TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT > 1:2033066/1‑93 TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT < 1:3307568/93‑1 TTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCA > 1:5297006/1‑93 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TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC < 2:4276142/93‑1 TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC > 1:5601656/1‑93 TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC < 2:5860023/93‑1 ATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCC > 1:492282/1‑93 GCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAAT > 2:4222556/1‑93 TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA > 2:5090721/1‑93 ATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATC < 1:5931872/93‑1 TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC > 1:6749325/1‑93 TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCC > 1:4428203/1‑93 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |