| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3980290 = | 320 (1.090) | 191 (0.690) | 94/174 | 2.7 | 43.4% | noncoding (72/87 nt) | leuT | tRNA‑Leu |
| ? | NC_000913 | 4603661 = | 195 (0.700) | noncoding (74/88 nt) | leuV | tRNA‑Leu | |||||
Only 100 of 532 total aligned reads displayed.
ATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTT > NC_000913/3980198‑3980382 | attattAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑c > 1:1891545/1‑93 (MQ=255) ttattaGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cc > 1:4107854/1‑93 (MQ=255) ttattaGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cc > 1:1692088/1‑93 (MQ=255) attaGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cccc < 2:6584650/93‑1 (MQ=255) attaGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cccc > 2:1603443/1‑93 (MQ=255) aaagtaagatgactgtgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccc < 2:4683248‑M1/3‑1 (MQ=255) aagtaagatgactgtgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtccccccc < 2:7501669‑M1/4‑1 (MQ=255) aagtaagatgactgtgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtccccccc < 1:6001100‑M1/4‑1 (MQ=255) aGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑ccccccc < 2:903606/93‑1 (MQ=255) gAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cccccccc < 1:4789007/93‑1 (MQ=255) aGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGG‑‑cccccccccc < 1:2784424/93‑3 (MQ=255) agatgactgtgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccccctc > 2:2793202‑M1/85‑91 (MQ=255) ttGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cccccccccctc > 2:6817140/1‑89 (MQ=255) gatgactgtgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccccctcg < 2:4453803‑M1/10‑4 (MQ=255) tgactgtgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGca > 2:2573493‑M1/82‑93 (MQ=255) actgtgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGcacc < 1:4967520‑M1/14‑1 (MQ=255) aCAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGcacca > 1:7466246/1‑93 (MQ=16) aCAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGcaccac > 2:1433487/1‑93 (MQ=34) tgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCCC‑CGCACCCCGa < 2:6641687‑M1/18‑1 (MQ=255) gcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGAc > 1:1545085‑M1/75‑93 (MQ=255) gcgaagggggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGAc > 2:2231617‑M1/75‑93 (MQ=255) gaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtccccccccc < 1:2505366‑M1/6‑1 (MQ=255) aaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACttt > 1:6122490‑M1/72‑93 (MQ=255) aaGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTa > 2:703743/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTaa > 1:2110645/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTaaa < 1:3325714/93‑1 (MQ=255) gtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTaaa > 2:7264256‑M1/69‑93 (MQ=255) ggTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTaaa < 2:2996195/93‑1 (MQ=255) tGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGa < 2:6777725/93‑1 (MQ=255) gcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGa > 1:3155076‑M1/66‑93 (MQ=255) gcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtggggggtccagtcccCCCCCCCCCCGCCCCCCG‑Ctttaaaaaa < 2:6290247‑M1/28‑4 (MQ=255) gCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAAt < 1:624835/93‑1 (MQ=255) gCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAAt < 1:2263492/93‑1 (MQ=255) ggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAAtt < 1:4301232‑M1/30‑1 (MQ=255) attggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGaa > 2:4873297‑M1/61‑93 (MQ=255) aaTTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGaa > 2:5375535/1‑93 (MQ=255) aTTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAAc < 1:3529659/93‑1 (MQ=255) aTTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAAc > 2:1074173/1‑93 (MQ=255) attggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAAc > 1:2627714‑M1/59‑93 (MQ=255) gtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTaa > 2:3800254‑M1/57‑93 (MQ=255) ggtagacgcgctagcttcaggggttagtgtccttacggacgtgggggttcaagccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTaa > 1:5908138‑M1/56‑93 (MQ=255) gacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTaaaaa > 2:3681537‑M1/54‑93 (MQ=255) agacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTaaaa > 1:346121‑M1/54‑93 (MQ=255) gcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTc > 2:5909195‑M1/51‑93 (MQ=255) gcTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaa < 1:7205612/93‑1 (MQ=255) ctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaa > 2:3917264‑M1/48‑93 (MQ=255) tagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaa > 2:5254244‑M1/47‑93 (MQ=255) tAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaaa < 2:2683523/93‑1 (MQ=255) tAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCCCGCCTTTTAAGAATTTAAATAAAAATTCaaaaa > 1:1342847/1‑93 (MQ=17) agcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaaa > 1:2889378‑M1/46‑93 (MQ=255) gcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaaa > 1:1119614‑M1/45‑93 (MQ=255) gcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaaa > 2:612549‑M1/45‑93 (MQ=255) gCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGc > 2:2450692/1‑93 (MQ=255) gCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGc > 1:6819375/1‑93 (MQ=255) gCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGc < 2:3452986/93‑1 (MQ=255) gCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGc < 1:552621/93‑1 (MQ=255) cttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGc > 1:371866‑M1/44‑93 (MQ=255) cTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCa < 2:6897251/93‑1 (MQ=255) cTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCa < 2:3246932/93‑1 (MQ=255) ttCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGt > 1:7029804/1‑93 (MQ=255) tcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAg < 2:821993‑M1/52‑1 (MQ=255) tCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGt < 2:4246060/93‑1 (MQ=255) aGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAt < 1:7354494/93‑1 (MQ=255) aGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAt > 2:5763890/1‑93 (MQ=255) aGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAtt > 2:5514918/1‑93 (MQ=255) gtgtTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAttt < 2:6344945/93‑1 (MQ=255) gtgtTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAttt > 2:7408833/1‑93 (MQ=255) tgtTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTc < 2:4036931/93‑1 (MQ=255) tgtTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTc < 1:6361830/93‑1 (MQ=255) gtTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGCCTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCg > 1:4917167/1‑93 (MQ=255) gtgtCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCCCGCCCTTAAAAAATTGAACCAAAAAATCAAAAAACAGCATTTCGGCGa > 2:129381/1‑93 (MQ=18) gtgtCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAg > 1:1033030/1‑93 (MQ=255) gtgtccttacggacgtgggggttcaagccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGa > 1:2439019‑M1/30‑93 (MQ=255) tccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGt > 2:1911957‑M1/29‑93 (MQ=255) gtCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGt < 2:5699831/93‑1 (MQ=255) cttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAg > 1:537526‑M1/27‑93 (MQ=255) tacggacgtgggggttcaagccccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAgc > 1:5163675‑M1/25‑93 (MQ=255) acggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAgcgc > 2:1833893‑M1/24‑93 (MQ=255) 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cgtgggggttcaagcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCtt > 1:6603225‑M1/18‑93 (MQ=255) cgtgggggttcaagccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTg > 1:4642454‑M1/17‑93 (MQ=255) tGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGt > 1:832183/1‑93 (MQ=255) gtgggggttcaagccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTgg > 1:6503718‑M1/16‑93 (MQ=255) gggggTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTa > 2:4897223/1‑93 (MQ=255) gggggTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTa < 1:3633636/93‑1 (MQ=255) ggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAgc > 1:2210726‑M1/13‑93 (MQ=255) ggTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAgcg > 2:3134276/1‑93 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |