| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3980297 | 276 (0.940) | 146 (0.560) +CCC |
83/162 | 3.2 | 48.1% | noncoding (79/87 nt) | leuT | tRNA‑Leu |
| ? | NC_000913 | = 4603655 | 75 (0.280) | noncoding (80/88 nt) | leuV | tRNA‑Leu | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 518 total aligned reads displayed.
GAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCA > NC_000913/3980205‑3980389 | gAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑cccccccc > 2:1270398/1‑93 (MQ=255) aGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGG‑‑‑cccccccccc < 1:2784424/93‑3 (MQ=255) gTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑cccccccccct > 2:671361/1‑90 (MQ=255) ttGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTTAAGT‑‑‑cccccccccccc > 1:1309969/1‑89 (MQ=255) ttGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑cccccccccctc < 2:5498290/93‑5 (MQ=255) actgtgcgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGcacc < 1:4967520‑M1/14‑1 (MQ=255) aCAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGcacca > 1:7466246/1‑93 (MQ=16) cAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCC‑CCCCCCCCTCGcacca > 1:4418601/1‑93 (MQ=11) aaTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCC‑CCCCCCCCTCGcaccac < 1:5613293/93‑1 (MQ=11) tGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGAc > 1:2197375/1‑93 (MQ=255) gCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACt < 2:7077211/93‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACt < 2:6174157/93‑1 (MQ=255) gcgaggggggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagcccCCCCCCCCTCGCACCACGAc > 1:4263762‑M1/74‑93 (MQ=255) cgaaggtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACt > 2:6865291‑M1/74‑93 (MQ=255) cGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACtt > 1:2347271/1‑93 (MQ=255) aaGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTa > 2:6985161/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTaa > 2:4072023/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTaa > 2:4799894/1‑93 (MQ=255) ggTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTaaa < 2:2996195/93‑1 (MQ=255) gtggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTaaa > 2:7264256‑M1/69‑93 (MQ=255) gTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAg < 1:3943635/93‑1 (MQ=255) gTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGa > 2:3388689/1‑93 (MQ=255) tggcggaattggtaggcgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAg > 2:794095‑M1/68‑93 (MQ=255) tggcggaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAg > 2:2790683‑M1/68‑93 (MQ=255) ggCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGaa < 2:6379125/93‑1 (MQ=255) ggCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAAt < 1:1918578/93‑1 (MQ=255) ggCGGAATTGGTAGACCCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTG‑‑CCCACCCCTCGGCCCACGACTCTAAAGaa > 1:3347483/1‑93 (MQ=14) gaattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTg < 1:4771534‑M1/31‑1 (MQ=255) gAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGa > 2:7171140/1‑93 (MQ=255) gAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGa < 1:6201791/93‑1 (MQ=255) aaTTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGaa > 2:5375535/1‑93 (MQ=255) attggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGaa > 2:4873297‑M1/61‑93 (MQ=255) aattggtagacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGa > 1:6065259‑M1/61‑93 (MQ=255) aTTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAAc < 1:3529659/93‑1 (MQ=255) aTTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAAc > 2:5862219/1‑93 (MQ=255) gacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTaaaaa > 2:4202079‑M1/54‑93 (MQ=255) aCGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTc < 1:5911574/93‑1 (MQ=255) gcTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaa < 1:7205612/93‑1 (MQ=255) ctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaa > 2:3917264‑M1/48‑93 (MQ=255) tagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCCC‑CGCACCCCGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaa < 1:6985358‑M1/47‑1 (MQ=255) tagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaa > 2:3849132‑M1/47‑93 (MQ=255) tAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaaa < 1:6514355/93‑1 (MQ=255) agcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaaa > 1:2889378‑M1/46‑93 (MQ=255) gcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaaaa > 1:1119614‑M1/45‑93 (MQ=255) gcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAg > 2:1189545‑M1/45‑93 (MQ=255) gCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCa < 1:1609302/93‑1 (MQ=255) ttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCa > 2:5709283‑M1/43‑93 (MQ=255) tCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGt < 2:5789883/93‑1 (MQ=255) cAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTa < 2:898044/93‑1 (MQ=255) ggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAt > 1:5473362‑M1/39‑93 (MQ=255) ggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAt > 2:3460284‑M1/39‑93 (MQ=255) tgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAttt > 2:1530880‑M1/37‑93 (MQ=255) gttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTc > 2:2375868‑M1/36‑93 (MQ=255) gtTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGCCTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCg > 1:4917167/1‑93 (MQ=255) gtTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCg < 1:786089/93‑1 (MQ=255) gttagtgtccttacggacgtgggggttcaagcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTc > 1:2251174‑M1/35‑93 (MQ=255) tAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCg < 2:6791126/93‑1 (MQ=255) aGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCTTTAAAAAATTTAAATAAAAATTCAAAAAACAATATTTCgg > 2:3212568/1‑93 (MQ=9) gtgtCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAg > 1:1033030/1‑93 (MQ=255) tgtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCCCCC‑CACCCCGACTTTAAAAAATTGAACTAAAAATTCAAAAAAAAGAATTTCGGCGa < 2:1357546‑M1/63‑1 (MQ=255) gtccttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAg > 1:6590897‑M1/30‑93 (MQ=255) gtCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGt > 1:2109578/1‑93 (MQ=255) tCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTCAAGAAATGAACTAAAAAATCAAAAAACAGTATTTCTGCTAGTa > 2:2516348/1‑93 (MQ=21) tCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTa < 2:2283527/93‑1 (MQ=255) ccTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAg < 1:2569437/93‑1 (MQ=255) cttacggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAg > 1:537526‑M1/27‑93 (MQ=255) tacggacgtgggggttcaagccccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAgc > 1:5163675‑M1/25‑93 (MQ=255) acggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAgcgc > 2:4261020‑M1/24‑93 (MQ=255) acggacgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAgcgc < 1:634034‑M1/70‑1 (MQ=255) gacgtgggggttcaagtcccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAAAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAg < 1:994223‑M1/73‑1 (MQ=255) gACGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCt > 1:1696449/1‑93 (MQ=255) aCGTGGGGGTTCAAGTCC‑CCCCCCCCTCCCACCACGACTTTAAAAAATTGAACTAAAAATTCAAAAAACAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCt > 2:6471966/1‑93 (MQ=38) aCGTGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCtt < 1:943146/93‑1 (MQ=255) cgtgggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCtt > 1:2653490‑M1/19‑93 (MQ=255) tGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGt > 2:3744630/1‑93 (MQ=255) tGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGt > 2:1789968/1‑93 (MQ=255) tGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGt < 2:5958823/93‑1 (MQ=255) tGGGGGTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAAAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGt > 1:6404265/1‑93 (MQ=255) cgtgggggttcaagccCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTg > 1:4642454‑M1/17‑93 (MQ=255) gggggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGt > 2:7441275‑M1/16‑93 (MQ=255) gggggTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTa > 2:4897223/1‑93 (MQ=255) gggggTTCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTa < 1:3633636/93‑1 (MQ=255) ggttcaagtcccCCCCCCC‑TCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAgc > 1:313197‑M1/13‑93 (MQ=255) ttCAAGTC‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAgcgcc > 1:1791592/1‑92 (MQ=255) ttCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCaa > 2:209874/1‑93 (MQ=255) agtcCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTg < 2:7355583‑M1/89‑1 (MQ=255) gtcCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTgg < 2:5202798‑M1/90‑1 (MQ=255) CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGttt > 1:3017896‑M1/1‑93 (MQ=255) CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGttt > 2:6311681‑M1/1‑93 (MQ=255) CCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTgg > 1:3253096‑M1/1‑93 (MQ=255) CCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTgg > 2:5018856‑M1/1‑93 (MQ=255) CCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTgg < 1:7377111‑M1/93‑1 (MQ=255) CCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTggg < 1:679970‑M1/93‑1 (MQ=255) CCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTggg < 1:5829880‑M1/93‑1 (MQ=255) CCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGa < 2:2640805‑M1/93‑1 (MQ=255) cccTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGAc > 2:1879494/1‑93 (MQ=255) cccTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGAc > 2:311706/1‑93 (MQ=255) cccTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGAc > 1:1413303/1‑93 (MQ=255) cTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCa < 2:65668/93‑1 (MQ=255) cTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCa > 1:3471402/1‑93 (MQ=255) | GAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCA > NC_000913/3980205‑3980389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |