| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 703,294 | 0 | A | G | 73.0% | 330.0 / 175.3 | 233 | Q43R (CAG→CGG) | nagE | PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific enzyme IIABC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/28); new base G (80/90); total (115/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
GGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGC > NC_000913/703202‑703386 | cGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCggg > 1:135787/1‑93 (MQ=255) cGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCggg < 1:7333048/93‑1 (MQ=255) cGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAgg < 2:3127332/93‑1 (MQ=255) gTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAggc > 1:502048/1‑93 (MQ=255) ttACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGggcg > 2:1648011/1‑93 (MQ=255) tACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGggcgg > 1:7364851/1‑93 (MQ=255) tACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGggcgg > 2:3741109/1‑93 (MQ=255) aCAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCcgggcggg > 2:1023283/1‑93 (MQ=255) cAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCgggcgggc < 2:7298021/93‑1 (MQ=255) gCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGgcgggcgg > 2:4872028/1‑93 (MQ=255) gCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGgcgggcgg < 1:4745244/93‑1 (MQ=255) tCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTg < 2:5249139/93‑1 (MQ=255) tCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGgcgggcgggg > 1:2420857/1‑91 (MQ=255) cccTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGc < 2:3670816/93‑1 (MQ=255) cccTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGc < 1:3950834/93‑1 (MQ=255) cccTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGc < 1:3997814/93‑1 (MQ=255) cccTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGc < 2:637302/93‑1 (MQ=255) ccTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCg > 2:156984/1‑93 (MQ=255) ccTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCg > 2:7425902/1‑93 (MQ=255) cTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGa > 2:6324499/1‑93 (MQ=255) cTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGa > 2:7432825/1‑93 (MQ=255) cTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGAACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGa > 2:7359045/1‑93 (MQ=255) tATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGAt < 1:1108217/93‑1 (MQ=255) tCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGAttt < 1:2102157/93‑1 (MQ=255) tCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTAGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGAttt > 2:2220196/1‑93 (MQ=255) cgcgGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGAtttt < 1:4974393/93‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGAttttt > 2:5543271/1‑93 (MQ=255) gcgGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGAttttt < 1:2137146/93‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGAttttt < 2:3034113/93‑1 (MQ=255) gcgGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGAttttt > 1:2536141/1‑93 (MQ=255) gcgGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGAttttt > 1:6621458/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGa < 1:2619616/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGa < 2:315529/93‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAGCGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGAt < 2:5644137/93‑1 (MQ=255) gctgcCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATaa < 2:2583972/93‑1 (MQ=255) ctgcCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAAc < 2:1067581/93‑1 (MQ=255) gcCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCt > 2:3321879/1‑93 (MQ=255) gcCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCt > 1:4185113/1‑93 (MQ=255) ccGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTc < 1:1830242/93‑1 (MQ=255) gTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCa < 1:6779312/93‑1 (MQ=255) tGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTTAGCCAAGTTTACTTAACGATGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGGGCGATTTTTGATAACCTCGCAt > 1:6409624/1‑93 (MQ=255) gcggcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTa > 1:534085/1‑93 (MQ=255) gcggcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTa > 2:4048802/1‑93 (MQ=255) ggcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAAt < 1:3399515/93‑1 (MQ=255) ggcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAAt > 2:1190221/1‑93 (MQ=255) gcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATc > 2:6819248/1‑93 (MQ=255) gcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATc > 2:4778186/1‑93 (MQ=255) gcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATc > 2:6681367/1‑93 (MQ=255) gcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATc > 2:1140689/1‑93 (MQ=255) gcACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATc > 1:1759690/1‑93 (MQ=255) cACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCt < 1:1538702/93‑1 (MQ=255) cACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCt < 1:2022849/93‑1 (MQ=255) cACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCt < 2:2125640/93‑1 (MQ=255) aCTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCtt < 1:5641600/93‑1 (MQ=255) cTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTc > 2:7263807/1‑93 (MQ=255) gTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGc > 2:5159206/1‑93 (MQ=255) gctgcGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCAt < 2:4402418/93‑1 (MQ=255) gctgcGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCAt < 2:2683730/93‑1 (MQ=255) gctgcGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCAt > 1:748694/1‑93 (MQ=255) gcGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCgg > 2:4300201/1‑93 (MQ=255) gATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGgtg > 2:1481694/1‑93 (MQ=255) aTTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGgtgt > 2:852255/1‑93 (MQ=255) aTTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGgtgt < 1:2334628/93‑1 (MQ=255) aTTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGgtgt > 2:2917121/1‑93 (MQ=255) cGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGc < 1:604669/93‑1 (MQ=255) cGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGc > 2:7073495/1‑93 (MQ=255) ggTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCa > 2:5849709/1‑93 (MQ=255) ggTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCa < 1:3480482/93‑1 (MQ=255) tCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATc > 2:7532424/1‑93 (MQ=255) cAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATcc < 1:1442988/93‑1 (MQ=255) aGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCa < 2:6127753/93‑1 (MQ=255) ccAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGc < 2:402593/93‑1 (MQ=255) cAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCt > 2:1038732/1‑93 (MQ=255) gATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTgg > 1:843103/1‑93 (MQ=255) aTTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGt > 1:7138134/1‑93 (MQ=255) tttACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTc < 2:6518430/93‑1 (MQ=255) tttACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTc < 1:300983/93‑1 (MQ=255) tACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGa > 1:6853279/1‑93 (MQ=255) cTTAACGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGaaa > 2:2312426/1‑93 (MQ=255) aCGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACa > 1:6347011/1‑93 (MQ=255) cGTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAg > 1:1035312/1‑93 (MQ=255) cGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAg < 1:2986658/93‑1 (MQ=255) gTTGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAgc > 2:5359509/1‑93 (MQ=255) ttGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAgcg > 1:5538652/1‑93 (MQ=255) ttGCGTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAgcg < 1:7263807/93‑1 (MQ=255) ttGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAgcg > 1:3709154/1‑93 (MQ=255) gTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTgg > 1:5262368/1‑93 (MQ=255) gTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTgg > 1:3037867/1‑93 (MQ=255) gTTTATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTgg > 1:4600242/1‑93 (MQ=255) tttATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGt < 2:411484/93‑1 (MQ=255) tttATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGt < 1:5495349/93‑1 (MQ=255) tttATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGt > 2:505496/1‑93 (MQ=255) ttATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTg < 1:3630049/93‑1 (MQ=255) tATTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgc < 2:3229833/93‑1 (MQ=255) tATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgc < 1:5194774/93‑1 (MQ=255) aTTGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgcg < 2:5093517/93‑1 (MQ=255) ttGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgcgg > 2:5943438/1‑93 (MQ=255) tGCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgcggc < 1:5711841/93‑1 (MQ=255) gCCCGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgcggcg > 2:1982557/1‑93 (MQ=255) cccGGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTgcggcgg < 2:2985525/93‑1 (MQ=255) | GGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGC > NC_000913/703202‑703386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |