| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,648,536 | 0 | C | T | 72.1% | 355.3 / 134.8 | 197 | intergenic (+244/‑385) | arsC/yhiS | arsenate reductase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/47); new base T (37/105); total (45/152) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.19e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
TTTTGCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGATACCTTAACCCATTTTAT > NC_000913/3648444‑3648627 | ttGCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAgtgc < 2:233737/93‑1 (MQ=255) tGCTATTTACACAGTCCTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCa < 2:6267966/93‑1 (MQ=255) tGCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCa > 1:1103719/1‑93 (MQ=255) tGCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCa < 2:1468131/93‑1 (MQ=255) tGCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCa < 1:4276771/93‑1 (MQ=255) gCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCag < 1:2928315/93‑1 (MQ=255) cTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCagt < 1:1922134/93‑1 (MQ=255) cTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCagt < 2:3102136/93‑1 (MQ=255) cTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCagt < 1:1072585/93‑1 (MQ=255) tATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCagta < 2:2203673/93‑1 (MQ=255) tATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCagta < 1:659263/93‑1 (MQ=255) aTTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCagtag < 1:5572160/93‑1 (MQ=255) tttACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCagtagt < 2:3031922/93‑1 (MQ=255) ttACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGtt < 1:817831/93‑1 (MQ=255) ttACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGtt < 1:1848127/93‑1 (MQ=255) ttACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGtt < 2:7436873/93‑1 (MQ=255) ttACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGtt < 1:5205304/93‑1 (MQ=255) ttACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGtt < 1:2671630/93‑1 (MQ=255) cacaGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTaa < 1:567274/93‑1 (MQ=255) acaGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTaaa < 2:7532319/93‑1 (MQ=255) acaGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTaaa > 2:6360253/1‑93 (MQ=255) acaGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTaaa < 1:2291656/93‑1 (MQ=255) acaGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTaaa < 1:2609316/93‑1 (MQ=255) caGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAg > 1:1501627/1‑93 (MQ=255) aGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGa < 2:4817407/93‑1 (MQ=255) aGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGa < 2:1849774/93‑1 (MQ=255) gTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGAc < 2:34713/93‑1 (MQ=255) gTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGAc < 2:3597090/93‑1 (MQ=255) tACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACg < 2:5157150/93‑1 (MQ=255) tCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTAc < 2:7058359/93‑1 (MQ=255) cccTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACt < 2:5407335/93‑1 (MQ=255) ccTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTg < 1:5030404/93‑1 (MQ=255) ccTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTg > 2:6464840/1‑93 (MQ=255) cTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACGGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTgg > 2:1658051/1‑93 (MQ=255) cTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTgg > 2:5698420/1‑93 (MQ=255) tGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGa < 1:451848/93‑1 (MQ=255) gCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGAt > 1:2258384/1‑93 (MQ=255) tGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTAt > 2:4275388/1‑93 (MQ=255) tGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTAt < 2:5806442/93‑1 (MQ=255) aTTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGAtt < 2:6325162/93‑1 (MQ=255) aTTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGAtt < 1:5801324/93‑1 (MQ=255) ttCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGAttt < 1:4624390/93‑1 (MQ=255) tCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTa < 2:1968005/93‑1 (MQ=255) ccAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTAt > 2:2350256/1‑93 (MQ=255) ccAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTAt < 1:699776/93‑1 (MQ=255) ccAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTAt < 2:3405101/93‑1 (MQ=255) cAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATc < 2:3239596/93‑1 (MQ=255) cAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATc < 2:1624653/93‑1 (MQ=255) cAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATc < 2:6685863/93‑1 (MQ=255) cAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATc < 1:2152592/93‑1 (MQ=255) aaTTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCa < 1:6772803/93‑1 (MQ=255) aaTTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCa < 2:2141671/93‑1 (MQ=255) aaTTATCGCGTCCAGCATCGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCa < 1:4819726/93‑1 (MQ=255) aTTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAg < 2:3673235/93‑1 (MQ=255) ttATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGt > 1:6922554/1‑93 (MQ=255) ttATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGt < 1:2493266/93‑1 (MQ=255) tATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTg > 1:770404/1‑93 (MQ=255) tATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATGATGATTTATCAGTg > 2:4378699/1‑93 (MQ=255) aTCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGAgg < 1:1720373/93‑1 (MQ=255) tCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGt > 2:7157644/1‑93 (MQ=255) tCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGt < 1:2453082/93‑1 (MQ=255) cgcgTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGtt < 1:3400282/93‑1 (MQ=255) gcgTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGttt < 1:1388463/93‑1 (MQ=255) gcgTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGttt > 2:4049350/1‑93 (MQ=255) gTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTac < 1:609616/93‑1 (MQ=255) gTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTac > 2:4710324/1‑93 (MQ=255) gTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTac < 2:5076879/93‑1 (MQ=255) tCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTaca > 2:5658551/1‑93 (MQ=255) tCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTaca < 2:6878809/93‑1 (MQ=255) tCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTaca > 2:6180318/1‑93 (MQ=255) ccAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTacac < 1:5614157/93‑1 (MQ=255) ccAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTacac < 1:2772700/93‑1 (MQ=255) cAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTAcaca < 2:5720028/93‑1 (MQ=255) cATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACacaaca < 2:4554060/93‑1 (MQ=255) aTGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACAcaacaa < 1:7308782/93‑1 (MQ=255) tgtATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAatta < 1:3167827/93‑1 (MQ=255) tgtATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAatta < 1:3775637/93‑1 (MQ=255) tATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAattatt < 2:7254102/93‑1 (MQ=255) aTCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAAttatta < 1:2029998/93‑1 (MQ=255) tCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTaa < 1:4164526/93‑1 (MQ=255) tCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTaa < 1:1211268/93‑1 (MQ=255) cAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTaaa < 2:6658800/93‑1 (MQ=255) cAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTaaa < 1:5362904/93‑1 (MQ=255) aGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAaat < 1:3313264/93‑1 (MQ=255) aGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAaat < 1:413036/93‑1 (MQ=255) aGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAaat < 1:3640059/93‑1 (MQ=255) gTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAaata > 1:6526244/1‑93 (MQ=255) gTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAaata < 2:1026199/93‑1 (MQ=255) tGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAaataa > 2:809173/1‑93 (MQ=255) tGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAaataa < 2:3957366/93‑1 (MQ=255) ctgctTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATtat < 1:2244557/93‑1 (MQ=255) ctgctTAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATtat < 2:276164/93‑1 (MQ=255) gctTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATaa < 2:2395571/93‑1 (MQ=255) ttAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGa > 2:1518223/1‑93 (MQ=255) ttAGTTATCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGa > 1:1678719/1‑93 (MQ=255) ttAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGa < 2:2593838/93‑1 (MQ=255) aTCAGCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGATACCtt > 1:3475930/1‑93 (MQ=255) gCGATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGATACCTTAAcc < 2:4951921/93‑1 (MQ=255) gATACAGTGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGATACCTTAACCCa < 2:4565861/93‑1 (MQ=255) gcgcAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGATACCTTAACCCATTttat < 1:3212924/93‑1 (MQ=255) | TTTTGCTATTTACACAGTACTCCCTGCGTGAGATTCCAATTATCGCGTCCAGCATGGTGTATCAGTGAGCTGCTTAGTTATCAGCGATACAGCGCAGTAGTTTAAAGACGTACTGGATTATGATTTATCAGTGGTTTACACAACAAATTATTAAATAATTATAAGATACCTTAACCCATTTTAT > NC_000913/3648444‑3648627 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |