Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 839,256 | G→A | P500L (CCG→CTG) | b0805 ← | putative outer membrane receptor for iron transport |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 839,256 | 0 | G | A | 78.7% | 577.1 / 119.1 | 253 | P500L (CCG→CTG) | b0805 | putative outer membrane receptor for iron transport |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/23); new base A (96/103); total (127/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.22e-01 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TATAGACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATAATTA > NC_000913/839164‑839348 | tataGACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCg > 1:5719720/1‑93 (MQ=255) tataGACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCg > 2:7341406/1‑93 (MQ=255) tataGACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCg > 2:6570667/1‑93 (MQ=255) tataGACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCg < 2:1091275/93‑1 (MQ=255) taGACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAga < 1:1060846/93‑1 (MQ=255) taGACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAga > 1:1731056/1‑93 (MQ=255) gACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAgaga > 2:1889120/1‑93 (MQ=255) aCATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGaa < 2:2007723/93‑1 (MQ=255) cATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAAc > 1:7528156/1‑93 (MQ=255) aTTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAAcc > 2:3968095/1‑93 (MQ=255) ttGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCt > 1:5306274/1‑93 (MQ=255) ttGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCt < 1:6290927/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCt < 1:6735315/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCt < 2:1376697/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCt < 2:68117/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCt < 1:1233035/93‑1 (MQ=255) tGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCtt < 1:21238/93‑1 (MQ=255) gCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCttt > 2:2639064/1‑93 (MQ=255) gCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCttt < 2:6066622/93‑1 (MQ=255) gCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCttt < 2:1255230/93‑1 (MQ=255) ccGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCtttt > 1:1935140/1‑93 (MQ=255) cGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTg < 2:1526162/93‑1 (MQ=255) tttCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCca < 1:3880916/93‑1 (MQ=255) tttCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCca < 1:7020667/93‑1 (MQ=255) gTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCa < 1:3909705/93‑1 (MQ=255) tCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAg > 2:3563791/1‑93 (MQ=255) tCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAg > 2:498744/1‑93 (MQ=255) aGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGtt < 2:4267995/93‑1 (MQ=255) aGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGtt < 2:3194626/93‑1 (MQ=255) ggTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTg < 1:5907681/93‑1 (MQ=255) ggTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTg > 2:6017314/1‑93 (MQ=255) ggTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTg > 1:5416731/1‑93 (MQ=255) gTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTgg > 2:5456452/1‑93 (MQ=255) gTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTgg < 2:6373962/93‑1 (MQ=255) gATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGc > 1:4735542/1‑93 (MQ=255) aTACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCa > 1:1570963/1‑93 (MQ=255) aTACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCa < 2:3084559/93‑1 (MQ=255) aTACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCa > 1:5119740/1‑93 (MQ=255) tACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAg > 1:1286016/1‑93 (MQ=255) tACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAg > 1:1545037/1‑93 (MQ=255) cAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGt > 2:2468750/1‑93 (MQ=255) gcgcCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGa < 1:5772472/93‑1 (MQ=255) gcgcCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGa < 1:5554430/93‑1 (MQ=255) gcgcCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGa > 2:305416/1‑93 (MQ=255) cgcCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGAt < 1:6584470/93‑1 (MQ=255) cgcCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGAt < 2:2373623/93‑1 (MQ=255) gcCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATg > 1:3252440/1‑93 (MQ=255) ccccGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATgg > 1:6923740/1‑93 (MQ=255) cccGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGc > 2:3885143/1‑93 (MQ=255) cccGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGc > 2:5391448/1‑93 (MQ=255) ccGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCa > 2:6197785/1‑93 (MQ=255) ccGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCa > 2:5132654/1‑93 (MQ=255) ccGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCa > 2:3432450/1‑93 (MQ=255) ggCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCAcc > 1:5613373/1‑93 (MQ=255) gCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACcg > 2:1347327/1‑93 (MQ=255) gCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACcg > 1:7460916/1‑93 (MQ=255) tttCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACcgcg > 1:3775737/1‑93 (MQ=255) tCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTc < 1:7216436/93‑1 (MQ=255) ccAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTcc < 2:4552698/93‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCg > 1:2513835/1‑93 (MQ=255) gTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCt < 2:2200258/93‑1 (MQ=255) gTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCt > 1:3470716/1‑93 (MQ=255) ttCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTg > 2:1625865/1‑93 (MQ=255) ttCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTg > 1:2318451/1‑93 (MQ=255) tcaGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTgccgc > 1:2578053/1‑93 (MQ=255) tcaGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTgccgc > 2:6669681/1‑93 (MQ=255) caGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTgccgcc < 2:4757339/93‑1 (MQ=255) aGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGccgccg > 1:2852424/1‑93 (MQ=255) gATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCcgccgc < 2:6270241/93‑1 (MQ=255) aTTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCa > 2:2486006/1‑93 (MQ=255) aTTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCa < 1:4084013/93‑1 (MQ=255) ttGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAg > 1:3327797/1‑93 (MQ=255) ttGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAg < 1:5230211/93‑1 (MQ=255) gCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGc < 2:4190795/93‑1 (MQ=255) cGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGt < 1:3028182/93‑1 (MQ=255) gACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTg < 2:5602888/93‑1 (MQ=255) gACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTg < 1:6495975/93‑1 (MQ=255) aCTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTgg < 1:1027125/93‑1 (MQ=255) aCTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTgg > 1:3005706/1‑93 (MQ=255) ttGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCa < 2:859354/93‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCa > 2:3714380/1‑93 (MQ=255) tGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCAc < 2:5895406/93‑1 (MQ=255) tGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCAc > 1:6159461/1‑93 (MQ=255) cGGTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGt < 1:4459052/93‑1 (MQ=255) ggTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTc > 2:2847796/1‑93 (MQ=255) ggTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTc < 1:1335579/93‑1 (MQ=255) ggTGTCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTc > 2:332156/1‑93 (MQ=255) gtCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCata < 1:2037464/93‑1 (MQ=255) gtCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCata < 2:2049518/93‑1 (MQ=255) tCGACGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCatat > 1:4316121/1‑93 (MQ=255) gcGGTGGTGACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCa < 2:7088811/92‑1 (MQ=255) gtgACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGa < 2:5313042/93‑1 (MQ=255) tgACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGAt < 2:5217695/93‑1 (MQ=255) gACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATa > 2:3267539/1‑93 (MQ=255) gACCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATa < 2:1740069/93‑1 (MQ=255) aCCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATaa < 2:792736/93‑1 (MQ=255) aCCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATaa < 2:4333512/93‑1 (MQ=255) aCCAGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATaa < 1:3673474/93‑1 (MQ=255) ggAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATAATTa < 1:4408478/93‑1 (MQ=255) ggAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATAATTa > 1:3373114/1‑93 (MQ=255) | TATAGACATTGCCGTTTTCCGTCAGGTGATACAGCGCCCCGGCTTTCCAGTTCATCAGATTGCCCGACTTGGCGGTGTCGACGGTGGTGACCGGAGAACCTTTTGCCACACCAGTTGGGCAGGTGATGGCACCGCGTCCGCTGCCGCCGCAGGCGGTGGCACTGTCATATTCAGTATGATAATTA > NC_000913/839164‑839348 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |