| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 884,046 | A→G | N384S (AAC→AGC) | cmr → | proton motive force efflux pump |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 884,046 | 0 | A | G | 87.8% | 649.9 / 71.1 | 254 | N384S (AAC→AGC) | cmr | proton motive force efflux pump |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (15/16); new base G (120/103); total (135/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
GAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCT > NC_000913/883956‑884138 | aaTGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCt > 1:5023967/1‑93 (MQ=255) tgctgcAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTg > 2:912393/1‑93 (MQ=255) tgctgcAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTg > 1:2395432/1‑93 (MQ=255) tgcAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCa > 1:1125673/1‑93 (MQ=255) aaaTGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACg > 1:3530229/1‑93 (MQ=255) aaTGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACgg < 1:6343916/93‑1 (MQ=255) aaTGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACgg < 1:7027319/93‑1 (MQ=255) gCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAAt > 2:5271550/1‑93 (MQ=255) gCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAAt < 1:575147/93‑1 (MQ=255) tGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAAttt < 1:6658804/93‑1 (MQ=255) tGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAAttt > 2:1466115/1‑93 (MQ=255) aTCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTtg < 1:4913940/93‑1 (MQ=255) aTCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTtg > 2:3210406/1‑93 (MQ=255) aTCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTtg < 1:6923150/93‑1 (MQ=255) tCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTtgt > 1:5117616/1‑93 (MQ=255) tttACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTgg < 1:4361220/93‑1 (MQ=255) tttACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTgg > 1:2692631/1‑93 (MQ=255) ttACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGc < 1:743753/93‑1 (MQ=255) cGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTc > 1:2602621/1‑93 (MQ=255) gTTGGGATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCg > 2:4592191/1‑93 (MQ=255) ttGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTTAACGGAATTTTGTGGCTGTCGc < 1:5522505/93‑1 (MQ=255) ttGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGc > 2:439625/1‑93 (MQ=255) ttGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGc > 2:5998799/1‑93 (MQ=255) ttGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGc > 2:1941695/1‑93 (MQ=255) ttGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGc < 1:4840692/93‑1 (MQ=255) ttGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGc < 2:6817113/93‑1 (MQ=255) tGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCt < 1:4012939/93‑1 (MQ=255) tGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCt < 1:2867342/93‑1 (MQ=255) gTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGa > 2:3411455/1‑93 (MQ=255) tATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGAt < 2:6787873/93‑1 (MQ=255) tATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGAt < 1:6525339/93‑1 (MQ=255) aTTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATg < 1:2057160/93‑1 (MQ=255) aTTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATg < 1:3407957/93‑1 (MQ=255) ttGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATgg > 1:4137757/1‑93 (MQ=255) ttGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATgg > 2:6357888/1‑93 (MQ=255) ttGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATgg > 1:5307183/1‑93 (MQ=255) tGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGt < 1:7363248/93‑1 (MQ=255) tGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGt < 1:1034736/93‑1 (MQ=255) gAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGtt > 2:7152377/1‑93 (MQ=255) gAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGtt > 2:6959214/1‑93 (MQ=255) gAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGtt > 1:3951655/1‑93 (MQ=255) aTCAGCAAACATGCCTGGCTGAACTGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATc < 2:1609131/93‑1 (MQ=255) aTCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATc > 1:2506904/1‑93 (MQ=255) aTCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATc > 2:2189760/1‑93 (MQ=255) tCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCt < 1:871396/93‑1 (MQ=255) gCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCtttt < 1:6089825/93‑1 (MQ=255) cAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCttttt < 2:2127729/93‑1 (MQ=255) cAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCttttt < 1:1593744/93‑1 (MQ=255) aaaCATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTa < 1:5729181/93‑1 (MQ=255) aaCATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTaa > 1:2288887/1‑93 (MQ=255) aaCATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTaa > 2:2925512/1‑93 (MQ=255) aCATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTaaa > 1:4501127/1‑93 (MQ=255) aCATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTaaa > 2:4894430/1‑93 (MQ=255) aCATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTaaa > 2:484267/1‑93 (MQ=255) aCATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTaaa < 2:745020/93‑1 (MQ=255) cATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTaaaa < 2:1204839/93‑1 (MQ=255) aTGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAg > 1:3124101/1‑93 (MQ=255) aTGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAg > 2:5012777/1‑93 (MQ=255) aTGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAg < 2:4555395/93‑1 (MQ=255) tGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGa > 2:1896980/1‑93 (MQ=255) tGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGa < 1:4049021/93‑1 (MQ=255) tGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGa > 1:4696703/1‑93 (MQ=255) tGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGa < 2:381188/93‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGAt > 1:5875596/1‑93 (MQ=255) ccTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATa < 2:1233040/93‑1 (MQ=255) cTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATaa > 2:6486232/1‑93 (MQ=255) tGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATaaa < 2:2651020/93‑1 (MQ=255) tGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATaaa > 1:5844440/1‑93 (MQ=255) gCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACa < 1:6000701/93‑1 (MQ=255) gCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACa < 2:6667332/93‑1 (MQ=255) tGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGa > 2:5908758/1‑93 (MQ=255) tGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGa < 2:3054314/93‑1 (MQ=255) gAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGAt < 2:2428856/93‑1 (MQ=255) gAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGAt < 2:4717869/93‑1 (MQ=255) aaCGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATg > 2:3979217/1‑93 (MQ=255) aaCGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATg < 1:6381769/93‑1 (MQ=255) aCGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATgg > 1:4567650/1‑93 (MQ=255) gggggCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGa < 2:2227328/93‑1 (MQ=255) gggggCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGa > 1:6795943/1‑93 (MQ=255) cAACGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATtc < 2:6531859/93‑1 (MQ=255) aaCGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATtct > 2:6069732/1‑93 (MQ=255) aCGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATtctc > 2:755862/1‑93 (MQ=255) aCGGACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATtctc > 2:5745608/1‑93 (MQ=255) cGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCa < 2:2586788/93‑1 (MQ=255) cGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCa > 1:1903274/1‑93 (MQ=255) ggACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCAc < 1:5174823/93‑1 (MQ=255) ggACTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCAc > 2:4170495/1‑93 (MQ=255) aCTGTTTAATCTTTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGGGGCTGTCGCTGGTGGTTATCTTTTTTAAAGATAAACAGATGGGGAATTCTCACGa > 1:372177/1‑93 (MQ=255) cTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGaa < 1:1331789/93‑1 (MQ=255) cTGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGaa > 2:2847894/1‑93 (MQ=255) tGTTTAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAg < 2:1410101/93‑1 (MQ=255) ttAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGt > 2:3593318/1‑93 (MQ=255) ttAATCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGt > 2:3178302/1‑93 (MQ=255) aaTCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTaa > 1:5022772/1‑93 (MQ=255) aTCTCTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTaaa > 2:478565/1‑93 (MQ=255) tctcTTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTaaaa > 1:5221447/1‑93 (MQ=255) tctTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTaaaaaa > 2:5826418/1‑93 (MQ=255) ctTCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTaaaaaaa < 1:4393390/93‑1 (MQ=255) ttCAGCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAAt > 2:1692380/1‑93 (MQ=255) aCCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCt < 2:2968404/93‑1 (MQ=255) | GAATGCTGCAAATGCTGATCTTTACCGTTGGTATTGAAATCAGCAAACATGCCTGGCTGAACGGGGGCAACGGACTGTTTAATCTCTTCAACCTTGTCAACGGAATTTTGTGGCTGTCGCTGATGGTTATCTTTTTAAAAGATAAACAGATGGGAAATTCTCACGAAGGGTAAAAAAATGCCT > NC_000913/883956‑884138 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |