Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,032,328 | A→G | T323A (ACC→GCC) | hyaA → | hydrogenase‑1 small subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,032,328 | 0 | A | G | 83.0% | 480.5 / 80.1 | 218 | T323A (ACC→GCC) | hyaA | hydrogenase‑1 small subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (21/16); new base G (91/90); total (112/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
ACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGA > NC_000913/1032236‑1032417 | aCGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCa < 2:6560609/93‑1 (MQ=255) ggCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGcc > 2:6840976/1‑93 (MQ=255) gCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTccgccg > 2:3263939/1‑93 (MQ=255) cTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCAccgc > 1:3902448/1‑93 (MQ=255) tGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCgccgcc > 1:1903289/1‑93 (MQ=255) gCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTccgccgccg > 1:6894281/1‑93 (MQ=255) gCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCAccgccg < 2:444462/93‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGa > 1:1586182/1‑93 (MQ=255) ccTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGa < 2:6929930/93‑1 (MQ=255) cTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGAt > 2:204787/1‑93 (MQ=255) tGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATa < 1:917061/93‑1 (MQ=255) tGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATa < 2:7376033/93‑1 (MQ=255) gggCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATAc < 2:1143632/93‑1 (MQ=255) gggCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATAc < 2:3955118/93‑1 (MQ=255) gggCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATAc < 2:3599032/93‑1 (MQ=255) gggCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATAc < 2:841212/93‑1 (MQ=255) gggCTGCGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATAc > 2:7092224/1‑93 (MQ=255) gCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCg < 1:28570/93‑1 (MQ=255) cTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGt > 2:1183679/1‑93 (MQ=255) cTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGt < 1:3208019/93‑1 (MQ=255) gtgCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCg < 2:3354069/93‑1 (MQ=255) gCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGt < 1:4266566/93‑1 (MQ=255) gAAAATGTTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTa < 1:179391/93‑1 (MQ=255) gAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTa > 1:6848031/1‑93 (MQ=255) aaaaTGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTaa < 2:1784494/93‑1 (MQ=255) aaTGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAAcc > 2:1432020/1‑93 (MQ=255) aaTGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAAcc < 2:2596697/93‑1 (MQ=255) aTGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACcg > 2:527261/1‑93 (MQ=255) tGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAAGGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACcgc < 1:4217096/93‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACcgcg > 2:554299/1‑93 (MQ=255) gTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCgcgc > 1:5781393/1‑93 (MQ=255) tttCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGGCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCt > 2:5170866/1‑93 (MQ=255) tttCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCt > 2:351601/1‑93 (MQ=255) tttCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCt > 1:3280623/1‑93 (MQ=255) tttCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCt > 2:5363991/1‑93 (MQ=255) tCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTg > 1:5237607/1‑93 (MQ=255) cTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTgg < 2:4148508/93‑1 (MQ=255) tGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGc > 1:1494654/1‑93 (MQ=255) gggATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTggag < 2:5397700/93‑3 (MQ=255) gggATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCg > 2:4734093/1‑93 (MQ=255) ggATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgt < 1:1228380/93‑1 (MQ=255) ggATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgt < 1:1598613/93‑1 (MQ=255) ggATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgt > 1:4752740/1‑93 (MQ=255) aTCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgtnn > 1:2692540/1‑91 (MQ=255) aTCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgtgg > 1:4545106/1‑93 (MQ=255) aTCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgtgg < 1:2674091/93‑1 (MQ=255) aTCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgtgg > 2:748353/1‑93 (MQ=255) tCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgtggt < 1:6593036/93‑1 (MQ=255) tCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCgtggt < 1:2888675/93‑1 (MQ=255) ggTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCa < 1:5182596/93‑1 (MQ=255) gttcgttcTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAg > 2:6372843/1‑93 (MQ=255) gttcgttcTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAg < 2:5943391/93‑1 (MQ=255) tcgttcTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCg < 2:369858/93‑1 (MQ=255) ttcTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCt > 2:3632123/1‑93 (MQ=255) ttcTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCt > 2:2202094/1‑93 (MQ=255) tcTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTg < 1:3036799/93‑1 (MQ=255) tcTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTg > 2:3903294/1‑93 (MQ=255) cTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGt > 1:7377651/1‑93 (MQ=255) tACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGtt > 2:2107912/1‑93 (MQ=255) tACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGtt > 1:2312064/1‑93 (MQ=255) aCAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATCCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTg < 1:6140493/93‑1 (MQ=255) cAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTgg < 1:1312901/93‑1 (MQ=255) aGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGgt < 2:6251493/93‑1 (MQ=255) gCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGgtg > 2:1965327/1‑93 (MQ=255) gCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGgtg < 2:2842252/93‑1 (MQ=255) gCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGgtg > 1:3816172/1‑93 (MQ=255) nngcgTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGgtgt < 1:105440/91‑1 (MQ=255) ccGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGgtgt < 2:4401129/93‑1 (MQ=255) cgcgTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGtgtg > 1:5028526/1‑93 (MQ=255) gcgTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGc > 1:4682309/1‑93 (MQ=255) gTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCAc < 1:402974/93‑1 (MQ=255) ggTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGc < 1:1653749/93‑1 (MQ=255) gTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCa < 1:340912/93‑1 (MQ=255) gTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCa < 1:48650/93‑1 (MQ=255) gTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCa > 1:6988388/1‑93 (MQ=255) gATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTc < 2:2493372/93‑1 (MQ=255) atatTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCg < 2:392480/93‑1 (MQ=255) atTCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGcc > 1:7438963/1‑93 (MQ=255) ttCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCa < 2:422965/93‑1 (MQ=255) ttCCGCAAATGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCa > 1:5620190/1‑93 (MQ=255) gCAAATGGGTCCTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAgcgc < 1:2594424/93‑1 (MQ=255) gCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAgcgc > 1:4392201/1‑93 (MQ=255) aaaTGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCg > 2:4898386/1‑93 (MQ=255) aaaTGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCg > 1:1002377/1‑93 (MQ=255) aaTGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGTTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGt < 2:7358546/93‑1 (MQ=255) aaTGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGt > 2:239815/1‑93 (MQ=255) aTGGGTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGtt < 2:6091801/93‑1 (MQ=255) ggTCCTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGAc < 1:2538285/93‑1 (MQ=255) ggTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGGTTCGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGAc > 1:6227099/1‑93 (MQ=255) ggTACTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGAc < 2:5791405/93‑1 (MQ=255) aCTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAg < 2:1600056/93‑1 (MQ=255) aCTCATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAg > 1:2183999/1‑93 (MQ=255) cATTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAgcgc < 2:1513964/93‑1 (MQ=255) aTTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCa > 1:5952415/1‑93 (MQ=255) aTTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCa > 2:3016407/1‑93 (MQ=255) aTTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCa > 2:3854186/1‑93 (MQ=255) aTTCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCa < 2:2947871/93‑1 (MQ=255) ttCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGACGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAg > 2:4786006/1‑93 (MQ=255) tCCGCCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGa < 2:2534438/93‑1 (MQ=255) tCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGa > 2:4180871/1‑93 (MQ=255) | ACGGCTGCCTGGGCTGTGCGGAAAATGGTTTCTGGGATCGCGGTTCGTTCTACAGCCGCGTGGTCGATATTCCGCAAATGGGTACTCATTCCACCGCCGATACCGTCGGTTTAACCGCGCTTGGCGTGGTGGCAGCGGCTGTTGGTGTGCACGCAGTCGCCAGCGCCGTTGACCAGCGCAGA > NC_000913/1032236‑1032417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |