| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,066,017 | T→C | F404L (TTT→CTT) | agp → | periplasmic glucose‑1‑phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,066,017 | 0 | T | C | 86.8% | 640.8 / 84.9 | 266 | F404L (TTT→CTT) | agp | periplasmic glucose‑1‑phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (15/20); new base C (118/112); total (133/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
ATGCGTTAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTACGTTCGATG > NC_000913/1065925‑1066108 | tGCGTTAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGtt < 2:5205150/93‑1 (MQ=255) gCGTTAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGctt > 2:6707948/1‑93 (MQ=255) gCGTTAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGctt > 1:1307068/1‑93 (MQ=255) gCGTTAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGctt < 1:3184466/93‑1 (MQ=255) gCGTTAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGctt > 1:3070348/1‑93 (MQ=255) gTTAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGa > 2:4965253/1‑93 (MQ=255) ttAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGAt > 2:1499004/1‑93 (MQ=255) ttAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGAt > 2:3514814/1‑93 (MQ=255) tAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATa < 1:562283/93‑1 (MQ=255) tAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATa < 2:5060744/93‑1 (MQ=255) tAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATa < 1:3590375/93‑1 (MQ=255) tAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATa > 2:4410186/1‑93 (MQ=255) aCCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTTATAGc > 1:5972724/1‑93 (MQ=255) ccTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTTGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCgt < 2:45256/93‑1 (MQ=255) ccTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCgt > 1:4803259/1‑93 (MQ=255) cTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCgtg < 2:2436866/93‑1 (MQ=255) tGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCgtgt < 1:6232177/93‑1 (MQ=255) tGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCgtgt < 1:6111938/93‑1 (MQ=255) cAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtg < 2:303982/93‑1 (MQ=255) aGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtga > 1:6450752/1‑93 (MQ=255) aGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtga < 1:3890148/93‑1 (MQ=255) ggCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtgaa < 1:4778606/93‑1 (MQ=255) ggCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtgaa < 2:3409183/93‑1 (MQ=255) gCACCTGCGCAGCGT‑GTGTCGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtgaat < 2:2608349/93‑1 (MQ=255) gCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTtgaat > 1:7062931/1‑93 (MQ=255) aCCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtgaatga > 1:7077254/1‑93 (MQ=255) ccTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtgaatgaa > 1:2933123/1‑93 (MQ=255) ccTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTtgaatgaa > 1:5529497/1‑93 (MQ=255) tGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGc < 1:3430188/93‑1 (MQ=255) gcgcAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCg > 1:1913390/1‑93 (MQ=255) cgcAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCgg < 2:1043103/93‑1 (MQ=255) gcAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGt < 1:5881581/93‑1 (MQ=255) aGCGTGGTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTg > 1:2361912/1‑93 (MQ=255) gCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGaa < 1:2180390/93‑1 (MQ=255) cGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGaaa > 2:7419073/1‑93 (MQ=255) cGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGaaa < 2:2785389/93‑1 (MQ=255) gt‑gtGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAAt < 2:1521827/93‑1 (MQ=255) t‑gtgACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATa > 1:1981606/1‑93 (MQ=255) t‑gtgACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATa > 2:6050037/1‑93 (MQ=255) gtgACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATaa > 1:6045839/1‑93 (MQ=255) tgACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAAc > 2:2056726/1‑93 (MQ=255) tgACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAAc < 1:3738089/93‑1 (MQ=255) gACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACa < 1:7515986/93‑1 (MQ=255) cGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGa < 1:4182559/93‑1 (MQ=255) gCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGaa > 1:5593006/1‑93 (MQ=255) cTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGAGGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGaaa < 2:2894852/93‑1 (MQ=255) tGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGaaaa > 2:942112/1‑93 (MQ=255) tGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGaaaa > 1:6576934/1‑93 (MQ=255) ggAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAAc > 2:5761741/1‑93 (MQ=255) ggAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAAc < 2:1311805/93‑1 (MQ=255) aaTTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTc < 1:6839123/93‑1 (MQ=255) ttAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTccc > 1:4384041/1‑93 (MQ=255) tAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTcccc < 2:3067901/93‑1 (MQ=255) gCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCcgc < 2:2918946/93‑1 (MQ=255) gCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCcgc < 2:6321974/93‑1 (MQ=255) gTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCgag > 2:1113184/1‑93 (MQ=255) gTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCgag > 2:7110247/1‑93 (MQ=255) tGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGaa < 2:3861279/93‑1 (MQ=255) tGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGaa > 1:5080677/1‑93 (MQ=255) cccGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGc < 1:3952146/93‑1 (MQ=255) cccGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGc < 1:680099/93‑1 (MQ=255) ccGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCg < 2:84334/93‑1 (MQ=255) ccGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCg < 2:6499023/93‑1 (MQ=255) cGATAGACGCTGACGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCgg < 2:6247495/93‑1 (MQ=255) gATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCggg > 1:5676062/1‑93 (MQ=255) gATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCggg > 1:59409/1‑93 (MQ=255) tAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCggggg > 1:4751557/1‑93 (MQ=255) tAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCggggg < 1:1497313/93‑1 (MQ=255) tAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCggggg > 1:2710949/1‑93 (MQ=255) tAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCggggg > 2:1374233/1‑93 (MQ=255) gACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAg > 1:577259/1‑93 (MQ=255) cGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTc < 2:5614300/93‑1 (MQ=255) cGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTc < 2:3605256/93‑1 (MQ=255) gCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCg > 2:2308348/1‑93 (MQ=255) cTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGc > 2:7164402/1‑93 (MQ=255) cTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGc < 1:3280971/93‑1 (MQ=255) cTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACCCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGc < 2:3946124/93‑1 (MQ=255) cTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTAAAATAACAGAAAACCCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGc < 1:102841/93‑1 (MQ=255) tGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCt > 1:367752/1‑93 (MQ=255) gATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTg < 1:1075501/93‑1 (MQ=255) gTTTCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTa > 1:1181994/1‑93 (MQ=255) tttCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTAAAATAACAGAAAACCCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTaa < 2:1709434/93‑1 (MQ=255) tccTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTaaa < 1:2425300/91‑1 (MQ=255) tCTGCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAAc > 1:1547444/1‑93 (MQ=255) tGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGt < 2:2187450/93‑1 (MQ=255) gCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGtt < 1:7235483/93‑1 (MQ=255) gCCCGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGtt > 2:6866231/1‑93 (MQ=255) ccGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGtttt > 1:6943926/1‑93 (MQ=255) ccGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGtttt < 2:2483909/93‑1 (MQ=255) ccGATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGtttt < 1:4696037/93‑1 (MQ=255) gATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTa < 2:1945914/93‑1 (MQ=255) gATGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTa < 2:2749880/93‑1 (MQ=255) aTGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTAc < 2:4812550/93‑1 (MQ=255) tGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAGCTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTACg < 2:5472157/93‑1 (MQ=255) tGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTann > 1:1361572/1‑91 (MQ=255) tGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTACg < 2:4729434/93‑1 (MQ=255) tGGATAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTACg < 1:4533564/93‑1 (MQ=255) tAAGCTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTACGTTCg > 1:5414673/1‑93 (MQ=255) aaGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTACGTTCGa > 1:55500/1‑93 (MQ=255) gTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTACGTTCGATg < 2:7335446/93‑1 (MQ=255) | ATGCGTTAACCCTGCAGGCACCTGCGCAGCGT‑GTGACGCTGGAATTAAGCGGTTGCCCGATAGACGCTGATGGTTTCTGCCCGATGGATAAGTTTGATAGCGTGTTGAATGAAGCGGTGAAATAACAGAAAACTCCCCCGCGAGAAGCGGGGGAGTCGCTGGTTAAACGTTTTTACGTTCGATG > NC_000913/1065925‑1066108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |