| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,127,881 | T→C | F274L (TTT→CTT) | mviN → | putative virulence factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,127,881 | 0 | T | C | 85.9% | 638.7 / 82.5 | 270 | F274L (TTT→CTT) | mviN | putative virulence factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/13); new base C (136/96); total (161/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
GCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCATGATGAATAC > NC_000913/1127789‑1127970 | gCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGt > 2:1211146/1‑93 (MQ=255) ccAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGtt > 2:3534431/1‑93 (MQ=255) aGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTtc > 2:4786672/1‑93 (MQ=255) gATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTtcc < 1:6064055/93‑1 (MQ=255) aTCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTtccg > 1:2111174/1‑93 (MQ=255) tctcCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTtccgt > 1:1645992/1‑93 (MQ=255) tctcCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTtccgt > 2:4516197/1‑93 (MQ=255) tctcCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTtccgt > 1:5568927/1‑93 (MQ=255) ctcCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTtccgtc > 1:5088261/1‑93 (MQ=255) ctcCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTtccgtc > 1:3672214/1‑93 (MQ=255) tcCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTtccgtcc > 1:4837142/1‑93 (MQ=255) ccTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTtccgtccg > 2:6727514/1‑93 (MQ=255) ttAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGgt > 1:2700893/1‑93 (MQ=255) ttAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGCCCGgt < 2:5081247/93‑1 (MQ=255) tAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGgtg > 2:6156739/1‑93 (MQ=255) tAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGgtg > 2:3935165/1‑93 (MQ=255) aaTCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGgtgt < 1:5529174/93‑1 (MQ=255) atcatcAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACTGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGtgtg > 2:3322692/1‑93 (MQ=255) atcatcAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGtgtg > 2:4125741/1‑93 (MQ=255) tcatcaACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGc > 1:6376876/1‑93 (MQ=255) catcaACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCt > 1:7033422/1‑93 (MQ=255) atcaACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTg < 1:2908338/93‑1 (MQ=255) atcaACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTg > 1:2874370/1‑93 (MQ=255) atcaACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTg > 2:4587714/1‑93 (MQ=255) atcaACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTg < 1:4193667/93‑1 (MQ=255) tcaACACCATTTTTGCCTCGGTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTg > 1:1149757/1‑93 (MQ=255) tcaACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTgg < 1:4544590/93‑1 (MQ=255) tcaACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTgg > 1:6958782/1‑93 (MQ=255) caACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTggg < 2:5217831/93‑1 (MQ=255) caACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCAGTGTGCTggg < 2:4407363/93‑1 (MQ=255) cacCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGt < 2:2808298/93‑1 (MQ=255) acCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTg > 2:4270891/1‑93 (MQ=255) acCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTg > 2:316973/1‑93 (MQ=255) acCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTg < 2:6325042/93‑1 (MQ=255) ccATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTgg > 1:5600631/1‑93 (MQ=255) cATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgc < 2:4332798/93‑1 (MQ=255) cATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgc > 1:6680480/1‑93 (MQ=255) aTTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgcg > 1:1768284/1‑93 (MQ=255) aTTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgcg > 1:2823351/1‑93 (MQ=255) aTTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgcg > 2:5897474/1‑93 (MQ=255) aTTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgcg > 2:2898756/1‑93 (MQ=255) aTTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgcg > 2:3648559/1‑93 (MQ=255) tttttGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgcgc > 2:6991832/1‑93 (MQ=255) tttttGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGgcgc < 2:5302380/93‑1 (MQ=255) tttGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCtt > 1:580622/1‑93 (MQ=255) tttGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCtt < 2:5433156/93‑1 (MQ=255) ttGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTg > 2:2376645/1‑93 (MQ=255) ccTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCa > 1:6475575/1‑93 (MQ=255) cTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCAc > 2:3785381/1‑93 (MQ=255) cTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCAc > 1:5718908/1‑93 (MQ=255) cTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGCGGCGCTTGGCAc > 1:2196251/1‑93 (MQ=255) tC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCAcc > 2:2335850/1‑93 (MQ=255) tttCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCAtt > 2:4725524/1‑93 (MQ=255) ttGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTtgc > 2:5963527/1‑93 (MQ=255) ttGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTtgc > 1:5201925/1‑93 (MQ=255) tGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTtgct > 1:6430206/1‑93 (MQ=255) gCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTtgctg > 1:3108182/1‑93 (MQ=255) cTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTtgctgc > 2:2648541/1‑93 (MQ=255) tCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCg < 2:3672320/93‑1 (MQ=255) ccGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGt < 2:5858012/93‑1 (MQ=255) ccGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGt < 2:3419470/93‑1 (MQ=255) cGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTc > 1:392664/1‑93 (MQ=255) ggTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCg > 2:7376539/1‑93 (MQ=255) gTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGc < 1:4694046/93‑1 (MQ=255) ggTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTc > 2:1415328/1‑93 (MQ=255) ggTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTc < 2:4648554/93‑1 (MQ=255) ggTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCAGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTc > 1:7473828/1‑93 (MQ=255) gtgtCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCg > 1:863053/1‑93 (MQ=255) gtCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGaa < 1:1410658/93‑1 (MQ=255) tCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGaaa > 1:372153/1‑93 (MQ=255) 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tGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTg > 1:1852199/1‑93 (MQ=255) gTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGc > 1:6615371/1‑93 (MQ=255) gTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGc > 2:5703235/1‑93 (MQ=255) ttACGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAg > 2:849010/1‑93 (MQ=255) cGCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTgg < 1:1942585/93‑1 (MQ=255) gCCGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGc > 2:1054528/1‑93 (MQ=255) ccGACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCa < 1:6239664/93‑1 (MQ=255) gACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAAt < 1:7376576/93‑1 (MQ=255) gACCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAAt > 1:6770668/1‑93 (MQ=255) aCCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATc > 2:2098767/1‑93 (MQ=255) aCCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATc < 1:7257792/93‑1 (MQ=255) aCCGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATc < 1:2465031/93‑1 (MQ=255) ccGCTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCa > 1:4367073/1‑93 (MQ=255) gCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCatg > 1:258743/1‑93 (MQ=255) gCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCatg > 2:4947382/1‑93 (MQ=255) cTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCatga > 1:3835626/1‑93 (MQ=255) cTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCatga < 2:6170566/93‑1 (MQ=255) cTTAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCatga > 2:7071296/1‑93 (MQ=255) ttAATGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCatgat > 2:6490469/1‑93 (MQ=255) aaTGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCAtgatga > 1:5380365/1‑93 (MQ=255) aaTGGAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCAtgatga < 2:1655607/93‑1 (MQ=255) ggAGCTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCATGATGAATa < 1:1678634/93‑1 (MQ=255) | GCCAGATCTCCTTAATCATCAACACCATTTTTGCCTC‑GTTTCTTGCTTCCGGTTCGGTGTCTTGGATGTATTACGCCGACCGCTTAATGGAGTTTCCGTCCGGTGTGCTGGGCGTGGCGCTTGGCACCATTTTGCTGCCGTCGCTGTCGAAAAGTTTTGCCAGTGGCAATCATGATGAATAC > NC_000913/1127789‑1127970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |