| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,155,780 | A→G | T266A (ACC→GCC) | holB → | DNA polymerase III delta prime subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,155,780 | 0 | A | G | 83.6% | 467.8 / 84.4 | 213 | T266A (ACC→GCC) | holB | DNA polymerase III delta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (18/17); new base G (94/84); total (112/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
CTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCAC > NC_000913/1155690‑1155869 | cTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGcc > 1:3049398/1‑93 (MQ=255)cTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGcc > 2:2328774/1‑93 (MQ=255)cTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGcc > 1:5043563/1‑93 (MQ=255)cTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGcc > 2:6524910/1‑93 (MQ=255) ttAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCa > 1:6495607/1‑93 (MQ=255) ttAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCa > 1:216033/1‑93 (MQ=255) tAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCaa > 1:6767381/1‑93 (MQ=255) aTCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATg > 1:1367082/1‑93 (MQ=255) tCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGt > 1:2249289/1‑93 (MQ=255) aTGGACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTg > 1:6973404/1‑93 (MQ=255) aTGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTg > 2:5946854/1‑93 (MQ=255) tGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGa < 2:1413531/93‑1 (MQ=255) gAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAt > 1:3244100/1‑93 (MQ=255) aaCAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAtg < 1:1639820/93‑1 (MQ=255) aaCAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAtg > 2:3208491/1‑93 (MQ=255) aCAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAtgt < 2:5327380/93‑1 (MQ=255) cAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAtgtg > 2:5608/1‑93 (MQ=255) cAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAtgtg > 2:5545029/1‑93 (MQ=255) aGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGcc < 2:3968217/93‑1 (MQ=255) aGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGcc < 1:1166276/93‑1 (MQ=255) gCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCg < 1:5274192/93‑1 (MQ=255) gCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCg < 2:4794333/93‑1 (MQ=255) tCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCggg > 2:1373396/1‑93 (MQ=255) nngcgcGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGcc < 2:2862240/91‑1 (MQ=255) gcgcGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTg > 1:3333395/1‑93 (MQ=255) gcgcGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTg < 2:5511389/93‑1 (MQ=255) gcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGt > 2:4619324/1‑93 (MQ=255) gcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGt > 1:4609793/1‑93 (MQ=255) gcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGt < 1:2107337/93‑1 (MQ=255) gcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGt < 2:1796670/93‑1 (MQ=255) gcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGt > 2:5062226/1‑93 (MQ=255) cgTTTACCCTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGGGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTc < 1:2988733/93‑1 (MQ=255) cgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTc > 2:6629393/1‑93 (MQ=255) gTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCg > 2:4388606/1‑93 (MQ=255) tttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTcnn > 1:3153130/1‑91 (MQ=255) tttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGc < 1:597548/93‑1 (MQ=255) tttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGc > 2:6847002/1‑93 (MQ=255) tttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGc < 1:190079/93‑1 (MQ=255) ttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGcc < 1:4958456/93‑1 (MQ=255) ttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGcc > 1:7079178/1‑93 (MQ=255) cacTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGaa > 2:5166936/1‑93 (MQ=255) cacTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGaa > 2:2806267/1‑93 (MQ=255) tggctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTg > 2:1949726/1‑93 (MQ=255) gctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGc < 1:1116449/93‑1 (MQ=255) ctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCa < 1:756128/93‑1 (MQ=255) tggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCaa > 2:7190545/1‑93 (MQ=255) ggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGTCGTGGTCGCCGAACTGGCaaa < 1:2333121/93‑1 (MQ=255) ggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCaaa > 1:424593/1‑93 (MQ=255) ggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCaaa > 1:442521/1‑93 (MQ=255) aaCGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCa < 1:5506322/93‑1 (MQ=255) aaCGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCa > 2:2083488/1‑93 (MQ=255) aCGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCAt > 1:5367116/1‑93 (MQ=255) cGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATc < 1:6057988/93‑1 (MQ=255) cGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATc < 2:3403022/93‑1 (MQ=255) ttGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCtt > 2:725290/1‑93 (MQ=255) tGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCttt < 1:2910566/93‑1 (MQ=255) tGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCttt > 1:5798381/1‑93 (MQ=255) tGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTtctc < 1:790685/93‑1 (MQ=255) tGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTtctc < 2:6179961/93‑1 (MQ=255) atggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTccc < 1:939775/93‑1 (MQ=255) atggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTccc < 1:371771/93‑1 (MQ=255) tggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCt > 1:4369184/1‑93 (MQ=255) gatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTcg > 2:4689154/1‑93 (MQ=255) gcTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCt < 2:2996533/93‑1 (MQ=255) tAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGc < 1:271701/93‑1 (MQ=255) tAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGc < 2:1728186/93‑1 (MQ=255) aaaCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAg > 1:5346297/1‑93 (MQ=255) aaCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAgg < 2:6793122/93‑1 (MQ=255) aCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGc < 1:2955758/93‑1 (MQ=255) aCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGc < 2:2889290/93‑1 (MQ=255) cGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCt > 1:7235276/1‑93 (MQ=255) cGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCt < 1:2645272/93‑1 (MQ=255) cGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCt > 2:3300210/1‑93 (MQ=255) gCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGcca > 1:6176475/1‑91 (MQ=255) gCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCta > 1:4787093/1‑93 (MQ=255) ccATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCtat < 1:1791310/93‑1 (MQ=255) ccATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCtat > 1:4210153/1‑93 (MQ=255) catcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCtata < 2:7074553/93‑1 (MQ=255) catcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCtata < 2:4308472/93‑1 (MQ=255) catcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCtata > 2:24845/1‑93 (MQ=255) atcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATAc < 1:399504/93‑1 (MQ=255) atcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATAc > 1:3427536/1‑93 (MQ=255) atcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATAc < 1:1224031/93‑1 (MQ=255) atcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATAc < 1:1001281/93‑1 (MQ=255) atcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATAc < 1:5914637/93‑1 (MQ=255) atcatGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATAc < 2:5803986/93‑1 (MQ=255) tcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACt > 1:1573692/1‑93 (MQ=255) tcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACt < 1:2004690/93‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTggg < 1:6572117/93‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTggg < 2:3747845/93‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGa < 1:4306302/93‑1 (MQ=255) tgcGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGt < 2:4542819/93‑1 (MQ=255) tgcGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGt > 2:3783973/1‑93 (MQ=255) tgcGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGt < 1:5325899/93‑1 (MQ=255) gcgcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGtt < 1:6271626/93‑1 (MQ=255) gcgcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGtt < 1:5416171/93‑1 (MQ=255) aGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGcc > 2:3440823/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGcc > 2:1849799/1‑93 (MQ=255) ggTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCca > 2:6016508/1‑93 (MQ=255) gTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCcac < 1:5458288/93‑1 (MQ=255) | CTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCAC > NC_000913/1155690‑1155869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |