| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,520,926 | A→G | M55T (ATG→ACG) | b1451 ← | putative outer membrane receptor for iron transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,520,926 | 0 | A | G | 84.3% | 451.2 / 71.2 | 197 | M55T (ATG→ACG) | b1451 | putative outer membrane receptor for iron transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (14/17); new base G (93/73); total (107/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
AATCTTGCGCATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGTTCA > NC_000913/1520834‑1521015 | tCTTGCGCATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGtc > 1:4817710/1‑93 (MQ=255) tCTTGCGCATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGtc > 1:1551728/1‑93 (MQ=255) cTTGCGCATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGtct > 2:4479348/1‑93 (MQ=255) ttGCGCATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGtctc > 1:1474538/1‑93 (MQ=255) tGCGCATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTctcc < 1:5647576/93‑1 (MQ=255) gcgcATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTctcct > 1:5144935/1‑93 (MQ=255) gcgcATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATctcct < 2:7212429/93‑1 (MQ=255) gcATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCg > 1:5372877/1‑93 (MQ=255) gcATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCg > 2:670571/1‑93 (MQ=255) cATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTctcctccc > 2:6344423/1‑91 (MQ=255) cATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGc < 1:4026734/93‑1 (MQ=255) cATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGc > 1:3714122/1‑93 (MQ=255) aTAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGcc > 2:1266718/1‑93 (MQ=255) tAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCa > 1:6042592/1‑93 (MQ=255) tAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCa > 1:7516712/1‑93 (MQ=255) tAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCa > 1:3260871/1‑93 (MQ=255) aGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCAt > 1:6772053/1‑93 (MQ=255) aGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCAt < 2:5445500/93‑1 (MQ=255) gTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATc > 1:3341424/1‑93 (MQ=255) ttCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATcc > 2:3416392/1‑93 (MQ=255) tCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATcca < 1:7282601/93‑1 (MQ=255) tCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATcca > 2:5968566/1‑93 (MQ=255) tGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATccacc > 2:6960502/1‑93 (MQ=255) gCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATccacca > 2:516243/1‑93 (MQ=255) gCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATccacca < 2:6882189/93‑1 (MQ=255) ggTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGc < 1:7186185/93‑1 (MQ=255) ggTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGGCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGc > 2:6191602/1‑93 (MQ=255) gTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCt > 1:1405065/1‑93 (MQ=255) gTTTTGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCt > 1:2068468/1‑93 (MQ=255) ttttGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCtt > 1:5749734/1‑93 (MQ=255) ttttGTACCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCtt > 1:887513/1‑93 (MQ=255) tttGTACCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTa > 2:4368562/1‑93 (MQ=255) ttGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTAc < 2:2514617/93‑1 (MQ=255) tGTACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTAct < 1:5080567/93‑1 (MQ=255) tACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgc < 1:4238199/93‑1 (MQ=255) tACCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgc < 1:651131/93‑1 (MQ=255) aCCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgct > 1:3663944/1‑93 (MQ=255) aCCTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgct < 2:4583057/93‑1 (MQ=255) aCCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgct < 1:4495548/93‑1 (MQ=255) aCCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgct < 1:214454/93‑1 (MQ=255) cTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgctgc > 1:3487230/1‑93 (MQ=255) cTGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgctgc < 1:5238404/93‑1 (MQ=255) tGCAAACCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTActgctgct < 1:2266276/93‑1 (MQ=255) aaaCCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTggg > 1:2999292/1‑93 (MQ=255) aaaCCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTggg < 1:4384386/93‑1 (MQ=255) aaCCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTgggg < 1:6423946/93‑1 (MQ=255) aaCCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTgggg > 2:5327500/1‑93 (MQ=255) aaCCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTgggg < 2:2364648/93‑1 (MQ=255) aCCAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGt < 1:5557371/93‑1 (MQ=255) cAGGCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTAt < 1:2583461/93‑1 (MQ=255) ggCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTGCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATcc > 2:1389597/1‑93 (MQ=255) ggCGCGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATcc > 1:3791936/1‑93 (MQ=255) gcGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGt < 2:1559240/92‑1 (MQ=255) cGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGtt < 1:2795793/93‑1 (MQ=255) gCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTc > 2:3053272/1‑93 (MQ=255) ggTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGa > 2:1113912/1‑93 (MQ=255) gTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGaa > 1:667705/1‑93 (MQ=255) tCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGaaa > 1:1105648/1‑93 (MQ=255) aGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAacc > 1:5434775/1‑93 (MQ=255) gTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAacca > 1:3611277/1‑93 (MQ=255) tGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAaccac < 2:1445168/93‑1 (MQ=255) gATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAaccacc < 1:291986/93‑1 (MQ=255) gATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAaccacc < 2:3210560/93‑1 (MQ=255) gATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAaccacc > 1:1044463/1‑93 (MQ=255) aTTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCt < 2:7390591/93‑1 (MQ=255) ttCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtg < 1:1969284/93‑1 (MQ=255) ttCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtg > 1:1188909/1‑93 (MQ=255) tCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgc < 1:4139633/93‑1 (MQ=255) cGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcg < 2:2353162/93‑1 (MQ=255) ggACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcgg > 2:4265538/1‑93 (MQ=255) gACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcggt < 2:4082431/93‑1 (MQ=255) aCAAGTTAATGCGCGGTGTTGCGAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcggtg < 1:3037570/93‑1 (MQ=255) aCAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcggtg > 2:5773195/1‑93 (MQ=255) cAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcggtgc > 2:5828043/1‑93 (MQ=255) cAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcggtgc > 2:5425838/1‑93 (MQ=255) cAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcggtgc > 2:172724/1‑93 (MQ=255) cAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCGGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcggtgc < 1:3453222/93‑1 (MQ=255) aGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCtgcggtgcgg > 1:1750267/1‑93 (MQ=255) gTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGc > 1:5259231/1‑93 (MQ=255) ttAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCa > 2:2765973/1‑93 (MQ=255) tAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCAc < 2:1789214/93‑1 (MQ=255) tGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGa > 1:7072874/1‑93 (MQ=255) tGCGCGGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGa < 2:2553770/93‑1 (MQ=255) gcgGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACaa > 2:5004055/1‑93 (MQ=255) cgGTGTTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAAt < 2:2444037/93‑1 (MQ=255) gtgtTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCa > 2:2146259/1‑93 (MQ=255) gtgtTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCa > 2:5886934/1‑93 (MQ=255) gtTGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATa < 1:822073/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAg < 2:7111218/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAg > 1:2218270/1‑93 (MQ=255) tGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGt < 2:5216981/93‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCt > 1:6350133/1‑93 (MQ=255) aGGCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGt < 2:5552189/93‑1 (MQ=255) ggCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGtt > 1:684667/1‑93 (MQ=255) ggCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGtt > 1:471913/1‑93 (MQ=255) ggCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGtt > 1:428833/1‑93 (MQ=255) ggCGCGTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGtt > 1:3597204/1‑93 (MQ=255) cgcgTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGTtca < 2:2949049/93‑1 (MQ=255) cgcgTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGTtca > 2:3700929/1‑93 (MQ=255) cgcgTCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGTtca < 2:900200/93‑1 (MQ=255) | AATCTTGCGCATAGTTCTGCCGGTTTTGTACCTGCAAACCAGGCACGCCGGTCAGTGATTCGGACAAGTTAATGCGCGGTGTTGCCAGGCGCATCTCCTCGCCATCCACCACGCTTACTGCTGCTGGGGTATCCAGTTCTGAAACCACCTGCGGTGCGGCACTGACAATCATAGTCTGTTCA > NC_000913/1520834‑1521015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |