Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,102,539 | T→C | T190A (ACC→GCC) | wbbJ ← | putative O‑acetyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,102,539 | 0 | T | C | 81.2% | 527.1 / 128.5 | 257 | T190A (ACC→GCC) | wbbJ | putative O‑acetyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (21/27); new base C (117/91); total (139/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.48e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.64e-01 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGC > NC_000913/2102448‑2102628 | tgcCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCa > 2:4897592/1‑93 (MQ=255) gcCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCAt < 2:510162/93‑1 (MQ=255) cAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGa < 1:1810877/93‑1 (MQ=255) aaaaTTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGAtt < 1:4114897/93‑1 (MQ=255) aaTTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGt < 2:4191384/93‑1 (MQ=255) aTTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTa > 2:3528438/1‑93 (MQ=255) ttttttCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTAt > 1:6392106/1‑93 (MQ=255) ttttttCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTAt > 1:2525156/1‑93 (MQ=255) tttttCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTAtt < 1:5930465/93‑1 (MQ=255) ttttCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGAGCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTAttt < 1:221748/93‑1 (MQ=255) ttttCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTAttt > 1:5323349/1‑93 (MQ=255) ttCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCt < 2:2141649/93‑1 (MQ=255) tCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCtt > 1:1451635/1‑93 (MQ=255) cAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCttt < 1:1341863/93‑1 (MQ=255) aaaaTGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTa > 1:2815092/1‑93 (MQ=255) aaTGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATg < 2:6071918/93‑1 (MQ=255) aTGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGa > 1:2176742/1‑93 (MQ=255) aTGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGa > 2:4638961/1‑93 (MQ=255) ttgTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGAt > 2:6718156/3‑93 (MQ=255) tGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGAt > 1:819283/1‑93 (MQ=255) ggTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGAtt > 2:7516640/1‑93 (MQ=255) gTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGAttt > 1:3948831/1‑93 (MQ=255) gTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGAttt > 1:2711547/1‑93 (MQ=255) tAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGAtttt > 2:4118637/1‑93 (MQ=255) tAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGAtttt > 2:2518394/1‑93 (MQ=255) aaaTGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGAttttt < 2:661927/93‑1 (MQ=255) aaaTGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGAttttt < 1:5881892/93‑1 (MQ=255) aaTGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTg > 2:4562284/1‑93 (MQ=255) aTGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGc < 1:6652646/93‑1 (MQ=255) aTGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGc < 2:642998/93‑1 (MQ=255) aTGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGc < 1:3389400/93‑1 (MQ=255) gACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTgg < 2:5148725/93‑1 (MQ=255) gACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTgg > 2:4426166/1‑93 (MQ=255) gACCACCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTgg > 1:4657108/1‑93 (MQ=255) ccGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTa < 2:3018517/93‑1 (MQ=255) ccGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTa < 2:3952092/93‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACt > 1:3051129/1‑93 (MQ=255) cAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTcc < 1:3196955/93‑1 (MQ=255) gTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCg > 2:7375703/1‑93 (MQ=255) gTGGAAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGCCCTCATGTTTGAATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTATTCCCg > 1:2393250/1‑93 (MQ=255) tGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGc > 2:3772628/1‑93 (MQ=255) ggTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCa > 2:1817318/1‑93 (MQ=255) gTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCaa < 1:4911471/93‑1 (MQ=255) gTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCaa > 2:732734/1‑93 (MQ=255) gTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCaa > 1:4203572/1‑93 (MQ=255) tAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAAt < 2:4305605/93‑1 (MQ=255) tAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAAt > 1:4992477/1‑93 (MQ=255) tAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAAt > 1:7151071/1‑93 (MQ=255) aaaaTTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATg < 2:5252981/93‑1 (MQ=255) aaaTTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGa < 1:1962138/93‑1 (MQ=255) aaTTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGAc < 2:1017902/93‑1 (MQ=255) ttGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAg < 2:275485/93‑1 (MQ=255) gACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTa < 2:2399440/93‑1 (MQ=255) aCCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTAt > 1:5431092/1‑93 (MQ=255) gCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTAtttt > 2:705523/1‑93 (MQ=255) gCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTAtttt > 1:4272701/1‑93 (MQ=255) cAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTc < 1:970085/93‑1 (MQ=255) cAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTc < 2:1205837/93‑1 (MQ=255) aGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCg > 1:6797183/1‑93 (MQ=255) gAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCgg > 2:144792/1‑93 (MQ=255) gAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCgg > 2:3047893/1‑93 (MQ=255) gAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCgg > 1:4528694/1‑93 (MQ=255) aacaacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGa < 2:3266405/93‑1 (MQ=255) aacaacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGa > 1:3129996/1‑93 (MQ=255) aacaacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGa < 1:3863535/93‑1 (MQ=255) aacaacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGa < 2:4433478/93‑1 (MQ=255) acaacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGaa > 2:6798302/1‑93 (MQ=255) caacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAAt < 2:4028421/93‑1 (MQ=255) caacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAAt < 1:164964/93‑1 (MQ=255) caacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAAt < 2:4970001/93‑1 (MQ=255) aacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATa < 2:5444513/93‑1 (MQ=255) aacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATa > 1:3660681/1‑93 (MQ=255) aacGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATa < 2:5069439/93‑1 (MQ=255) acGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAg < 1:568513/93‑1 (MQ=255) cGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGa > 2:1416299/1‑93 (MQ=255) gACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGaa < 1:631956/93‑1 (MQ=255) gACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGaa < 2:6531083/93‑1 (MQ=255) gACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGaa < 2:1595344/93‑1 (MQ=255) cTATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAAcc > 1:7009113/1‑93 (MQ=255) tATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACct > 1:2540125/1‑93 (MQ=255) tATGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACct > 2:4781385/1‑93 (MQ=255) aTGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTAGTCCCGCCATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACctc > 2:3471924/1‑93 (MQ=255) aTGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACctc > 2:7206929/1‑93 (MQ=255) aTGCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACctc > 1:7478437/1‑93 (MQ=255) gCTTTTTCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTa > 2:552616/1‑93 (MQ=255) ttttCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTaaca < 2:4155448/93‑1 (MQ=255) ttttCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTaaca > 2:2259709/1‑93 (MQ=255) ttCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTaacaac > 2:6005366/1‑93 (MQ=255) tCCCATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAacaaca < 2:1740047/93‑1 (MQ=255) cATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGaa > 1:2597385/1‑93 (MQ=255) cATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGaa > 2:6268286/1‑93 (MQ=255) cATAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGaa < 2:3207948/93‑1 (MQ=255) aTAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAAt > 1:1932052/1‑93 (MQ=255) aTAATTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAAt > 1:404764/1‑93 (MQ=255) tAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAAtt < 1:3906467/93‑1 (MQ=255) aaTTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTg > 1:1702985/1‑93 (MQ=255) aTTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTgg > 1:7340714/1‑93 (MQ=255) aTTTGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTgg > 1:6543461/1‑93 (MQ=255) tttGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGgc > 1:4768176/1‑93 (MQ=255) tGGCCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGgcgc < 2:5714647/93‑1 (MQ=255) | TGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGC > NC_000913/2102448‑2102628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |