Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,211,217 | A→G | L483P (CTG→CCG) | yehU ← | putative 2‑component sensor protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,211,217 | 0 | A | G | 82.1% | 576.9 / 132.6 | 279 | L483P (CTG→CCG) | yehU | putative 2‑component sensor protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (21/29); new base G (111/118); total (132/147) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.38e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.95e-01 |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
CCGGTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGC > NC_000913/2211125‑2211308 | gTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGtt < 2:5884954/93‑1 (MQ=255) ttGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTtg > 1:3744976/1‑93 (MQ=255) aTACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGa < 2:2694987/93‑1 (MQ=255) aTACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGa < 2:4154059/93‑1 (MQ=255) tACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGAt > 1:361809/1‑93 (MQ=255) aaCCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTcc > 2:1527984/1‑93 (MQ=255) ccGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCa > 1:6041693/1‑93 (MQ=255) ccGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCa > 2:6868963/1‑93 (MQ=255) cGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCAt > 2:6326836/1‑93 (MQ=255) cGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCAt < 1:6247507/93‑1 (MQ=255) gCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGGGCTGATTGCCCCTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGt > 1:3333416/1‑93 (MQ=255) gCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGt < 2:2746985/93‑1 (MQ=255) gCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGt < 2:6844732/93‑1 (MQ=255) gCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGt < 2:1191439/93‑1 (MQ=255) gCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGt < 2:2359339/93‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCGAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTa > 2:4788752/1‑93 (MQ=255) ttGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTa > 1:6587040/1‑93 (MQ=255) ttGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTa < 2:5727827/93‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTa > 1:339788/1‑93 (MQ=255) gTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAAt < 1:930226/93‑1 (MQ=255) tCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATg < 2:2541040/93‑1 (MQ=255) cTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATgg < 2:3939946/93‑1 (MQ=255) cTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATgg < 2:6523184/93‑1 (MQ=255) cTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATgg < 1:7079780/93‑1 (MQ=255) cTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATgg > 2:898435/1‑93 (MQ=255) cTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATgg < 1:6799942/93‑1 (MQ=255) gATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGtt > 2:4636590/1‑93 (MQ=255) gATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGtt > 2:1943831/1‑93 (MQ=255) ntctcCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGtnt > 2:6467272/2‑93 (MQ=255) aTCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGttt > 2:5515449/1‑93 (MQ=255) tctcCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGtttt < 1:5420260/93‑1 (MQ=255) tctcCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTC‑GGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTc < 1:6145711/93‑1 (MQ=255) cAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCAc < 2:2176396/93‑1 (MQ=255) aGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACt > 2:2602106/1‑93 (MQ=255) gCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTa > 2:7157648/1‑93 (MQ=255) gCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTa > 1:1208307/1‑93 (MQ=255) cATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTAt > 1:5232932/1‑93 (MQ=255) aTCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATc > 1:1491956/1‑93 (MQ=255) aTCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATc < 1:4548487/93‑1 (MQ=255) tCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCg > 1:3010138/1‑93 (MQ=255) aaTGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGtt < 2:1839861/93‑1 (MQ=255) tGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGc < 2:7455640/93‑1 (MQ=255) gTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCa < 2:1313593/93‑1 (MQ=255) ttGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAg > 1:3488677/1‑93 (MQ=255) ttGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAg < 2:3532238/93‑1 (MQ=255) ttGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAg < 2:4889102/93‑1 (MQ=255) cccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTa < 1:5182945/93‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTaa < 2:5997308/93‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTaa > 2:789683/1‑93 (MQ=255) ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTaa < 2:4057412/93‑1 (MQ=255) cTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTaaa < 1:6740219/93‑1 (MQ=255) cTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTaaa < 2:6618011/93‑1 (MQ=255) cTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTaaa > 1:167359/1‑93 (MQ=255) tCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAAc < 2:2940665/93‑1 (MQ=255) tCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAAc > 1:4928961/1‑93 (MQ=255) tCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAAc < 1:1994941/93‑1 (MQ=255) tCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAAc < 1:1577276/93‑1 (MQ=255) aCGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAAcgc < 1:1458354/93‑1 (MQ=255) aCGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAAcgc < 1:4743540/93‑1 (MQ=255) cGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAAcgcg < 1:3123472/93‑1 (MQ=255) gTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCgg < 1:4050095/93‑1 (MQ=255) gTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCgg > 2:6974824/1‑93 (MQ=255) gggCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCa > 1:133887/1‑93 (MQ=255) ggCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCaa < 2:3466570/93‑1 (MQ=255) ggCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCaa > 1:5302112/1‑93 (MQ=255) gcgcTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAAt < 1:5837944/93‑1 (MQ=255) gcgcTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAAt < 1:2901719/93‑1 (MQ=255) gcTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATtg < 2:2076661/93‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATtgc < 1:4663289/93‑1 (MQ=255) cTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATtgc > 1:4817369/1‑93 (MQ=255) tGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATtgct > 1:3449883/1‑93 (MQ=255) tGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATtgct < 1:1126402/93‑1 (MQ=255) gATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATtgctg > 2:5405593/1‑93 (MQ=255) ttGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTgctgct > 2:6252530/1‑93 (MQ=255) ttGCCACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTgctgct < 1:178076/93‑1 (MQ=255) gCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTgg > 1:5940274/1‑93 (MQ=255) ccACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTggg > 2:5843677/1‑93 (MQ=255) cACTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGa < 2:3106131/93‑1 (MQ=255) cACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGa < 2:2854981/93‑1 (MQ=255) aCTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGAt < 2:5171256/93‑1 (MQ=255) aCTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGAt < 1:3832555/93‑1 (MQ=255) cTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATa > 1:4367654/1‑93 (MQ=255) cTCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATa > 2:6799990/1‑93 (MQ=255) tCGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATaa < 2:2260810/93‑1 (MQ=255) tCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATaa < 2:5332670/93‑1 (MQ=255) cGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAAt < 1:7376792/93‑1 (MQ=255) cGCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAAt < 1:6897705/93‑1 (MQ=255) gCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAAtt < 2:3276107/93‑1 (MQ=255) gCCCTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAAtt < 1:4140103/93‑1 (MQ=255) ccTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCt < 1:800398/93‑1 (MQ=255) cTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCtt > 2:5933457/1‑93 (MQ=255) cTGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCtt < 1:1400379/93‑1 (MQ=255) tGTATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTg > 2:6162512/1‑93 (MQ=255) tATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCg < 2:1665327/93‑1 (MQ=255) tATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCg < 2:4363676/93‑1 (MQ=255) tATCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCg < 2:3755821/93‑1 (MQ=255) tCCAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGa < 2:2319216/93‑1 (MQ=255) ccAGCGGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGaa < 2:4409212/93‑1 (MQ=255) cagcggTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAAt < 1:2441869/93‑1 (MQ=255) cagTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGc < 1:5531258/93‑1 (MQ=255) | CCGGTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGC > NC_000913/2211125‑2211308 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |