| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,330,581 | T→C | intergenic (‑2764/+1775) | b2226 ← / ← b2229 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,330,581 | 0 | T | C | 83.7% | 538.7 / 104.8 | 247 | intergenic (‑2764/+1775) | b2226/b2229 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (21/19); new base C (94/112); total (116/131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
TTAACCCAGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTCCAGCGCGGC > NC_000913/2330490‑2330670 | aaCCCAGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGAc < 1:2498478/93‑1 (MQ=255) ccAGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGt > 2:3957504/1‑93 (MQ=255) cAGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTa < 1:2987075/93‑1 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAg > 2:1847964/1‑93 (MQ=255) aGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAg > 1:7394939/1‑93 (MQ=255) gCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGATGGTAGc < 2:4721086/93‑1 (MQ=255) gCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGc > 2:1145083/1‑93 (MQ=255) gagaATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGctc < 1:6744248/93‑1 (MQ=255) gagaATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGctc > 2:4795726/1‑93 (MQ=255) gagaATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGctc > 1:284986/1‑93 (MQ=255) gaATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCtctc > 2:6743129/1‑93 (MQ=255) gaATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCtctc > 1:651666/1‑93 (MQ=255) gaATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCtctc > 2:572301/1‑93 (MQ=255) gaATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCtctc > 2:5779832/1‑93 (MQ=255) aaTTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTcc > 2:6480104/1‑93 (MQ=255) aTTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCg > 1:548373/1‑93 (MQ=255) aaGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTa > 1:4054641/1‑93 (MQ=255) aGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTAt < 2:850724/93‑1 (MQ=255) aGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTAt < 2:6062330/93‑1 (MQ=255) aGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTAt > 2:5988799/1‑93 (MQ=255) aGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTAt > 2:5396493/1‑93 (MQ=255) gCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATg < 1:635868/93‑1 (MQ=255) cGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGc > 1:1016371/1‑93 (MQ=255) cGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGc > 2:5243750/1‑93 (MQ=255) gTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCt < 1:2900607/93‑1 (MQ=255) tCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑c > 1:3953909/1‑93 (MQ=255) tCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑c < 2:6326475/93‑1 (MQ=255) ttATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTg > 2:804434/1‑93 (MQ=255) aTCGCGTAATGTCAGATTTTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCg < 1:1996040/93‑1 (MQ=255) aTCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCg > 2:4288449/1‑93 (MQ=255) gcgTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCTGCGGTc > 2:1363331/1‑93 (MQ=255) gcgTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCCGCgggc > 1:244797/1‑91 (MQ=255) gcgTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGACTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTc < 2:5024954/93‑1 (MQ=255) cgTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCt < 1:7072653/93‑1 (MQ=255) cgTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCt < 1:162589/93‑1 (MQ=255) cgTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCt < 2:619168/93‑1 (MQ=255) gTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCTGCGGGCtt > 1:5046537/1‑93 (MQ=255) tAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTc < 2:3555918/93‑1 (MQ=255) tAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTc < 1:7178735/93‑1 (MQ=255) aaTGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCg > 2:2111923/1‑93 (MQ=255) aTGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGGCGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCga < 1:4668598/93‑1 (MQ=255) aTGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCga < 1:4236587/93‑1 (MQ=255) aTGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCga < 2:3447951/93‑1 (MQ=255) gTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACTGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCgaga < 2:1783053/93‑1 (MQ=255) gTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCgaga < 1:2065504/93‑1 (MQ=255) gTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCgaga > 2:3815302/1‑93 (MQ=255) aGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCCGCGGGCTTCGAGgcgc > 1:4407683/1‑93 (MQ=255) ttGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAAc < 1:2813011/93‑1 (MQ=255) ttGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAAc < 1:4293409/93‑1 (MQ=255) gTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCa < 1:902431/93‑1 (MQ=255) tAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCAt > 2:2894881/1‑93 (MQ=255) tAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGCGCGGGCTTCGAGACGCAACCAt > 2:2763014/1‑93 (MQ=255) tAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCAATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCAt < 1:4489014/93‑1 (MQ=255) gTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTc > 2:2932748/1‑93 (MQ=255) gTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTc < 2:3654416/93‑1 (MQ=255) gTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTc < 2:3039771/93‑1 (MQ=255) ttGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGTT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCa < 1:1824730/93‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCAt < 1:7318912/93‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCC‑GACGGTAACTCTCCGCTATGGCTCCGGGCGGCTTTCGGGACGCAACCATTctaa > 2:3254405/1‑90 (MQ=255) ccAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATAc > 2:2703527/1‑93 (MQ=255) aGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCTGCGGGCTTCGAGACGCCACCATTCATACGt > 1:3703171/1‑93 (MQ=255) ggTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAAACCTTCATACGTa > 2:7414239/1‑93 (MQ=255) ggTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTa > 2:2288019/1‑93 (MQ=255) ggTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCTGCGGGCTTCGAGACGCGACCATTCATACGTa > 1:255450/1‑93 (MQ=255) gTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCCGCGGGCTTCGCGACGCAACCATTCATACGTaa > 1:4005084/1‑93 (MQ=255) tttAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAAc < 1:1332341/93‑1 (MQ=255) tttAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAAc < 2:4613103/93‑1 (MQ=255) caaaaTTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGaa < 1:6263375/91‑1 (MQ=255) gAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAAc < 1:2750342/93‑1 (MQ=255) aaaTTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAAcc < 2:1115112/93‑1 (MQ=255) aTTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTg < 1:3434457/93‑1 (MQ=255) aTTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTg < 1:2241679/93‑1 (MQ=255) ttGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGt < 1:3569452/93‑1 (MQ=255) ttGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGt < 2:4638522/93‑1 (MQ=255) ttGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGGCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGt > 2:7185810/1‑93 (MQ=255) ttGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGGGCGGGCTTCCAGACGCAAACATTCATACGTAAAAAGAACCTGt > 2:3000109/1‑93 (MQ=255) tGACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCTGCGGGCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCCGtt > 1:5409376/1‑93 (MQ=255) gACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGttt < 1:3334095/93‑1 (MQ=255) gACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGttt < 1:4982107/93‑1 (MQ=255) gACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCTGCGGTCTTCGGGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAAACCGttt > 1:5993557/1‑93 (MQ=255) gACGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCCGCGGTCTTCTAGACGCAACCCATCATACCTAACAGGAAACTGttt > 1:2114527/1‑93 (MQ=255) aCGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGtttt < 1:5767063/93‑1 (MQ=255) cGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTg < 2:4223435/93‑1 (MQ=255) cGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTg > 2:516505/1‑93 (MQ=255) cGGTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCCGCGGCCTTCGGGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCCGttttt > 1:120843/1‑92 (MQ=255) ggTAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGGCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAAAAGGAACCTGttttta > 2:6885332/1‑91 (MQ=255) gTAAAGGATTTGCCTCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGaa < 2:1925628/93‑1 (MQ=255) tAAAGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGGCTTCGAGGCGCAACCATTCCTACGTAACAGGGACCTGTTTTTAAg > 1:6528905/1‑93 (MQ=255) aGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGAtt < 1:1039101/93‑1 (MQ=255) aGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGAtt > 2:1258922/1‑93 (MQ=255) aGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGAtt < 2:1995848/93‑1 (MQ=255) aGGATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCCGCGGGCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTTAAGAtt > 1:3121787/1‑93 (MQ=255) ggATTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTc > 2:4446160/1‑93 (MQ=255) aTTTGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTCCa < 1:5633845/93‑1 (MQ=255) tttGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTCCAg > 2:6297304/1‑93 (MQ=255) tttGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CCTGCGGGCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAAACTGTTTTTAAGATTTCAg > 1:665866/1‑93 (MQ=255) tGCCGCCCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTCCAgcg < 2:3723797/93‑1 (MQ=255) gccgccCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTCCAgcgc < 2:4389294/93‑1 (MQ=255) gccTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTCCAGCGCGGc < 1:3409005/93‑1 (MQ=255) gccCGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTCCAGCGCGGc > 2:4920967/1‑93 (MQ=255) | TTAACCCAGCGAGAATTAAGCCGTCTTTATCGCGTAATGTCAGATTGTAGTTGCCAGGTTTAGCGAAATTGACGGTAAAGGATTTGCCGCCTGACGGTAGCTCTCCGCTATGGCT‑CGTGCGGTCTTCGAGACGCAACCATTCATACGTAACAGGAACCTGTTTTGAAGATTCCAGCGCGGC > NC_000913/2330490‑2330670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |