| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,686,423 | T→C | E134G (GAG→GGG) | yfhA ← | putative 2‑component transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,686,423 | 0 | T | C | 86.7% | 651.1 / 89.7 | 270 | E134G (GAG→GGG) | yfhA | putative 2‑component transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/20); new base C (111/123); total (127/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
ACCGTTAATCAAAACGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCTGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGCTTGGTGA > NC_000913/2686332‑2686513 | aCCGTTAATCAAAACGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTc < 2:2220671/93‑1 (MQ=255) ttAATCAAAACGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCgcgc > 1:6585996/1‑93 (MQ=255) aaTCAAAACGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCa > 2:1702933/1‑93 (MQ=255) aTCAAAACGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAg < 2:4278959/93‑1 (MQ=255) tCAAAACGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGc > 2:4393978/1‑93 (MQ=255) cAAAACGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCg > 2:5949862/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGt > 2:3286921/1‑93 (MQ=255) aaaCGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGtt > 2:5406384/1‑93 (MQ=255) aaCGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTc < 1:3484629/93‑1 (MQ=255) aaCGCTGACGTCTGATTCCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAGACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTc < 1:7416319/93‑1 (MQ=255) cGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCAt < 1:1013813/93‑1 (MQ=255) cGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCAt > 1:2168583/1‑93 (MQ=255) cTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCg > 1:4302600/1‑93 (MQ=255) cTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCg < 1:5678871/93‑1 (MQ=255) gACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGt < 2:3756194/93‑1 (MQ=255) aCGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtg < 1:7307717/93‑1 (MQ=255) aCGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtg > 1:2599526/1‑93 (MQ=255) gTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtggc > 2:456808/1‑93 (MQ=255) gTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtggc < 1:3993943/93‑1 (MQ=255) tCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtggct > 2:4873783/1‑93 (MQ=255) tCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtggct < 2:2994155/93‑1 (MQ=255) cTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtggctg > 2:333951/1‑93 (MQ=255) tGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtggctgg < 1:4216366/93‑1 (MQ=255) gATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGtggctggc < 1:5361875/93‑1 (MQ=255) aTTGCGCCACCAGACGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGgcg > 1:4461915/1‑93 (MQ=255) ttGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGgcgc > 1:3585081/1‑93 (MQ=255) gcgcCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCgg > 1:6853634/1‑93 (MQ=255) gcgcCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCgg > 1:605411/1‑93 (MQ=255) ccaccaGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGAtt > 1:4414506/1‑93 (MQ=255) ccaccaGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGAtt > 2:829988/1‑93 (MQ=255) caccaGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTg < 2:6872467/93‑1 (MQ=255) ccaGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCt < 2:1386374/93‑1 (MQ=255) caGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTc < 2:5563447/93‑1 (MQ=255) caGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTc > 2:5201469/1‑93 (MQ=255) caGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTc < 2:384116/93‑1 (MQ=255) aGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTcc < 2:2797944/93‑1 (MQ=255) aGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTcc > 2:2144920/1‑93 (MQ=255) aGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTcc < 2:1882982/93‑1 (MQ=255) aGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTcc < 2:4743461/93‑1 (MQ=255) gCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCa > 1:4851176/1‑93 (MQ=255) gCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCa > 1:4079153/1‑93 (MQ=255) ccGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAg > 2:1227371/1‑93 (MQ=255) ccGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAg < 2:7258358/93‑1 (MQ=255) gcgcCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAgcg < 1:2950338/93‑1 (MQ=255) cgcCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAgcgc < 2:550978/93‑1 (MQ=255) gcCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCa > 1:6210044/1‑93 (MQ=255) gcCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCa > 1:170749/1‑93 (MQ=255) ccTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCAt < 2:66515/93‑1 (MQ=255) cTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATc > 1:1345310/1‑93 (MQ=255) tGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCg > 2:4242486/1‑93 (MQ=255) tGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCg > 1:1671058/1‑93 (MQ=255) ttCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTc > 2:2576345/1‑93 (MQ=255) tCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCa > 2:3124753/1‑93 (MQ=255) aGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAAtt < 1:471746/93‑1 (MQ=255) aGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAAtt < 2:892439/93‑1 (MQ=255) aGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAAtt > 1:6085282/1‑93 (MQ=255) cAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGc > 1:5891430/1‑93 (MQ=255) aaCGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGccc > 2:4405884/1‑92 (MQ=255) cGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGa < 2:2477646/93‑1 (MQ=255) gcagcaTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGat > 2:2675065/1‑93 (MQ=255) cagcaTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGata < 2:3220439/93‑1 (MQ=255) cagcaTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGata < 1:1842842/93‑1 (MQ=255) cagcaTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGata < 2:647780/93‑1 (MQ=255) agcaTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGatat < 2:5123290/93‑1 (MQ=255) caTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAg < 1:6655292/93‑1 (MQ=255) caTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAg < 1:3312304/93‑1 (MQ=255) aTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAgc > 2:4134986/1‑93 (MQ=255) aTCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAgc < 2:1033836/93‑1 (MQ=255) tCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAgcg > 2:6628548/1‑93 (MQ=255) tCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAgcg > 1:5604687/1‑93 (MQ=255) tCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAgcg > 2:736570/1‑93 (MQ=255) gCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGt > 2:5719937/1‑93 (MQ=255) cGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTc < 2:6248093/93‑1 (MQ=255) cGGGCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTc > 1:2106641/1‑93 (MQ=255) gggCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCt > 1:3842145/1‑93 (MQ=255) ggCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCtt < 1:1069155/93‑1 (MQ=255) ggCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCtt < 1:1943795/93‑1 (MQ=255) ggCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCtt > 1:3637244/1‑93 (MQ=255) gCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCttt < 1:2315585/93‑1 (MQ=255) gCTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCttt < 1:7053493/93‑1 (MQ=255) cTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTg < 2:4013559/93‑1 (MQ=255) cTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTg > 2:4973738/1‑93 (MQ=255) cTGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTg < 2:2378292/93‑1 (MQ=255) tGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGTCCGATATAGCGCGTCTTTGt > 1:4632146/1‑93 (MQ=255) tGCGGGTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGt > 1:4763697/1‑93 (MQ=255) gggTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGa < 1:2622934/93‑1 (MQ=255) gggTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGa < 2:7137595/93‑1 (MQ=255) gggTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGa > 1:554496/1‑93 (MQ=255) ggTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGAc < 2:4474481/93‑1 (MQ=255) ggTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGAc < 1:3199652/93‑1 (MQ=255) gTGAGAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACa < 2:5296654/93‑1 (MQ=255) gTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACa < 1:6706568/93‑1 (MQ=255) gTGACAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACa < 2:235971/93‑1 (MQ=255) aCAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGc > 2:393659/1‑93 (MQ=255) cAATTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGCt > 2:1523099/1‑93 (MQ=255) aaTTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGCtt < 2:6779273/93‑1 (MQ=255) aaTTGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGCtt > 1:849115/1‑93 (MQ=255) aTTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCTGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGCTTg < 1:5125886/93‑1 (MQ=255) ttGCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGCTTgg > 2:1142037/1‑93 (MQ=255) gCCCCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCCGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGCTTGGTg < 2:7029293/93‑1 (MQ=255) | ACCGTTAATCAAAACGCTGACGTCTGATTGCGCCACCAGCCGCGCCTGTTCCAGCAAACGCAGCATCAGCGGGCTGCGGGTGACAATTGCCTCGCGCCAGCGTTCATCGGTGGCTGGCGCGGATTGCTCCAGCGCATCGTCAATTGCCTGATATAGCGCGTCTTTGTCGACAGGCTTGGTGA > NC_000913/2686332‑2686513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |