| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,694,131 | T→C | L58P (CTG→CCG) | yfhD → | putative periplasmic binding transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,694,131 | 0 | T | C | 81.3% | 534.9 / 130.6 | 262 | L58P (CTG→CCG) | yfhD | putative periplasmic binding transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (20/29); new base C (103/110); total (123/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
GTTTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTT > NC_000913/2694039‑2694220 | ttGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACccgc < 2:2784571/93‑1 (MQ=255) ttGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACccgc < 2:7530282/93‑1 (MQ=255) gCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACccgctg < 2:5882189/93‑1 (MQ=255) cGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggc < 1:744328/93‑1 (MQ=255) aTTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcgg < 1:4956449/93‑1 (MQ=255) aTTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcgg < 1:7047766/93‑1 (MQ=255) ttACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTggcggc > 1:2856002/1‑93 (MQ=255) ttACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcggc > 1:6076380/1‑93 (MQ=255) ttACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcggc > 2:5754826/1‑93 (MQ=255) ttACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTggcggc > 2:1069128/1‑93 (MQ=255) tACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCa > 1:2499560/1‑93 (MQ=255) tACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCa > 2:3847056/1‑93 (MQ=255) cTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCGGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGa < 1:5652880/93‑1 (MQ=255) cTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGa < 1:2993916/93‑1 (MQ=255) tCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGAc < 2:6491771/93‑1 (MQ=255) tAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCt > 2:2858064/1‑93 (MQ=255) aaaaCTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCta < 1:3782523/93‑1 (MQ=255) aaaaCTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCta < 1:5979316/93‑1 (MQ=255) aCTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATaa > 2:5141091/1‑93 (MQ=255) tGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACa < 1:7032062/93‑1 (MQ=255) gAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAg > 2:3648399/1‑93 (MQ=255) aaaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGt < 2:4646305/93‑1 (MQ=255) aaaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGt < 1:3722093/93‑1 (MQ=255) aaaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGt < 1:6454573/93‑1 (MQ=255) aaaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGt > 1:630605/1‑93 (MQ=255) aaGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTAACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTg > 2:4897954/1‑93 (MQ=255) aGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGa < 2:666090/93‑1 (MQ=255) aGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGa > 1:4342818/1‑93 (MQ=255) aGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGa < 2:6895952/93‑1 (MQ=255) aGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGa < 1:2066069/93‑1 (MQ=255) gTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAg < 2:4297766/93‑1 (MQ=255) gTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTTGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAg < 2:6421703/93‑1 (MQ=255) tGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCGGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGc < 1:3436923/93‑1 (MQ=255) gACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCg < 1:4274575/93‑1 (MQ=255) aCCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCgg > 2:3291973/1‑93 (MQ=255) aCCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCgg > 2:2158319/1‑93 (MQ=255) cGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGt < 2:1920565/93‑1 (MQ=255) gCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaa < 2:2363696/93‑1 (MQ=255) cGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaaa < 1:1519411/93‑1 (MQ=255) ggCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaaaa > 2:7421044/1‑93 (MQ=255) gCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaaaaa < 1:5434813/93‑1 (MQ=255) gCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTaaaaaa < 1:184372/93‑1 (MQ=255) aGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAAtt > 1:777422/1‑93 (MQ=255) gAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTa > 2:4846679/1‑93 (MQ=255) aaTATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTAt < 2:6692850/93‑1 (MQ=255) atatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATc < 2:3160138/93‑1 (MQ=255) atatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATc < 2:1028845/93‑1 (MQ=255) atatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAACATTATc < 2:4724778/93‑1 (MQ=255) tatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCa < 1:6095735/93‑1 (MQ=255) tatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCa > 1:3509880/1‑93 (MQ=255) tatCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCa < 2:4032473/93‑1 (MQ=255) atCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAg < 2:7001826/93‑1 (MQ=255) tCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGc > 2:6019148/1‑93 (MQ=255) tCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGc < 1:3410336/93‑1 (MQ=255) tCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGc < 1:3244995/93‑1 (MQ=255) cagccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGcc < 2:3369773/93‑1 (MQ=255) agccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCt < 2:4130632/93‑1 (MQ=255) agccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCt < 1:305243/93‑1 (MQ=255) gccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTg > 1:1113691/1‑93 (MQ=255) gccagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTg > 1:6168575/1‑93 (MQ=255) cagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGc > 2:1697266/1‑93 (MQ=255) cagcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGc > 2:5456639/1‑93 (MQ=255) agcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGcc > 2:6417093/1‑93 (MQ=255) agcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGcc < 2:88333/93‑1 (MQ=255) agcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGcc > 1:574799/1‑93 (MQ=255) agcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGcc > 2:2496684/1‑93 (MQ=255) gcTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGccc < 2:1358218/93‑1 (MQ=255) tGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCccta > 2:6287889/1‑93 (MQ=255) gTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctac > 1:2620630/1‑93 (MQ=255) gTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctac > 1:1198270/1‑93 (MQ=255) tttGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctacc > 2:2617160/1‑93 (MQ=255) ttGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctacct < 1:5397343/93‑1 (MQ=255) tGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCcctaccta < 1:4698822/93‑1 (MQ=255) acgacCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCtatt < 1:2180331/93‑1 (MQ=255) acgacCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCtatt > 2:4697857/1‑93 (MQ=255) cgacCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCtatta < 2:4274883/93‑1 (MQ=255) gacCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCtattat > 2:5311597/1‑93 (MQ=255) acCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTattatt > 1:2272687/1‑93 (MQ=255) acCTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTattatt < 1:6898624/93‑1 (MQ=255) ccTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATTAGCCTGGCCCTACCTATTATTc < 2:3754265/93‑1 (MQ=255) ccTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTc > 2:5960501/1‑93 (MQ=255) cTTGATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTcc < 1:1012878/93‑1 (MQ=255) gATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCgtg < 2:2943918/93‑1 (MQ=255) gATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCgtg < 1:521523/93‑1 (MQ=255) gATAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCgtg > 2:2692137/1‑93 (MQ=255) aTAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGTCCTACCTATTATTCCgtgt > 1:4438754/1‑93 (MQ=255) tAATGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTc > 2:4811218/1‑93 (MQ=255) aTGGTAACGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTcac < 1:4664753/93‑1 (MQ=255) aaCGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCAcaacaa > 1:6710229/1‑93 (MQ=255) aCGCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACaacaac > 2:2420610/1‑93 (MQ=255) gCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTg > 1:4048433/1‑93 (MQ=255) gCCGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTg < 1:2391667/93‑1 (MQ=255) ccGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTgg > 2:2109510/1‑93 (MQ=255) ccGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTgg > 2:790171/1‑93 (MQ=255) ccGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTgg < 2:1615104/93‑1 (MQ=255) cGACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGt < 1:1594744/93‑1 (MQ=255) gACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGtt > 2:449124/1‑93 (MQ=255) gACCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGtt < 2:5030883/93‑1 (MQ=255) aCCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGttt > 1:4551259/1‑93 (MQ=255) aCCCGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGttt > 2:1480282/1‑93 (MQ=255) | GTTTGCCGATTACCTCGGCGTAAAACTGAAAGTGACCGTGCGGCAGAATATCAGCCAGCTGTTTGACGACCTTGATAATGGTAACGCCGACCTGCTGGCGGCAGGACTTGTCTATAACAGTGAGCGGGTAAAAAATTATCAGCCTGGCCCTACCTATTATTCCGTGTCACAACAACTGGTTT > NC_000913/2694039‑2694220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |