| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,773,076 | T→C | intergenic (+34/‑864) | yfjW → / → yfjX | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,773,076 | 0 | T | C | 86.9% | 519.3 / 65.7 | 206 | intergenic (+34/‑864) | yfjW/yfjX | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/10); new base C (129/50); total (146/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TATAAAATTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGT > NC_000913/2772985‑2773167 | ataAAATTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACtat < 1:3984048/93‑1 (MQ=255) ataAAATTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcat > 1:698650/1‑93 (MQ=255) ataAAATGCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcat < 1:3303566/93‑1 (MQ=255) taAAATTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcatt > 2:3649742/1‑93 (MQ=255) taAAATTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcatt < 1:23406/93‑1 (MQ=255) aaaTTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcattta < 1:4386653/93‑1 (MQ=255) aaaTTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcattta < 1:900642/93‑1 (MQ=255) aaaTTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcattta > 2:6932346/1‑93 (MQ=255) attcattcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcatttatt < 1:3200390/93‑1 (MQ=255) attcattcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACcatttatt < 2:3098507/93‑1 (MQ=255) ttcattcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATttatta > 1:546883/1‑93 (MQ=255) tcattcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTaa < 2:5512213/93‑1 (MQ=255) tcattcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTaa < 1:1637066/93‑1 (MQ=255) cattcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTaaa < 1:1538444/93‑1 (MQ=255) attcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTaaaa > 1:2420717/1‑93 (MQ=255) attcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTaaaa > 1:3686740/1‑93 (MQ=255) ttcattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAat < 2:7020927/93‑1 (MQ=255) cattcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAatat > 1:6261526/1‑93 (MQ=255) attcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATc > 1:80091/1‑93 (MQ=255) attcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATc < 2:6784227/93‑1 (MQ=255) attcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATc > 1:636015/1‑93 (MQ=255) attcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATc > 1:4616331/1‑93 (MQ=255) attcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATc > 2:1488918/1‑93 (MQ=255) ttcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATcc > 1:2351114/1‑93 (MQ=255) ttcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATnc > 2:7255195/1‑93 (MQ=255) ttcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATcc > 1:5863646/1‑93 (MQ=255) ttcTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATcc < 1:2764765/93‑1 (MQ=255) cTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTa > 2:4369504/1‑93 (MQ=255) tACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAg > 1:3959607/1‑93 (MQ=255) tttAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTa > 1:2590386/1‑93 (MQ=255) ttAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTaa > 2:5695423/1‑93 (MQ=255) tAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAg < 1:2050180/93‑1 (MQ=255) aGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGcc > 2:1997066/1‑93 (MQ=255) aGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGcc > 1:4875998/1‑93 (MQ=255) gAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCt > 2:2551701/1‑93 (MQ=255) gAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCt < 1:3752381/93‑1 (MQ=255) tgatgTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGtt > 2:2392317/1‑93 (MQ=255) tgatgTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGtt < 2:7528981/93‑1 (MQ=255) tgatgTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGtt < 2:4943997/93‑1 (MQ=255) tcatgTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGtt > 2:2091206/3‑93 (MQ=255) gatgTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGttt > 2:2256669/1‑93 (MQ=255) gatgTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGttt > 2:4200470/1‑93 (MQ=255) atgTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGtttt > 2:1733178/1‑93 (MQ=255) atgTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGtttt > 1:3566470/1‑93 (MQ=255) tgaatgaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTaa > 2:4786344/1‑93 (MQ=255) gaatgaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTaaa < 1:1062763/93‑1 (MQ=255) gaatgaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTaaa < 1:5315584/93‑1 (MQ=255) gaatgaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTaaa > 1:4979331/1‑93 (MQ=255) gaatgaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTaaa > 1:3360973/1‑93 (MQ=255) tgaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCa > 1:6295384/1‑93 (MQ=255) gaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAg > 2:4019841/1‑93 (MQ=255) gaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAg > 2:3690068/1‑93 (MQ=255) gaaAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAg > 2:6104929/1‑93 (MQ=255) aaaaTTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAgg < 1:6805456/93‑1 (MQ=255) aaTTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCt > 1:6876274/1‑93 (MQ=255) aaTTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCt > 1:2392199/1‑93 (MQ=255) tATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAg > 1:564668/1‑93 (MQ=255) aTTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGc < 2:2623089/93‑1 (MQ=255) aTTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGc > 2:5874402/1‑93 (MQ=255) aTTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGc > 2:651188/1‑93 (MQ=255) ttCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCg > 2:5982171/1‑93 (MQ=255) tCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGt > 2:3273914/1‑93 (MQ=255) ttGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGa > 2:550334/1‑93 (MQ=255) ttGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGa < 2:2753855/93‑1 (MQ=255) gTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAg > 1:1210063/1‑93 (MQ=255) aaCGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCg < 1:2853691/93‑1 (MQ=255) aaCGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCg > 2:3826467/1‑93 (MQ=255) aCGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCgg > 2:802854/1‑93 (MQ=255) aCGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCgg < 1:1941612/93‑1 (MQ=255) cGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGa > 2:4594968/1‑93 (MQ=255) cGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGa < 1:5366965/93‑1 (MQ=255) gCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGac > 2:1366623/1‑93 (MQ=255) gCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGac > 2:435313/1‑93 (MQ=255) cATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGaca > 2:7504620/1‑93 (MQ=255) cATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGaca > 1:6710134/1‑93 (MQ=255) cATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGaca > 2:5428882/1‑93 (MQ=255) tttGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACt > 2:7128339/1‑93 (MQ=255) tttGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACt > 1:2196635/1‑93 (MQ=255) tttGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACt > 2:5776706/1‑93 (MQ=255) tttGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACt < 1:3158077/93‑1 (MQ=255) cTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATAc > 1:5497144/1‑93 (MQ=255) tCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATAcc > 1:3225691/1‑93 (MQ=255) ccAATTGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCt > 1:6203390/1‑93 (MQ=255) ttGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCtt > 1:6518258/1‑93 (MQ=255) ttGGAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCtt > 2:1662379/1‑93 (MQ=255) ggAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTa > 1:7359494/1‑93 (MQ=255) ggAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTa > 1:6479383/1‑93 (MQ=255) gAGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTaa > 2:583682/1‑93 (MQ=255) aGCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTaaa > 2:6537351/1‑93 (MQ=255) gCCTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAg > 1:515291/1‑93 (MQ=255) ccTTTTTATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGt < 2:6686983/93‑1 (MQ=255) tttttATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTgg < 2:5111120/93‑1 (MQ=255) tttATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCg < 1:6916929/93‑1 (MQ=255) tttATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCg > 2:3429827/1‑93 (MQ=255) nttATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGNg > 2:5728854/2‑93 (MQ=255) ttATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGt > 1:3853288/1‑93 (MQ=255) ttATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGt < 1:51990/93‑1 (MQ=255) tATGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGtt > 2:3143488/1‑93 (MQ=255) tGACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGtttt < 2:6307756/93‑1 (MQ=255) gACCATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGttttt > 1:1409844/1‑93 (MQ=255) | TATAAAATTCATTCATTCTTACTTTAAGAATGATGTGAATGAAAATTTATTCTTGTAACGCATTTGGCTCCAATTGGAGCCTTTTTATGACTATTTATTAAAATATCCTAAGTTAAGCCTGTTTTTAAAGCAGGCTTGAGCGTGAAGCGGACACTCATACCTGCTTTAAAGTGGCGTTTTTGT > NC_000913/2772985‑2773167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |