Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,980,709 | A→G | M191T (ATG→ACG) | kduD ← | 2‑deoxy‑D‑gluconate 3‑dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,980,709 | 0 | A | G | 85.5% | 668.5 / 102.5 | 283 | M191T (ATG→ACG) | kduD | 2‑deoxy‑D‑gluconate 3‑dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (20/21); new base G (120/122); total (140/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.09e-03 |
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
GGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACGCCGCTTTTTGA > NC_000913/2980619‑2980800 | gCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCgtgt > 2:7128832/1‑93 (MQ=255) gCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGt < 2:6191771/93‑1 (MQ=255) cAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTa > 1:601661/1‑93 (MQ=255) gTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAAc > 1:2976037/1‑93 (MQ=255) tCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAAcc < 1:5378848/93‑1 (MQ=255) ccccAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAAccc < 1:866400/93‑1 (MQ=255) cccAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCg < 2:3774531/93‑1 (MQ=255) cccAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCg < 1:7528770/93‑1 (MQ=255) cAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCggg > 2:1292146/1‑93 (MQ=255) cAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCggg > 1:6931664/1‑93 (MQ=255) cAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCggg < 1:5808500/93‑1 (MQ=255) cAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCggg < 2:1170911/93‑1 (MQ=255) cAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCggg < 2:2458844/93‑1 (MQ=255) cAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCggg < 2:4713142/93‑1 (MQ=255) aaCGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCgggg > 1:7071447/1‑93 (MQ=255) aaCGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCgggg < 2:688273/93‑1 (MQ=255) aCGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGc > 1:1014795/1‑93 (MQ=255) aCGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGc > 1:4515612/1‑93 (MQ=255) gACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTa > 1:4688756/1‑93 (MQ=255) aCCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTAt < 2:2483107/93‑1 (MQ=255) ccAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATc < 1:982415/93‑1 (MQ=255) ccAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATc < 2:77879/93‑1 (MQ=255) ccAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATc > 1:1686931/1‑93 (MQ=255) ccAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATc > 2:4348524/1‑93 (MQ=255) aGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGc > 1:1273666/1‑93 (MQ=255) aGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGc < 2:541679/93‑1 (MQ=255) aGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGc > 1:7363910/1‑93 (MQ=255) cTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcat < 2:2754791/93‑1 (MQ=255) cTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcat > 2:3906000/1‑93 (MQ=255) tGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcatt > 2:4494697/1‑93 (MQ=255) tGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcatt < 2:2886953/93‑1 (MQ=255) tGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcatt > 2:3585713/1‑93 (MQ=255) tGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcann > 2:1395654/1‑91 (MQ=255) ggAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcatta > 1:4104688/1‑93 (MQ=255) gAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcattaa > 2:1827663/1‑93 (MQ=255) aaTGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcattaac < 1:2454613/93‑1 (MQ=255) aaTGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcattaac < 1:3192827/93‑1 (MQ=255) aaTGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGcattaac < 1:1904757/93‑1 (MQ=255) tGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcattaacat < 2:3668842/93‑1 (MQ=255) gCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcattaacatt < 1:5003052/93‑1 (MQ=255) cGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGcattaacatta > 2:43376/1‑93 (MQ=255) cGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAAtgt > 2:3351568/1‑93 (MQ=255) cGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAAtgt < 2:1759319/93‑1 (MQ=255) gagaATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAAtgtt < 2:3199733/93‑1 (MQ=255) gagaATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAAtgtt > 1:7023136/1‑93 (MQ=255) gaATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAAtgttgt < 1:2273269/93‑1 (MQ=255) gaATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAAtgttgt < 1:1088919/93‑1 (MQ=255) aTTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTgtgt < 2:6552647/93‑1 (MQ=255) tttCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGtt < 1:6807952/93‑1 (MQ=255) tttCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGtt < 2:6712880/93‑1 (MQ=255) tttCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGtt < 1:6339532/93‑1 (MQ=255) tCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTa > 1:5091405/1‑93 (MQ=255) tCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTa < 2:4591859/93‑1 (MQ=255) cgcTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGccc > 1:2809551/1‑93 (MQ=255) gcTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCa > 1:5248336/1‑93 (MQ=255) gcTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCa > 2:21537/1‑93 (MQ=255) cTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCAt > 1:3875411/1‑93 (MQ=255) aCGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCAttc > 1:2163644/1‑93 (MQ=255) aCGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTAGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTTTTTTTAAGCCAttc > 1:6175786/1‑93 (MQ=255) cGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCAttcg > 2:2716693/1‑93 (MQ=255) gttgttCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCAttcgt < 2:5707191/93‑1 (MQ=255) ttgttCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCAttcgtt < 1:4276531/93‑1 (MQ=255) ttgttCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCAttcgtt < 2:48692/93‑1 (MQ=255) tgttCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCAttcgttc > 1:4461200/1‑93 (MQ=255) gttCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCAttcgttcg > 1:379881/1‑93 (MQ=255) aTCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCAt > 1:2241231/1‑93 (MQ=255) cTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCa > 1:2065573/1‑93 (MQ=255) tGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCTTTCTTTGCCCTTCaa > 1:1462936/1‑93 (MQ=255) cccGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATc < 1:6624203/93‑1 (MQ=255) cccGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATc < 1:3432669/93‑1 (MQ=255) cccGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATc < 2:723564/93‑1 (MQ=255) ccGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATcg > 1:7411128/1‑93 (MQ=255) cGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATcgc < 2:4046336/93‑1 (MQ=255) cGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATcgc < 1:1985092/93‑1 (MQ=255) cGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATcgc < 1:4027375/93‑1 (MQ=255) gTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTATCATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATcgcg < 2:5956405/93‑1 (MQ=255) gTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATcgcg > 1:4881627/1‑93 (MQ=255) gTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATcgcg > 2:3822567/1‑93 (MQ=255) gTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATcgcg > 2:5195184/1‑93 (MQ=255) tAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGt < 1:3025819/93‑1 (MQ=255) gttgttGAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTca < 1:1146797/93‑1 (MQ=255) ttgttgAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTcac < 1:5857968/93‑1 (MQ=255) ttgttgAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTcac > 1:5156778/1‑93 (MQ=255) ttgttgAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTcac > 1:5971981/1‑93 (MQ=255) gttgAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCacac > 1:6374980/1‑93 (MQ=255) ttgAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACAcc < 1:1849569/93‑1 (MQ=255) ttgAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACAcc > 1:4351971/1‑93 (MQ=255) gAGTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCa < 1:54558/93‑1 (MQ=255) gTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATc < 2:232894/93‑1 (MQ=255) gTATTGTTGGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATc > 2:6169464/1‑93 (MQ=255) tATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCa < 1:3582647/93‑1 (MQ=255) tgttgGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCAcgc < 2:5482077/93‑1 (MQ=255) tgttgGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCAcgc < 2:4225411/93‑1 (MQ=255) tgttgGTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCAcgc > 2:7106095/1‑93 (MQ=255) gttgGTCACCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCAcgcc < 1:5917465/93‑1 (MQ=255) ggTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACGCCGCt > 1:7384020/1‑93 (MQ=255) gTCGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACGCCGCtt > 1:2506668/1‑93 (MQ=255) cGCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACGCCGCtttt < 2:5018679/93‑1 (MQ=255) gCCGTGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACGCCGCttttt > 2:6072473/1‑93 (MQ=255) cATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACGCCGCTTTTTGa < 1:2921870/93‑1 (MQ=255) | GGCAGTCCCCAACGACCAGCTGGAATGCGGTCGAGAATTTCCGCGCTACGTTGTTCATCTGCCCGTAGTTGTTGAGTATTGTTGGTCGCCATGTAACCCGGGGCTATCGCATTAACATTAATGTTGTGTTTAGCCCATTCGTTCGCCATCAATCGCGTCACACCCATCACGCCGCTTTTTGA > NC_000913/2980619‑2980800 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |