| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,142,620 | T→C | Q179R (CAG→CGG) | hybA ← | hydrogenase‑2 small subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,142,620 | 0 | T | C | 83.0% | 615.7 / 127.9 | 283 | Q179R (CAG→CGG) | hybA | hydrogenase‑2 small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/19); new base C (127/108); total (156/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
CTCTTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTAAC > NC_000913/3142529‑3142710 | ctctTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTg < 1:1261689/93‑1 (MQ=255) tctTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCgg < 1:3579417/93‑1 (MQ=255) ctTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGt > 2:62894/1‑93 (MQ=255) ttCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGtt > 2:3929469/1‑93 (MQ=255) ttCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGtt < 2:1713038/93‑1 (MQ=255) cgcgTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGcac > 2:2128847/1‑93 (MQ=255) cgcgTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGcac < 1:420522/93‑1 (MQ=255) cgcgTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGcac < 1:2145609/93‑1 (MQ=255) gcgTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGcaca > 1:5848857/1‑93 (MQ=255) cgTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAg < 2:1815090/93‑1 (MQ=255) gAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCa > 1:6934173/1‑93 (MQ=255) gAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCa > 2:2094929/1‑93 (MQ=255) gAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCa > 1:2008118/1‑93 (MQ=255) aaaaTCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCAc < 1:4865512/93‑1 (MQ=255) aaaaTCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGTAc < 1:1734717/93‑1 (MQ=255) aaaaTCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCAc < 2:5459775/93‑1 (MQ=255) aaaaTCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCAc > 2:1397301/1‑93 (MQ=255) aaTCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACtt > 2:7375756/1‑93 (MQ=255) tCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTAt < 1:4506310/93‑1 (MQ=255) tCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTAt < 1:2577093/93‑1 (MQ=255) cACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATg > 1:531768/1‑93 (MQ=255) cACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATg > 1:6547996/1‑93 (MQ=255) aCCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGc < 2:6920128/93‑1 (MQ=255) aCCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGc < 2:2576094/93‑1 (MQ=255) ccGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCa > 2:2250313/1‑93 (MQ=255) cgcgCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAg > 2:7099385/1‑93 (MQ=255) cgcgCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAg < 1:6317678/93‑1 (MQ=255) cccgccGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCa > 1:1063504/1‑93 (MQ=255) cgccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCAcc > 1:5517497/1‑93 (MQ=255) gccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCa > 1:431014/1‑93 (MQ=255) gccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCa > 2:1051876/1‑93 (MQ=255) gccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCa > 1:1192021/1‑93 (MQ=255) ccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCaa < 1:4074224/93‑1 (MQ=255) ccgGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCaa > 1:381983/1‑93 (MQ=255) gggCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAAc > 1:2433457/1‑93 (MQ=255) gCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACgg > 1:1642389/1‑93 (MQ=255) cacaCTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACggg < 2:5482682/93‑1 (MQ=255) acacTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgt > 2:7496518/1‑93 (MQ=255) acTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttg < 1:5637407/93‑1 (MQ=255) cTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttgt < 2:1473449/93‑1 (MQ=255) ttCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGgttgtt > 1:1095607/1‑93 (MQ=255) tCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGttgttg > 2:4519651/1‑93 (MQ=255) tCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGttgttg > 1:5059836/1‑93 (MQ=255) tCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGttgttg < 1:4648587/93‑1 (MQ=255) cTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTtgttgt < 2:4610400/93‑1 (MQ=255) tACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTa < 1:7021802/93‑1 (MQ=255) cGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGt < 2:4326198/93‑1 (MQ=255) gCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTc < 2:6099100/93‑1 (MQ=255) cAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCg > 1:2952972/1‑93 (MQ=255) gCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTa < 1:6087049/93‑1 (MQ=255) cAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACt > 2:5998494/1‑93 (MQ=255) cAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACt > 2:6995984/1‑93 (MQ=255) aGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACtt > 2:3610161/1‑93 (MQ=255) aGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACtt > 1:1490294/1‑93 (MQ=255) ggTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTc < 2:4192361/93‑1 (MQ=255) ggTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTc < 2:911143/93‑1 (MQ=255) tAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCgg < 1:1368222/93‑1 (MQ=255) tAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCgg < 1:7399391/93‑1 (MQ=255) aGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGc > 2:7261556/1‑93 (MQ=255) gACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCa > 2:3800833/1‑93 (MQ=255) gACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCa > 2:6762821/1‑93 (MQ=255) aCCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCAc < 2:4732237/93‑1 (MQ=255) aCCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCAc < 1:2475836/93‑1 (MQ=255) aCCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCAc > 1:6694000/1‑93 (MQ=255) gCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGtt < 1:3942288/93‑1 (MQ=255) ccTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTg > 2:2415308/1‑93 (MQ=255) ccTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTg > 2:349313/1‑93 (MQ=255) ccTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTg > 2:5581735/1‑93 (MQ=255) cTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGt > 2:2920051/1‑93 (MQ=255) cTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGt < 1:7498184/93‑1 (MQ=255) cTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGt > 2:5896871/1‑93 (MQ=255) ttATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTAc > 1:868404/1‑93 (MQ=255) cGAGACGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGAc < 2:3061990/93‑1 (MQ=255) gagaCGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACa < 2:4807899/93‑1 (MQ=255) gagaCGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACa < 1:6605587/93‑1 (MQ=255) gagaCGTTCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACa < 2:5621761/93‑1 (MQ=255) gaCGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAgg > 2:1273405/1‑93 (MQ=255) aCGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGc < 2:327549/93‑1 (MQ=255) ttCCACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGAc > 1:5106259/1‑93 (MQ=255) ccACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCa > 1:3513319/1‑93 (MQ=255) ccACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCa < 1:4274750/93‑1 (MQ=255) ccACACCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCa < 1:6469499/93‑1 (MQ=255) cacaCCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCAt < 2:5839621/93‑1 (MQ=255) cacaCCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCAt > 1:982522/1‑93 (MQ=255) acacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACATGCGACCATg > 2:4901396/1‑93 (MQ=255) acacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATg > 1:3675656/1‑93 (MQ=255) cacCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGc < 1:6010682/93‑1 (MQ=255) cacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGc > 1:716717/1‑93 (MQ=255) cacCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGc < 2:2948207/93‑1 (MQ=255) acCTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCa < 1:235067/93‑1 (MQ=255) ccTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAg > 2:176358/1‑93 (MQ=255) cTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGt > 2:4779337/1‑93 (MQ=255) cTTTCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGt > 1:6496435/1‑93 (MQ=255) tttCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTa > 2:5271996/1‑93 (MQ=255) tttCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTa > 2:6638350/1‑93 (MQ=255) tttCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTa < 2:4124509/93‑1 (MQ=255) tttCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTa > 2:283915/1‑93 (MQ=255) tttCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTa > 2:1180805/1‑93 (MQ=255) tttCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTa > 2:1851480/1‑93 (MQ=255) ttCCGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTaa < 1:3079025/93‑1 (MQ=255) | CTCTTCACGCGTACCGAAAATCACCGCGCCCGCCGGGCACACTTCTACGCAGCCAGGTAGACCGCCTTTATCGAGACGTTCCACACCTTTCTGGTTGCACAGCTCGCACTTATGCAGCGCACCAAACGGGTTGTTGTAGTCGTACTTCGGCACGTTGTACGGACAGGCGACCATGCAGTAAC > NC_000913/3142529‑3142710 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |