| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,278,453 | T→C | L38L (TTG→CTG) | agaW → | PTS system N‑acetylgalactosameine‑specific IIC component 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,278,453 | 0 | T | C | 85.0% | 741.2 / 119.1 | 319 | L38L (TTG→CTG) | agaW | PTS system N‑acetylgalactosameine‑specific IIC component 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/19); new base C (153/118); total (182/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
AGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGG > NC_000913/3278361‑3278544 | cATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTgg > 2:3122927/1‑93 (MQ=255) aTTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGt < 1:4943558/93‑1 (MQ=255) aTTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGt < 1:9244/93‑1 (MQ=255) tttGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTc > 2:2714076/1‑93 (MQ=255) tttGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTc > 1:5435855/1‑93 (MQ=255) tttGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTc > 1:6560871/1‑93 (MQ=255) tttGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTc > 2:1091924/1‑93 (MQ=255) gCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCggg < 2:5242304/93‑1 (MQ=255) tGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTgg > 1:3721799/1‑93 (MQ=255) ggCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTa > 2:1226357/1‑93 (MQ=255) gCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTAc > 2:6799581/1‑93 (MQ=255) cATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACt < 2:3937012/93‑1 (MQ=255) cATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACt < 2:1901941/93‑1 (MQ=255) ttATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTg < 2:5308124/93‑1 (MQ=255) ttATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTg < 1:3308825/93‑1 (MQ=255) tATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTgg < 1:7138253/93‑1 (MQ=255) tATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTgg > 1:7056674/1‑93 (MQ=255) aTCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGc > 1:4589765/1‑93 (MQ=255) ccTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATc > 1:2645214/1‑93 (MQ=255) ccTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATc > 1:6423296/1‑93 (MQ=255) ccTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATc > 1:5374041/1‑93 (MQ=255) cTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCt < 2:1459398/93‑1 (MQ=255) tttATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTg > 1:1065669/1‑93 (MQ=255) tttATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTg > 1:1572008/1‑93 (MQ=255) ttATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGc < 2:7522795/93‑1 (MQ=255) tATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCa > 2:492219/1‑93 (MQ=255) tATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCa < 2:2057416/93‑1 (MQ=255) aTCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCAt > 1:13980/1‑93 (MQ=255) tCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATa > 2:4752110/1‑93 (MQ=255) tCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATa < 1:2739369/93‑1 (MQ=255) tCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCATCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATa < 1:1479368/93‑1 (MQ=255) gCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGaa > 1:1802463/1‑93 (MQ=255) cTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAAtt > 2:2394100/1‑93 (MQ=255) tGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAAttt > 1:4299888/1‑93 (MQ=255) tGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAAttt < 1:3122693/93‑1 (MQ=255) gATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTa > 2:5771633/1‑93 (MQ=255) atatGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTaa > 1:3420154/1‑93 (MQ=255) atatGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTaa > 1:2821380/1‑93 (MQ=255) tatGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAAc > 2:537987/1‑93 (MQ=255) tatGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAAc < 2:4974189/93‑1 (MQ=255) atGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAAcc < 2:2314812/93‑1 (MQ=255) atGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAAcc < 1:6010841/93‑1 (MQ=255) atGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAAcc < 2:5412218/93‑1 (MQ=255) tGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcg < 1:4103666/93‑1 (MQ=255) tGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcg > 2:1774375/1‑93 (MQ=255) tGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcg > 1:3876535/1‑93 (MQ=255) gTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcgg > 1:2486009/1‑93 (MQ=255) tttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcggc < 1:5676583/93‑1 (MQ=255) tttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcggc < 2:709498/93‑1 (MQ=255) tttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcggc < 2:6989934/93‑1 (MQ=255) tttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcggc > 2:786858/1‑93 (MQ=255) tttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcggc < 1:1653817/93‑1 (MQ=255) ttAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcggcg < 2:4290782/93‑1 (MQ=255) tAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACcggcgg < 2:1710085/93‑1 (MQ=255) aaCGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGt > 1:201507/1‑93 (MQ=255) aaCGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGt < 1:2437877/93‑1 (MQ=255) aCGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTa < 2:5609384/93‑1 (MQ=255) cGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTAc < 1:5110951/93‑1 (MQ=255) cGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTAc < 1:4536749/93‑1 (MQ=255) ggCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACg > 1:5640686/1‑93 (MQ=255) gCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGc > 2:4729112/1‑93 (MQ=255) ccTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCt > 1:2568953/1‑93 (MQ=255) cTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTg > 2:4534785/1‑93 (MQ=255) cTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTg > 1:886171/1‑93 (MQ=255) cTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTg < 1:6232042/93‑1 (MQ=255) tAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTgg > 2:3267077/1‑93 (MQ=255) tAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTgg < 2:831762/93‑1 (MQ=255) tAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTgg > 1:1147987/1‑93 (MQ=255) tAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTgg > 1:3522139/1‑93 (MQ=255) aCCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGaa < 2:5120552/93‑1 (MQ=255) aCCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGaa > 1:3611790/1‑93 (MQ=255) cccATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAAc > 1:742238/1‑93 (MQ=255) cccATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAAc < 2:1666854/93‑1 (MQ=255) gCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGtgtg < 2:2519714/93‑1 (MQ=255) ccGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGAt > 1:818570/1‑93 (MQ=255) cGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATg < 2:3446320/93‑1 (MQ=255) cGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATg < 1:4232537/93‑1 (MQ=255) gCCCGGTGGTCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATgg < 1:6788343/93‑1 (MQ=255) ggtggtCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCt > 2:6508869/1‑93 (MQ=255) gtggtCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTg < 1:1438893/93‑1 (MQ=255) gtggtCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTg > 2:6317700/1‑93 (MQ=255) ggtCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGc < 1:2952342/93‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGccc > 2:6767369/1‑93 (MQ=255) ccTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGcccc > 2:7324896/1‑93 (MQ=255) ccTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGcccc < 2:3279825/93‑1 (MQ=255) cTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCg > 2:4188192/1‑93 (MQ=255) cTCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCg > 2:2960890/1‑93 (MQ=255) tCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGc > 1:4569397/1‑93 (MQ=255) tCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGc > 1:4396307/1‑93 (MQ=255) tCGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGc > 2:2601657/1‑93 (MQ=255) cGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCt < 1:633621/93‑1 (MQ=255) cGGCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCt < 1:7175535/93‑1 (MQ=255) ggCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTg < 2:6010185/93‑1 (MQ=255) gCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTgg > 1:3322423/1‑93 (MQ=255) gCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTgg > 2:4065487/1‑93 (MQ=255) gCCCGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTgg > 2:3749490/1‑93 (MQ=255) cccGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTggc > 1:1688205/1‑93 (MQ=255) ccGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTgggg > 1:7287762/1‑91 (MQ=255) ccGCTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTggcg > 2:2861829/1‑93 (MQ=255) gTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTggcggg < 2:6242529/93‑1 (MQ=255) | AGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCTGCATACCGGAATTTTAACCGGCGGTACGCTGGAACTGGTGTGGATGGGGCTGGCCCCGCTGGCGGG > NC_000913/3278361‑3278544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |