| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,522,256 | G→C | G591A (GGC→GCC) | mrcA → | penicillin‑binding protein 1A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,522,256 | 0 | G | C | 83.5% | 847.6 / 146.2 | 309 | G591A (GGC→GCC) | mrcA | penicillin‑binding protein 1A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (17/34); new base C (108/150); total (125/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.02e-01 | |||||||||||
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
ACAAAACATTGTCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAGCCTGCCCG > NC_000913/3522164‑3522347 | aaaCATTGTCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAAcgccgg > 1:3918476/1‑93 (MQ=255) aaCATTGTCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACgccggc > 1:1366613/1‑93 (MQ=255) cATTGTCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCtt < 1:7358822/93‑1 (MQ=255) ttGTCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGACTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTcc < 1:6391889/93‑1 (MQ=255) tGTCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCt < 2:206282/93‑1 (MQ=255) tGTCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCt < 2:6257222/93‑1 (MQ=255) tCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCtgg < 2:7003286/93‑1 (MQ=255) cacaCCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCtggtg < 1:5923564/93‑1 (MQ=255) cacCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGa < 2:443832/93‑1 (MQ=255) cacCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGa > 2:6501671/1‑93 (MQ=255) cacCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGa < 2:1088376/93‑1 (MQ=255) cacCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGa > 2:3266546/1‑93 (MQ=255) acCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGAc < 2:6607607/93‑1 (MQ=255) ccGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGAcc < 1:2816134/93‑1 (MQ=255) cGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGAccc > 1:656189/1‑93 (MQ=255) cGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGAccc < 1:3248847/93‑1 (MQ=255) cGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGAccc < 2:5417743/93‑1 (MQ=255) aaTCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGt < 1:4634887/93‑1 (MQ=255) aaTCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGt > 1:6812051/1‑93 (MQ=255) aaTCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGt > 2:5047086/1‑93 (MQ=255) aTCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTg < 1:1045969/93‑1 (MQ=255) aTCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTg < 1:2547469/93‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTgg > 1:2716077/1‑93 (MQ=255) gctggcgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGtt < 1:3696358/93‑1 (MQ=255) ctggcgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGttt < 2:6432148/93‑1 (MQ=255) tggcgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTa < 1:2275591/93‑1 (MQ=255) gcgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATc < 2:1306165/93‑1 (MQ=255) gcgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATc > 2:2234066/1‑93 (MQ=255) gcgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATc < 2:231533/93‑1 (MQ=255) gcgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATc < 2:3552069/93‑1 (MQ=255) cgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCa < 1:5442628/93‑1 (MQ=255) cgctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCa < 1:1326624/93‑1 (MQ=255) gctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAg > 1:1964850/1‑93 (MQ=255) ctggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGc > 2:73412/1‑93 (MQ=255) tggGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCa < 1:6027808/93‑1 (MQ=255) ggTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCaaa > 1:6055162/1‑93 (MQ=255) gTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCaaaa < 1:29350/93‑1 (MQ=255) ttCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAAt < 1:5696363/93‑1 (MQ=255) ttCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAAt < 1:5494634/93‑1 (MQ=255) ttCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAAt > 1:5626008/1‑93 (MQ=255) aGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGa > 1:2158325/1‑93 (MQ=255) aGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGa < 2:2397451/93‑1 (MQ=255) gCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGaa < 1:5383855/93‑1 (MQ=255) gCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGaa > 1:5256900/1‑93 (MQ=255) cGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGaaa < 1:4081914/93‑1 (MQ=255) gTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGaaaa < 2:5139323/93‑1 (MQ=255) tCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAAc < 1:4259310/93‑1 (MQ=255) tCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAAc < 2:1133964/93‑1 (MQ=255) ttCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGAt > 1:5045223/1‑93 (MQ=255) tCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATc < 2:528200/93‑1 (MQ=255) cACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCa < 2:6720346/93‑1 (MQ=255) aCCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAg > 2:3725706/1‑93 (MQ=255) ccccAACGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAgg < 2:4340629/93‑1 (MQ=255) cccAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAggg < 1:6654862/93‑1 (MQ=255) ccAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggc > 1:4913826/1‑93 (MQ=255) ccAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggc > 2:1781087/1‑93 (MQ=255) cAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggcg < 2:802277/93‑1 (MQ=255) cAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggcg > 2:1665662/1‑93 (MQ=255) cAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggcg < 1:1248992/93‑1 (MQ=255) cAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggcg < 1:1636757/93‑1 (MQ=255) aaTGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggcgg > 2:4647261/1‑93 (MQ=255) aaTGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggcgg > 2:6032790/1‑93 (MQ=255) aTGCAGATGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGggcggc > 2:2684351/1‑93 (MQ=255) tGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGgcggcg > 2:2132197/1‑93 (MQ=255) gCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGt < 1:2973123/93‑1 (MQ=255) cAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGGaagcc > 2:3947169/1‑68 (MQ=255) cAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGGaagcc < 1:3947169/71‑4 (MQ=255) cAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTg < 1:2448362/93‑1 (MQ=255) aGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGa < 2:707902/93‑1 (MQ=255) tGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGAttt > 2:3224256/1‑93 (MQ=255) ggCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGAtttt < 2:4521362/93‑1 (MQ=255) cgcgGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGaa < 2:7154817/93‑1 (MQ=255) cgcgGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGaa < 1:1572756/93‑1 (MQ=255) cgGCTACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGc < 1:6965577/93‑1 (MQ=255) ggCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCg > 2:520165/1‑93 (MQ=255) tACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGaaa > 2:4915894/1‑93 (MQ=255) tACGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGaaa > 2:5582629/1‑93 (MQ=255) aCGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAAc < 2:1900968/93‑1 (MQ=255) aCGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAAc < 1:2663404/93‑1 (MQ=255) aCGCGGTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAAc < 1:7089167/93‑1 (MQ=255) cgcgGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAAcc < 1:843032/93‑1 (MQ=255) ggTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGaa < 2:7314034/93‑1 (MQ=255) gTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGaaa < 2:1459306/93‑1 (MQ=255) gTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGaaa < 1:3644413/93‑1 (MQ=255) gTCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGaaa > 2:467996/1‑93 (MQ=255) tCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAg < 2:7468557/93‑1 (MQ=255) tCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAg > 2:4214341/1‑93 (MQ=255) tCATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAg > 1:4006508/1‑93 (MQ=255) cATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGt < 2:4814768/93‑1 (MQ=255) cATGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGt < 2:2451507/93‑1 (MQ=255) aTGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTa < 1:2323047/93‑1 (MQ=255) aTGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTa < 1:5789629/93‑1 (MQ=255) tGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAg > 2:5877201/1‑93 (MQ=255) tGGCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAg < 2:7526430/93‑1 (MQ=255) nncGACCGCCGGCTTCCTGGTGG‑CCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAGcc < 1:2235296/91‑1 (MQ=255) gCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAGcc < 1:4861132/93‑1 (MQ=255) gCGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAGcc < 2:5750736/93‑1 (MQ=255) cGAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAGCCt < 2:2975499/93‑1 (MQ=255) gAACGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAGCCTg > 2:6824585/1‑93 (MQ=255) aCGCCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAGCCTGcc < 1:4456201/93‑1 (MQ=255) | ACAAAACATTGTCCACACCGAATCGCTGGCGCTGGGTTCAGCGTCCTTCACCCCAATGCAGGTGGCGCGCGGCTACGCGGTCATGGCGAACGGCGGCTTCCTGGTGGACCCGTGGTTTATCAGCAAAATTGAAAACGATCAGGGCGGCGTGATTTTCGAAGCGAAACCGAAAGTAGCCTGCCCG > NC_000913/3522164‑3522347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |