Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,667,169 | T→C | intergenic (‑351/‑53) | yhjA ← / → treF | putative cytochrome C peroxidase/cytoplasmic trehalase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,667,169 | 0 | T | C | 84.6% | 591.8 / 98.2 | 260 | intergenic (‑351/‑53) | yhjA/treF | putative cytochrome C peroxidase/cytoplasmic trehalase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (19/21); new base C (105/115); total (124/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.39e-01 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
AATTCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAGAC > NC_000913/3667077‑3667257 | aaTTCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACt < 1:3099345/93‑1 (MQ=255) aTTCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTa < 1:2684901/93‑1 (MQ=255) ttCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTAc > 2:5937672/1‑93 (MQ=255) tCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGaccacc > 1:4211820/1‑93 (MQ=255) ccATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCAccc > 2:6393573/1‑93 (MQ=255) ccATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCAccc < 2:2546306/93‑1 (MQ=255) cATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCt > 2:4708990/1‑93 (MQ=255) aTTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCtt > 1:446390/1‑93 (MQ=255) ttGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTa > 2:3715630/1‑93 (MQ=255) tGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTaa < 1:2138215/93‑1 (MQ=255) tGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTaa < 1:3639793/93‑1 (MQ=255) gATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTaaa < 1:6423107/93‑1 (MQ=255) gATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTaaa < 1:633692/93‑1 (MQ=255) atatTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAg < 1:4134126/93‑1 (MQ=255) atatTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAg < 1:1386709/93‑1 (MQ=255) tatTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGa > 1:5408021/1‑93 (MQ=255) tAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGaaaa < 1:277974/93‑1 (MQ=255) tAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGaaaa < 2:6468662/93‑1 (MQ=255) tGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGcc > 1:6643497/1‑93 (MQ=255) tGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGcc > 2:5368539/1‑93 (MQ=255) gCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCg > 2:664491/1‑93 (MQ=255) cGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGa > 1:1608570/1‑93 (MQ=255) ttATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATa > 1:3018343/1‑93 (MQ=255) ttATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATa > 2:1087541/1‑93 (MQ=255) tataTTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATaa > 2:5801935/1‑93 (MQ=255) tataTTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATaa > 2:4820281/1‑93 (MQ=255) ttttttGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGGGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAg > 1:4934121/1‑93 (MQ=255) ttttttGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAg > 2:3950324/1‑93 (MQ=255) ttttttGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAg > 2:2657351/1‑93 (MQ=255) tttttGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGc < 2:4146406/93‑1 (MQ=255) tttGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGcga < 1:3776107/93‑1 (MQ=255) gACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGcgacga < 1:7209243/93‑1 (MQ=255) gACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGcgacga > 2:736441/1‑93 (MQ=255) aCAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGaa < 1:32867/93‑1 (MQ=255) aGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAAtt > 2:5259524/1‑93 (MQ=255) gTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTc > 1:6945381/1‑93 (MQ=255) ttAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCg < 1:5865454/93‑1 (MQ=255) aataaACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGa > 2:708821/1‑93 (MQ=255) aataaACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGa > 2:7149515/1‑93 (MQ=255) ataaACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAg < 2:4059021/93‑1 (MQ=255) ataaACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAg < 2:4229361/93‑1 (MQ=255) ataaACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGCCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAg < 2:1504936/93‑1 (MQ=255) aaCGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGtt > 2:6094229/1‑93 (MQ=255) aCGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTg > 2:6278230/1‑93 (MQ=255) cGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTgg < 1:4710632/93‑1 (MQ=255) cGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTgg < 1:1044913/93‑1 (MQ=255) gTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGa < 2:3431394/93‑1 (MQ=255) tGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGAt < 2:1332004/93‑1 (MQ=255) aTCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATcc > 1:857397/1‑93 (MQ=255) aTCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATcc < 1:6127663/93‑1 (MQ=255) tCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCt > 1:7203232/1‑93 (MQ=255) tCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCt > 1:3357849/1‑93 (MQ=255) tCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCt < 2:1823874/93‑1 (MQ=255) ccACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCtt < 1:2738583/93‑1 (MQ=255) cACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTa < 1:1003755/93‑1 (MQ=255) cACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTa < 1:3591051/93‑1 (MQ=255) cACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTa > 1:5663922/1‑93 (MQ=255) aCCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTAt > 1:3962660/1‑93 (MQ=255) aCCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTAt < 2:1911178/93‑1 (MQ=255) cGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGc > 2:1747321/1‑93 (MQ=255) cGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGc > 1:17720/1‑93 (MQ=255) cGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGc < 2:7475387/93‑1 (MQ=255) cGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGc > 1:3849703/1‑93 (MQ=255) cGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGc < 2:4013424/93‑1 (MQ=255) cACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTc > 1:6484026/1‑93 (MQ=255) cACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTc > 2:2320373/1‑93 (MQ=255) cACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTc < 1:658503/93‑1 (MQ=255) aCGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCa > 2:3213570/1‑93 (MQ=255) aCGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCa > 1:531460/1‑93 (MQ=255) cGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCaa < 2:4532942/93‑1 (MQ=255) cTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATc > 1:3370749/1‑93 (MQ=255) cTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATc > 2:4656347/1‑93 (MQ=255) cTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATc > 1:4616520/1‑93 (MQ=255) tttGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCa > 1:5498877/1‑93 (MQ=255) tttGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCa < 1:6689535/93‑1 (MQ=255) tGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGa < 1:1433363/93‑1 (MQ=255) gTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGaa > 2:1562868/1‑93 (MQ=255) cGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGaaaa < 2:3047798/93‑1 (MQ=255) cGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGaaaa < 2:6606538/93‑1 (MQ=255) gCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAAt < 2:768083/93‑1 (MQ=255) ccaccaGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTc < 2:5137111/93‑1 (MQ=255) caccaGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCa < 1:5614986/93‑1 (MQ=255) caccaGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCa > 2:6676584/1‑93 (MQ=255) accaGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCaa > 2:7310300/1‑93 (MQ=255) caGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCaaaa < 2:5620048/93‑1 (MQ=255) caGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCaaaa < 1:2488415/93‑1 (MQ=255) caGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCaaaa < 2:4883798/93‑1 (MQ=255) caGGCGGAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCaaaa < 2:5036885/93‑1 (MQ=255) gCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAAccc < 2:5303067/93‑1 (MQ=255) ggAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTa < 2:5438748/93‑1 (MQ=255) gAGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTaa > 2:2944041/1‑93 (MQ=255) aGCGAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAAt > 2:1044469/1‑93 (MQ=255) gAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCa > 1:5991089/1‑93 (MQ=255) gAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCa > 1:3491823/1‑93 (MQ=255) gAATGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCa < 1:4353198/93‑1 (MQ=255) aaTGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAg > 1:3253112/1‑93 (MQ=255) aaTGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAg > 1:5774285/1‑93 (MQ=255) tGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAGAc < 1:2502350/93‑1 (MQ=255) tGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAGAc > 1:1850168/1‑93 (MQ=255) tGACCACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAGAc > 2:4419227/1‑93 (MQ=255) | AATTCCATTGATATTAGTGCGTTATATTTTTTGACAGGTTAATAAACGTGATCCACCGCACGCTTTGTCGCCCACCAGGCGGAGCGAATGACTACCCTTAAAGAAAAGCCGATAATTAGCGACGAATTTCGGAGGTTGGATCCTTATGCTCAATCAGAAAATTCAAAACCCTAATCCAGAC > NC_000913/3667077‑3667257 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |