Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,741,875 G→A intergenic (+36/‑82) yiaL → / → yiaM putative lipase/hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,741,8750GA83.3% 605.2 / 86.2 233intergenic (+36/‑82)yiaL/yiaMputative lipase/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (17/22);  new base A (91/103);  total (108/125)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.28e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01

Only 100 of 240 total aligned reads displayed.

ACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAA  >  NC_000913/3741783‑3741965
                                                                                            |                                                                                          
aCAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATg                                                                                            <  2:5353729/93‑1 (MQ=255)
  aGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAGTTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGtt                                                                                          >  2:1156221/1‑93 (MQ=255)
  aGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATAtt                                                                                          >  2:5213208/1‑93 (MQ=255)
   gCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTa                                                                                         <  1:5747608/93‑1 (MQ=255)
    ccTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAAtattat                                                                                        >  2:3190169/1‑93 (MQ=255)
     ctctGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATattatt                                                                                       >  1:7099036/1‑93 (MQ=255)
     ctctGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATattatt                                                                                       >  1:1873914/1‑93 (MQ=255)
     ctctGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTAtt                                                                                       <  2:6313329/93‑1 (MQ=255)
      tctGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGNNNNNATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTg                                                                                      >  2:2501758/1‑93 (MQ=255)
      tctGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTg                                                                                      >  2:2404109/1‑93 (MQ=255)
       ctGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGc                                                                                     <  1:3963126/93‑1 (MQ=255)
        tGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGct                                                                                    <  1:2271514/93‑1 (MQ=255)
         gagaTACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGctc                                                                                   <  2:5556845/93‑1 (MQ=255)
          agaTACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGctct                                                                                  <  2:4887161/93‑1 (MQ=255)
           gaTACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTa                                                                                 >  1:4973850/1‑93 (MQ=255)
            aTACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTaa                                                                                <  1:4092085/93‑1 (MQ=255)
             tACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAAc                                                                               >  1:7031870/1‑93 (MQ=255)
              aCGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACt                                                                              <  2:2678856/93‑1 (MQ=255)
                gAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACtat                                                                            <  2:3959993/93‑1 (MQ=255)
                gAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACtat                                                                            >  2:4519670/1‑93 (MQ=255)
                 aaaaaTTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACtata                                                                           <  1:4820638/93‑1 (MQ=255)
                  aaaaTTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTatat                                                                          >  1:1170866/1‑93 (MQ=255)
                   aaaTTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATAtt                                                                         <  2:3675707/93‑1 (MQ=255)
                   aaaTTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATAtt                                                                         <  1:1015315/93‑1 (MQ=255)
                   aaaTTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATAtt                                                                         <  1:2364155/93‑1 (MQ=255)
                    aaTTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATta                                                                        >  2:3128032/1‑93 (MQ=255)
                     aTTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATtaa                                                                       <  1:1594509/93‑1 (MQ=255)
                     aTTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCAAACTATATtaa                                                                       >  2:4365452/1‑93 (MQ=255)
                      ttGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATtaat                                                                      >  1:3841973/1‑93 (MQ=255)
                      ttGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATtaat                                                                      <  2:6068596/93‑1 (MQ=255)
                       tgtgGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATtaata                                                                     >  2:1615058/1‑93 (MQ=255)
                           gTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTc                                                                 >  2:4803604/1‑93 (MQ=255)
                            ttAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCa                                                                <  2:12659/93‑1 (MQ=255)
                            ttAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCa                                                                <  1:6771841/93‑1 (MQ=255)
                            ttAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCa                                                                <  2:2996078/93‑1 (MQ=255)
                            ttAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCa                                                                <  1:2552001/93‑1 (MQ=255)
                              aaaGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAgg                                                              >  2:2960091/1‑93 (MQ=255)
                              aaaGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAgg                                                              <  1:2295504/93‑1 (MQ=255)
                              aaaGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAgg                                                              <  1:1761110/93‑1 (MQ=255)
                               aaGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGt                                                             >  1:539559/1‑93 (MQ=255)
                               aaGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGt                                                             <  1:7187133/93‑1 (MQ=255)
                                aGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCGGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGtt                                                            <  1:5537198/93‑1 (MQ=255)
                                  tCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTtgc                                                          <  2:1337739/93‑1 (MQ=255)
                                   cGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTtgct                                                         <  1:4133101/93‑1 (MQ=255)
                                    gCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTtgctg                                                        >  1:4490770/1‑93 (MQ=255)
                                    gCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTtgctg                                                        >  1:853018/1‑93 (MQ=255)
                                      aTTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGca                                                      >  1:5192730/1‑93 (MQ=255)
                                      aTTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGca                                                      <  2:6788319/93‑1 (MQ=255)
                                       ttAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGcac                                                     >  2:6750230/1‑93 (MQ=255)
                                         aaCGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACAt                                                   >  2:6388564/1‑93 (MQ=255)
                                         aaCGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACAt                                                   <  1:2774672/93‑1 (MQ=255)
                                         aaCGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACAt                                                   <  1:3127840/93‑1 (MQ=255)
                                         aaCGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACAt                                                   <  2:4223672/93‑1 (MQ=255)
                                           cGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTTTTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGc                                                 <  1:1105249/93‑1 (MQ=255)
                                            ggCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCg                                                <  1:6745239/93‑1 (MQ=255)
                                               gcTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACt                                             >  2:7149603/1‑93 (MQ=255)
                                                cTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACtt                                            >  2:1770737/1‑93 (MQ=255)
                                                 tGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTg                                           >  1:7399452/1‑93 (MQ=255)
                                                  gAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGa                                          <  1:4387347/93‑1 (MQ=255)
                                                    aTTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCTTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAAt                                        >  2:6198379/1‑93 (MQ=255)
                                                    aTTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAAt                                        <  1:3739722/93‑1 (MQ=255)
                                                    aTTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAAt                                        >  1:6616564/1‑93 (MQ=255)
                                                    aTTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAAt                                        <  2:3066050/93‑1 (MQ=255)
                                                     ttAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAAtt                                       <  1:5410535/93‑1 (MQ=255)
                                                      tAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTa                                      <  2:2107188/93‑1 (MQ=255)
                                                        aTCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATg                                    >  1:6505023/1‑93 (MQ=255)
                                                          cGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgac                                  <  2:509871/93‑1 (MQ=255)
                                                           gAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgaca                                 >  1:286921/1‑93 (MQ=255)
                                                            aataatCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgacag                                >  1:7463649/1‑93 (MQ=255)
                                                             ataatCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgacaga                               <  1:4028618/93‑1 (MQ=255)
                                                              taatCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgacagac                              >  2:3721785/1‑93 (MQ=255)
                                                              taatCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgacagac                              >  1:619426/1‑93 (MQ=255)
                                                               aatCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgacagaca                             >  1:6008239/1‑93 (MQ=255)
                                                               aatCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgacagaca                             <  1:4658712/93‑1 (MQ=255)
                                                               aatCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATgacagaca                             >  2:7192391/1‑93 (MQ=255)
                                                                  cGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAg                          <  2:213152/93‑1 (MQ=255)
                                                                   gTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGc                         >  2:2347526/1‑93 (MQ=255)
                                                                   gTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGc                         >  2:3273131/1‑93 (MQ=255)
                                                                      tACGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTc                      <  2:5625197/93‑1 (MQ=255)
                                                                        cGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCaa                    <  1:1306537/93‑1 (MQ=255)
                                                                        cGCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCaa                    <  1:6454159/93‑1 (MQ=255)
                                                                         gCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAg                   >  1:1997742/1‑93 (MQ=255)
                                                                         gCCAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAg                   <  2:7463649/93‑1 (MQ=255)
                                                                          ccAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAgg                  <  2:6684271/93‑1 (MQ=255)
                                                                          ccAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAgg                  >  1:5706803/1‑93 (MQ=255)
                                                                           cAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGa                 >  1:2213267/1‑93 (MQ=255)
                                                                           cAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGa                 <  1:905702/93‑1 (MQ=255)
                                                                           cAGAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGa                 >  2:6443797/1‑93 (MQ=255)
                                                                             gAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAAt               <  1:2064958/93‑1 (MQ=255)
                                                                             gAACGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAAt               <  1:5320029/93‑1 (MQ=255)
                                                                              aaCGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATa              <  2:3888172/93‑1 (MQ=255)
                                                                              aaCGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATa              <  2:1789677/93‑1 (MQ=255)
                                                                                cGCCTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGc            >  2:7390288/1‑93 (MQ=255)
                                                                                   cTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTAt         <  2:5691799/93‑1 (MQ=255)
                                                                                   cTGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTAt         <  2:5282906/93‑1 (MQ=255)
                                                                                    tGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATg        >  1:5602028/1‑93 (MQ=255)
                                                                                    tGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATg        <  2:3733404/93‑1 (MQ=255)
                                                                                    tGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATg        >  1:6148963/1‑93 (MQ=255)
                                                                                    tGGGTAATATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATg        <  2:5054560/93‑1 (MQ=255)
                                                                                         aaTATTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGaaaaa   >  1:2567139/1‑93 (MQ=255)
                                                                                            |                                                                                          
ACAGCCTCTGAGATACGAAAAATTGTGGTTAAAGTCGCATTAACGGCGCTGAATTAATCGAATAATCGTCTACGCCAGAACGCCTGGGTAATGTTATTGCTCTAACTATATTAATAATTCAGGTTGCTGCACATGCGACTTGAATTATGACAGACATAGCCTCAAGGAATAGCTATGAAAAAA  >  NC_000913/3741783‑3741965

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: